20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1334 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1334  hypothetical protein  100 
 
 
157 aa  320  6e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.205283  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1327  hypothetical protein  81.7 
 
 
244 aa  222  2e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1995  hypothetical protein  37.91 
 
 
249 aa  98.6  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1148  hypothetical protein  40.5 
 
 
254 aa  81.6  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.384851  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2037  hypothetical protein  30.56 
 
 
270 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000173054  normal  0.0917683 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4396  hypothetical protein  33.87 
 
 
274 aa  60.8  0.000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1954  hypothetical protein  35.07 
 
 
260 aa  60.8  0.000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0150  hypothetical protein  33.79 
 
 
251 aa  60.5  0.000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1204  hypothetical protein  31.01 
 
 
269 aa  60.8  0.000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2503  hypothetical protein  42.05 
 
 
258 aa  57.4  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.960499 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01314  hypothetical protein  31.47 
 
 
287 aa  56.6  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0524  hypothetical protein  33.78 
 
 
256 aa  55.5  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.149982  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1524  hypothetical protein  32.45 
 
 
282 aa  55.5  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.377988  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0525  hypothetical protein  31.33 
 
 
272 aa  54.7  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1996  hypothetical protein  37.78 
 
 
311 aa  54.7  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01886  Uvs051  30.47 
 
 
298 aa  50.8  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0365  hypothetical protein  36.78 
 
 
273 aa  50.4  0.000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.637133  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3220  hypothetical protein  31.86 
 
 
241 aa  48.5  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2038  hypothetical protein  28.33 
 
 
233 aa  44.3  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0958338  normal  0.0449216 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1620  hypothetical protein  27.46 
 
 
246 aa  43.9  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>