122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1892 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_1892  putative hemolysin  100 
 
 
251 aa  508  1e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.185839  normal  0.463503 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0919  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  63.86 
 
 
258 aa  317  9e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.748961  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1276  putative hemolysin  65.96 
 
 
250 aa  311  5.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.246959  normal  0.175299 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2618  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  65.53 
 
 
250 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0762147  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1707  putative acyl-CoA N-acyltransferases (Nat) superfamily protein  62.08 
 
 
266 aa  291  5e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.189579  normal  0.0574374 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1906  putative hemolysin-like protein  63.4 
 
 
250 aa  290  1e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.748822 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1789  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  57.32 
 
 
258 aa  272  3e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.327684 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1208  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  34.07 
 
 
253 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.32888  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1049  putative hemolysin  35.54 
 
 
277 aa  125  5e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2102  hypothetical protein  36.53 
 
 
281 aa  124  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2736  putative hemolysin  34.89 
 
 
271 aa  122  8e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0699  hypothetical protein  32.78 
 
 
315 aa  121  8e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2436  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  32.33 
 
 
258 aa  121  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00586603 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3934  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  33.05 
 
 
250 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.638634  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3452  hypothetical protein  34.51 
 
 
255 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.320745  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3768  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  32 
 
 
266 aa  118  7e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0469  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  34.68 
 
 
249 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00940053  normal  0.968751 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1472  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.05 
 
 
258 aa  117  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.031802  normal  0.0574374 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3519  hypothetical protein  33.63 
 
 
261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.339526  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2028  hypothetical protein  31.02 
 
 
282 aa  116  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.131913  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3826  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  33.63 
 
 
261 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3807  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.51 
 
 
261 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.395823  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2305  hypothetical protein  31.43 
 
 
286 aa  114  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.050145  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3597  hypothetical protein  29.8 
 
 
341 aa  114  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.485263  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4506  hypothetical protein  30.04 
 
 
259 aa  113  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1335  putative hemolysin-like protein  33.95 
 
 
270 aa  113  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1588  putative hemolysin-like protein  28.98 
 
 
307 aa  113  4.0000000000000004e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1287  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  33.05 
 
 
251 aa  112  6e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0944  Putative hemolysin-like protein  28.92 
 
 
288 aa  112  6e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000783609  normal  0.05177 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2621  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  31.4 
 
 
265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0630357  normal  0.540771 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0924  hypothetical protein  31.58 
 
 
251 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2243  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  29.48 
 
 
294 aa  107  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.782779 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0963  hypothetical protein  31.58 
 
 
251 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.07893 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2849  hypothetical protein  30.38 
 
 
270 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.890159  normal  0.909838 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1479  ornithine-acyl(acyl carrier protein) N-acyltransferase  30.52 
 
 
278 aa  107  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2886  putative hemolysin-like protein  30.9 
 
 
265 aa  107  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.801461  normal  0.222823 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0990  hypothetical protein  33.03 
 
 
251 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00020068 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2379  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  30.12 
 
 
278 aa  106  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.633832  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0891  hypothetical protein  29.11 
 
 
271 aa  106  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0879726 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2103  hypothetical protein  33.04 
 
 
287 aa  105  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4208  hypothetical protein  30.68 
 
 
330 aa  106  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.159321 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4721  hypothetical protein  30.4 
 
 
332 aa  105  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.325273  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4464  hypothetical protein  31.14 
 
 
251 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.552016  normal  0.0135664 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1275  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  29.54 
 
 
270 aa  105  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.599594  normal  0.201087 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0314  hypothetical protein  27.76 
 
 
321 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0333  putative hemolysin-like protein  29.37 
 
 
384 aa  104  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.515717  normal  0.703122 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1116  hypothetical protein  31.33 
 
 
332 aa  105  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.719302 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1654  hypothetical protein  32.37 
 
 
304 aa  104  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.816423 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56560  hypothetical protein  31.56 
 
 
251 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.492473  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2581  hypothetical protein  31.96 
 
 
279 aa  103  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00571368 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37760  hypothetical protein  31.67 
 
 
252 aa  103  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4926  hypothetical protein  31.45 
 
 
332 aa  103  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.263605 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4880  hypothetical protein  30.65 
 
 
332 aa  102  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.055868  normal  0.748823 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0325  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  34.42 
 
 
283 aa  102  5e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0746411  normal  0.0207105 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0050  hypothetical protein  28.69 
 
 
291 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0035  hypothetical protein  29.41 
 
 
291 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.227098 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3681  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  30.17 
 
 
292 aa  102  7e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4454  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  31.13 
 
 
268 aa  101  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0859563  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1196  putative hemolysin-like protein  30.52 
 
 
268 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0329892  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1311  putative hemolysin-like protein  30.52 
 
 
268 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.309532  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0369  hypothetical protein  32.39 
 
 
285 aa  101  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.548265 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1126  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  31.36 
 
 
243 aa  101  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.968432 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1221  putative hemolysin-like protein  30.52 
 
 
268 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1900  hypothetical protein  32.13 
 
 
271 aa  101  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4353  hypothetical protein  30.49 
 
 
251 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4048  hypothetical protein  30.49 
 
 
251 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0408  hypothetical protein  26.12 
 
 
337 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4921  hypothetical protein  31.02 
 
 
251 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.880265  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4417  hypothetical protein  29.84 
 
 
332 aa  100  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.704988  normal  0.744356 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1293  putative hemolysin-like protein  31.13 
 
 
268 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.418328  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2176  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  27.16 
 
 
283 aa  100  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.525625 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0318  putative hemolysin  27.94 
 
 
316 aa  99  6e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.361608  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0726  hypothetical protein  29.74 
 
 
258 aa  98.6  9e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1997  putative hemolysin-like protein  30.23 
 
 
268 aa  98.6  9e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.351889  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0874  conserved hypothetical protein, predicted autoinducer synthesis protein family  29.74 
 
 
258 aa  98.6  9e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.936705  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0059  hypothetical protein  28.57 
 
 
258 aa  98.2  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6049  ornithine-acyl(acyl carrier protein) N- acyltransferase  29.91 
 
 
256 aa  98.2  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3632  hypothetical protein  27.76 
 
 
305 aa  98.2  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.135191 
 
 
-
 
NC_004310  BR0148  hypothetical protein  28.4 
 
 
281 aa  97.4  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1873  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  31.96 
 
 
277 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.447204  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1919  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  31.96 
 
 
277 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0456889  normal  0.658773 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1853  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  31.96 
 
 
277 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313144  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4257  hypothetical protein  31.28 
 
 
283 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0797  hypothetical protein  31.28 
 
 
272 aa  96.7  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.874102  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2757  hypothetical protein  28.94 
 
 
338 aa  96.7  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00398439  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1503  hypothetical protein  31.28 
 
 
272 aa  96.7  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.176854  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1533  hypothetical protein  31.28 
 
 
272 aa  96.7  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0160  hypothetical protein  28.4 
 
 
297 aa  97.1  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1704  hypothetical protein  31.28 
 
 
301 aa  96.3  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.372177  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1310  hypothetical protein  31.28 
 
 
250 aa  96.3  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0560  hypothetical protein  31.28 
 
 
250 aa  96.3  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0592  hypothetical protein  31.28 
 
 
250 aa  96.3  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.12334  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4066  hypothetical protein  30.38 
 
 
256 aa  95.9  6e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.311734  normal  0.0821052 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0143  hypothetical protein  27.98 
 
 
297 aa  95.5  7e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2912  hypothetical protein  32.72 
 
 
267 aa  94  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2158  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  27.39 
 
 
281 aa  93.2  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0418  hypothetical protein  28.27 
 
 
291 aa  93.6  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0028  hypothetical protein  28.57 
 
 
296 aa  93.2  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000147407 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1121  hypothetical protein  31.25 
 
 
249 aa  92  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.335572 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0412  hypothetical protein  24.9 
 
 
337 aa  92  8e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.666795 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>