108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2331 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2175  autoinducer synthesis protein  100 
 
 		 212 aa  437  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.533935 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2331  autoinducer synthesis protein  100 
 
 		 212 aa  437  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.933975  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3320  autoinducer synthesis protein  75 
 
 		 210 aa  323  1e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0626  autoinducer synthesis protein  64.71 
 
 		 210 aa  293  2e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0959  autoinducer synthesis protein  63.24 
 
 		 210 aa  284  8e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0369652  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2312  autoinducer synthesis protein  58.5 
 
 		 200 aa  264  7e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.362295  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5461  autoinducer synthesis protein  54 
 
 		 201 aa  223  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.180751 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5763  autoinducer synthesis protein  50.5 
 
 		 207 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.124199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1765  autoinducer synthesis protein  51.76 
 
 		 201 aa  219  3e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.35237  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4513  autoinducer synthesis protein  52 
 
 		 211 aa  217  1e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5028  autoinducer synthesis protein  50 
 
 		 211 aa  217  1e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.548856 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4976  autoinducer synthesis protein  52 
 
 		 211 aa  217  1e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.283809 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4466  autoinducer synthase  43.69 
 
 		 207 aa  174  6e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7113  putative autoinducer (acylhomoserine lactone) synthase  34.76 
 
 		 227 aa  121  6e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.983538  normal  0.575549 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0322  putative autoinducer (acylhomoserine lactone) synthase  36.67 
 
 		 218 aa  121  8e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.805046  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0403  autoinducer (acylhomoserine lactone) synthase  33.84 
 
 		 218 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0701  autoinducer synthesis protein  33.67 
 
 		 208 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0417  autoinducer synthesis protein  33.02 
 
 		 218 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9666  autoinducer (acylhomoserine lactone) synthase  33.15 
 
 		 222 aa  104  8e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165621  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6377  putative autoinducer synthesis protein  31.52 
 
 		 217 aa  99  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6407  putative autoinducer synthesis protein  31.52 
 
 		 217 aa  99  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0123  autoinducer synthesis protein  29.5 
 
 		 210 aa  89.7  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1710  autoinducer synthesis protein  30 
 
 		 210 aa  89.7  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0765757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1760  autoinducer synthesis protein  29.5 
 
 		 210 aa  88.6  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2526  autoinducer synthesis protein  29.79 
 
 		 208 aa  85.9  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2974  autoinducer synthesis protein  29.9 
 
 		 223 aa  85.1  8e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.402938 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1560  autoinducer synthesis protein  29.82 
 
 		 214 aa  78.2  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.766209  normal  0.485309 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5375  putative autoinducer synthesis protein  28.95 
 
 		 206 aa  75.5  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0563585  normal  0.248437 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4020  autoinducer synthesis protein  32.03 
 
 		 193 aa  75.1  0.0000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.111702 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1889  autoinducer synthesis protein  27.75 
 
 		 214 aa  73.9  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.889914  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6053  autoinducer synthesis protein  31.28 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0965  Acyl-homoserine-lactone synthase  33.53 
 
 		 188 aa  72  0.000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.397594  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5481  putative autoinducer synthesis protein  35.88 
 
 		 208 aa  70.9  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2390  autoinducer synthesis protein  30.46 
 
 		 203 aa  70.1  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5823  autoinducer synthesis protein  30.77 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.960322  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2929  autoinducer synthesis protein  26.57 
 
 		 221 aa  69.7  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.71548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2668  autoinducer synthesis protein  26.57 
 
 		 221 aa  69.7  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.637117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0145  N-acylhomoserine lactone synthase  30.11 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0460086  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19130  autoinducer synthesis protein RhlI  27.27 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.347386  normal  0.284898 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1658  autoinducer synthetase  30.11 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0115176  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1577  autoinducer synthetase  30.11 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.24654  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1650  autoinducer synthesis protein RhlI  28.19 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0283  autoinducer synthesis protein  27.8 
 
 		 216 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.567704  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3498  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.17 
 
 		 191 aa  68.6  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.364609 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1227  N-acyl homoserine lactone synthase  29.57 
 
 		 206 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2851  autoinducer synthetase  29.79 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3811  autoinducer synthesis protein  30.6 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5808  Acyl-homoserine-lactone synthase  38.04 
 
 		 220 aa  64.7  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.167675  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1666  autoinducer synthesis protein  30.38 
 
 		 183 aa  64.7  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.852162 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1999  autoinducer synthesis protein  30.38 
 
 		 183 aa  64.7  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.556283  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5027  N-acyl-L-homoserine lactone synthetase-like protein  49.18 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.42279  normal  0.634869 
 
 
-
 
NC_003296  RS01928  autoinducer synthase  29.56 
 
 		 182 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.697337 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0259  autoinducer synthesis protein TraI (conjugation factor synthetase)  27.61 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2589  autoinducer synthesis protein  25.89 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9270  putative autoinducer synthesis protein  25.67 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8335  putative autoinducer synthesis protein  26.97 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.613519  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3286  autoinducer synthesis protein SOLI  31.76 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.498186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4275  autoinducer synthesis protein  24.12 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.722573  normal  0.550742 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1347  autoinducer synthetase family protein  32.79 
 
 		 203 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2483  N-acylhomoserine lactone synthase  32.79 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4570  putative autoinducer synthesis protein  27.75 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3641  autoinducer synthesis protein  30.99 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000011065  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4726  autoinducer synthesis protein  30.99 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455128  hitchhiker  0.006335 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0331  autoinducer synthase BpsI  32.79 
 
 		 203 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0609  autoinducer synthase BpsI  32.79 
 
 		 203 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1293  autoinducer synthase BpsI  32.79 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.133764  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1221  autoinducer synthase BpsI  32.79 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.653596  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0960  autoinducer synthase BpsI  32.79 
 
 		 203 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0098  autoinducer synthesis protein  28.17 
 
 		 205 aa  58.2  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1050  autoinducer synthesis protein  30.99 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000000830053  normal  0.1745 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3396  autoinducer synthesis protein  29.87 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3969  autoinducer synthesis protein  29.57 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163172  normal  0.0220737 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4280  autoinducer synthesis protein  30.16 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0241247  normal  0.0105559 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5574  autoinducer synthesis protein  30.99 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000539644  hitchhiker  0.00691296 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1512  N-acyl homoserine lactone synthase  31.97 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0575581  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0941  autoinducer synthesis protein  24 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0608  putative autoinducer synthesis protein  23.53 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.216873 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4437  autoinducer synthesis protein  25.15 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0804  N-acyl homoserine lactone synthase  41.25 
 
 		 268 aa  54.7  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.648666  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3111  N-acyl-L-homoserine lactone synthetase-like protein  28.65 
 
 		 249 aa  54.7  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0620  N-acyl-L-homoserine lactone synthetase-like  27.74 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0415  putative autoinducer synthesis protein  29.41 
 
 		 249 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0361  autoinducer synthesis protein  22.6 
 
 		 197 aa  53.9  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2275  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4118  autoinducer synthesis protein  29.17 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000553872  hitchhiker  0.00840845 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4583  autoinducer synthesis protein  30.41 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000141788  hitchhiker  0.0000655879 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0919  autoinducer synthesis protein  25 
 
 		 204 aa  53.1  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.142092 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0126  autoinducer synthesis protein  30.33 
 
 		 237 aa  52.4  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5196  autoinducer synthesis protein  26.9 
 
 		 201 aa  52  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.282022  normal  0.0648346 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1577  N-acyl homoserine lactone synthase  36.25 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2022  autoinducer synthetase  36.25 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2129  autoinducer synthetase BpmI  36.25 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.466862  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0700  autoinducer synthetase BpmI  36.25 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0618  N-acylhomoserine lactone synthase  36.25 
 
 		 289 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0541466  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2216  autoinducer synthetase BpmI  36.25 
 
 		 275 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0690156  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0719  N-acylhomoserine lactone synthase YtbI  21.84 
 
 		 216 aa  48.1  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0792  autoinducer synthesis protein  21.84 
 
 		 216 aa  48.1  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4429  Acyl-homoserine-lactone synthase  27.52 
 
 		 217 aa  47.4  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4148  Acyl-homoserine-lactone synthase  22.05 
 
 		 216 aa  46.6  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1621  autoinducer synthesis protein  26.19 
 
 		 226 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.672835  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3864  autoinducer synthesis protein PsyI  26.02 
 
 		 244 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.70516  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>