67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4020 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4020  autoinducer synthesis protein  100 
 
 		 193 aa  389  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.111702 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6377  putative autoinducer synthesis protein  55.62 
 
 		 217 aa  189  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6407  putative autoinducer synthesis protein  55.62 
 
 		 217 aa  189  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5763  autoinducer synthesis protein  36.97 
 
 		 207 aa  102  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.124199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0626  autoinducer synthesis protein  35.36 
 
 		 210 aa  97.4  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0959  autoinducer synthesis protein  34.18 
 
 		 210 aa  91.3  8e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0369652  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1765  autoinducer synthesis protein  36.65 
 
 		 201 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.35237  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0322  putative autoinducer (acylhomoserine lactone) synthase  36.96 
 
 		 218 aa  89.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.805046  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5461  autoinducer synthesis protein  35.98 
 
 		 201 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.180751 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2312  autoinducer synthesis protein  35.48 
 
 		 200 aa  86.3  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.362295  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4466  autoinducer synthase  50 
 
 		 207 aa  84.3  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0417  autoinducer synthesis protein  36.11 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4976  autoinducer synthesis protein  37.34 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.283809 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4513  autoinducer synthesis protein  37.34 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5028  autoinducer synthesis protein  37.34 
 
 		 211 aa  81.3  0.000000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.548856 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0403  autoinducer (acylhomoserine lactone) synthase  33.33 
 
 		 218 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3320  autoinducer synthesis protein  32.69 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2175  autoinducer synthesis protein  32.03 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.533935 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2331  autoinducer synthesis protein  32.03 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.933975  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9666  autoinducer (acylhomoserine lactone) synthase  30 
 
 		 222 aa  71.6  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165621  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7113  putative autoinducer (acylhomoserine lactone) synthase  28.48 
 
 		 227 aa  68.2  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.983538  normal  0.575549 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6053  autoinducer synthesis protein  43.75 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5823  autoinducer synthesis protein  43.75 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.960322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2589  autoinducer synthesis protein  31.58 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0804  N-acyl homoserine lactone synthase  43.1 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.648666  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0965  Acyl-homoserine-lactone synthase  39.13 
 
 		 188 aa  53.9  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.397594  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0283  autoinducer synthesis protein  27.61 
 
 		 216 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.567704  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1658  autoinducer synthetase  39.06 
 
 		 206 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0115176  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0700  autoinducer synthetase BpmI  43.1 
 
 		 202 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2129  autoinducer synthetase BpmI  43.1 
 
 		 202 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.466862  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1577  autoinducer synthetase  39.06 
 
 		 206 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.24654  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2216  autoinducer synthetase BpmI  43.1 
 
 		 275 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0690156  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2022  autoinducer synthetase  43.1 
 
 		 202 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0618  N-acylhomoserine lactone synthase  43.1 
 
 		 289 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0541466  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0415  putative autoinducer synthesis protein  39.68 
 
 		 249 aa  53.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01928  autoinducer synthase  41.33 
 
 		 182 aa  53.9  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.697337 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0361  autoinducer synthesis protein  39.44 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2275  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1577  N-acyl homoserine lactone synthase  43.1 
 
 		 202 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0145  N-acylhomoserine lactone synthase  39.06 
 
 		 206 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0460086  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1666  autoinducer synthesis protein  35.29 
 
 		 183 aa  52.4  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.852162 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1999  autoinducer synthesis protein  35.29 
 
 		 183 aa  52.4  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.556283  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1293  autoinducer synthase BpsI  37.84 
 
 		 203 aa  50.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.133764  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2483  N-acylhomoserine lactone synthase  37.84 
 
 		 203 aa  50.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1221  autoinducer synthase BpsI  37.84 
 
 		 203 aa  50.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.653596  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1347  autoinducer synthetase family protein  37.33 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0960  autoinducer synthase BpsI  37.33 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0331  autoinducer synthase BpsI  37.33 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0609  autoinducer synthase BpsI  37.33 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2974  autoinducer synthesis protein  27.56 
 
 		 223 aa  50.1  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.402938 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3286  autoinducer synthesis protein SOLI  41.18 
 
 		 204 aa  48.9  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.498186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3811  autoinducer synthesis protein  27.59 
 
 		 211 aa  48.9  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1227  N-acyl homoserine lactone synthase  35.94 
 
 		 206 aa  48.1  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0701  autoinducer synthesis protein  24.14 
 
 		 208 aa  48.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5808  Acyl-homoserine-lactone synthase  39.68 
 
 		 220 aa  47.8  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.167675  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5481  putative autoinducer synthesis protein  33.33 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3897  autoinducer synthesis protein LasI  34.78 
 
 		 201 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156305  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45940  autoinducer synthesis protein LasI  34.78 
 
 		 201 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3498  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.35 
 
 		 191 aa  46.2  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.364609 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0941  autoinducer synthesis protein  39.06 
 
 		 212 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2390  autoinducer synthesis protein  30.12 
 
 		 203 aa  45.8  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1512  N-acyl homoserine lactone synthase  35.14 
 
 		 203 aa  45.4  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0575581  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0126  autoinducer synthesis protein  36.51 
 
 		 237 aa  45.4  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4275  autoinducer synthesis protein  29.92 
 
 		 197 aa  43.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.722573  normal  0.550742 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2526  autoinducer synthesis protein  43.48 
 
 		 208 aa  43.1  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0259  autoinducer synthesis protein TraI (conjugation factor synthetase)  33.85 
 
 		 211 aa  42.7  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0608  putative autoinducer synthesis protein  33.33 
 
 		 197 aa  42.4  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.216873 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0957  autoinducer synthesis protein LuxI  25.71 
 
 		 193 aa  42.4  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.375651  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>