67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_1546 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_1656  autoinducer synthesis protein  100 
 
 		 214 aa  444  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1546  N-acylhomoserine lactone synthase YpsI  100 
 
 		 214 aa  444  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1716  N-acylhomoserine lactone synthase YpsI  99.07 
 
 		 218 aa  438  9.999999999999999e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0105822  hitchhiker  0.000229344 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4148  Acyl-homoserine-lactone synthase  54.5 
 
 		 216 aa  249  2e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0101  Acyl-homoserine-lactone synthase  55.71 
 
 		 212 aa  248  6e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4429  Acyl-homoserine-lactone synthase  50.47 
 
 		 217 aa  232  3e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0792  autoinducer synthesis protein  45.79 
 
 		 216 aa  210  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0719  N-acylhomoserine lactone synthase YtbI  45.79 
 
 		 216 aa  210  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0067  autoinducer synthesis protein  44.93 
 
 		 224 aa  205  5e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.719257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0183  N-acylhomoserine lactone synthase YtbI  46.51 
 
 		 175 aa  167  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0180575  hitchhiker  0.000000220703 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1621  autoinducer synthesis protein  33.17 
 
 		 226 aa  122  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.672835  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3864  autoinducer synthesis protein PsyI  30.95 
 
 		 244 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.70516  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9270  putative autoinducer synthesis protein  29.52 
 
 		 212 aa  92  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8335  putative autoinducer synthesis protein  31.18 
 
 		 212 aa  79.3  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.613519  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5481  putative autoinducer synthesis protein  32.24 
 
 		 208 aa  76.6  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5375  putative autoinducer synthesis protein  30.36 
 
 		 206 aa  75.5  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0563585  normal  0.248437 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0941  autoinducer synthesis protein  32.48 
 
 		 212 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1889  autoinducer synthesis protein  30.49 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.889914  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0259  autoinducer synthesis protein TraI (conjugation factor synthetase)  33.58 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3498  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.27 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.364609 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5196  autoinducer synthesis protein  28.08 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.282022  normal  0.0648346 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2029  autoinducer synthesis protein  26.24 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2851  autoinducer synthetase  25.53 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9666  autoinducer (acylhomoserine lactone) synthase  26.22 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165621  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4570  putative autoinducer synthesis protein  29.27 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3396  autoinducer synthesis protein  26.47 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1560  autoinducer synthesis protein  26.42 
 
 		 214 aa  53.9  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.766209  normal  0.485309 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4437  autoinducer synthesis protein  26.04 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4275  autoinducer synthesis protein  26.95 
 
 		 197 aa  52.8  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.722573  normal  0.550742 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2668  autoinducer synthesis protein  27.1 
 
 		 221 aa  52  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.637117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1760  autoinducer synthesis protein  25.33 
 
 		 210 aa  51.6  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0608  putative autoinducer synthesis protein  26.95 
 
 		 197 aa  51.6  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.216873 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0123  autoinducer synthesis protein  25.97 
 
 		 210 aa  51.6  0.000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2526  autoinducer synthesis protein  25.95 
 
 		 208 aa  51.6  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1710  autoinducer synthesis protein  26.76 
 
 		 210 aa  49.7  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0765757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1227  N-acyl homoserine lactone synthase  27.07 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1577  autoinducer synthetase  26.32 
 
 		 206 aa  49.3  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.24654  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1658  autoinducer synthetase  26.32 
 
 		 206 aa  49.3  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0115176  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0145  N-acylhomoserine lactone synthase  26.32 
 
 		 206 aa  49.3  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0460086  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2929  autoinducer synthesis protein  26.45 
 
 		 221 aa  49.3  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.71548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6053  autoinducer synthesis protein  23.49 
 
 		 201 aa  48.9  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3286  autoinducer synthesis protein SOLI  24.68 
 
 		 204 aa  48.9  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.498186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0322  putative autoinducer (acylhomoserine lactone) synthase  27.22 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.805046  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5823  autoinducer synthesis protein  22.82 
 
 		 201 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.960322  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01928  autoinducer synthase  28.78 
 
 		 182 aa  47  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.697337 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1347  autoinducer synthetase family protein  23.81 
 
 		 203 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2483  N-acylhomoserine lactone synthase  23.81 
 
 		 203 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0960  autoinducer synthase BpsI  23.81 
 
 		 203 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1221  autoinducer synthase BpsI  23.81 
 
 		 203 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.653596  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0701  autoinducer synthesis protein  22.92 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1293  autoinducer synthase BpsI  23.81 
 
 		 203 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.133764  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0331  autoinducer synthase BpsI  23.81 
 
 		 203 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0609  autoinducer synthase BpsI  23.81 
 
 		 203 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4152  autoinducer synthesis protein  25.13 
 
 		 211 aa  46.6  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.290737 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0098  autoinducer synthesis protein  24.86 
 
 		 205 aa  46.6  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0957  autoinducer synthesis protein LuxI  28.38 
 
 		 193 aa  45.8  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.375651  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7113  putative autoinducer (acylhomoserine lactone) synthase  23.5 
 
 		 227 aa  45.1  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.983538  normal  0.575549 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4280  autoinducer synthesis protein  23.33 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0241247  normal  0.0105559 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6489  autoinducer synthesis protein  34.69 
 
 		 119 aa  44.3  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.191421  normal  0.837558 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1512  N-acyl homoserine lactone synthase  23.28 
 
 		 203 aa  43.9  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0575581  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2390  autoinducer synthesis protein  25.35 
 
 		 203 aa  42.4  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2974  autoinducer synthesis protein  29.17 
 
 		 223 aa  42.4  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.402938 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0403  autoinducer (acylhomoserine lactone) synthase  24.82 
 
 		 218 aa  41.6  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0417  autoinducer synthesis protein  23.4 
 
 		 218 aa  41.6  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1999  autoinducer synthesis protein  24.2 
 
 		 183 aa  41.6  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.556283  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0361  autoinducer synthesis protein  25.29 
 
 		 197 aa  41.6  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2275  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1666  autoinducer synthesis protein  24.2 
 
 		 183 aa  41.6  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.852162 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>