62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0787 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0787  N-acyl-L-homoserine lactone synthetase-like  100 
 
 		 196 aa  412  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.421704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0312  N-acyl-L-homoserine lactone synthetase-like protein  63.27 
 
 		 195 aa  257  6e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.434992 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0620  N-acyl-L-homoserine lactone synthetase-like  50 
 
 		 195 aa  187  7e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2526  autoinducer synthesis protein  31.87 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3811  autoinducer synthesis protein  26.01 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0403  autoinducer (acylhomoserine lactone) synthase  27.22 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1227  N-acyl homoserine lactone synthase  28.87 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0417  autoinducer synthesis protein  26.26 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1710  autoinducer synthesis protein  27.88 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0765757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0145  N-acylhomoserine lactone synthase  28.5 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0460086  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1577  autoinducer synthetase  28.5 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.24654  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1658  autoinducer synthetase  28.5 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0115176  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1050  autoinducer synthesis protein  28.09 
 
 		 202 aa  53.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000000830053  normal  0.1745 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19130  autoinducer synthesis protein RhlI  25.31 
 
 		 201 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.347386  normal  0.284898 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4583  autoinducer synthesis protein  28.65 
 
 		 202 aa  53.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000141788  hitchhiker  0.0000655879 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5574  autoinducer synthesis protein  28.09 
 
 		 202 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000539644  hitchhiker  0.00691296 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4118  autoinducer synthesis protein  28.65 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000553872  hitchhiker  0.00840845 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3286  autoinducer synthesis protein SOLI  26.5 
 
 		 204 aa  52.4  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.498186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2974  autoinducer synthesis protein  26.54 
 
 		 223 aa  52  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.402938 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0322  putative autoinducer (acylhomoserine lactone) synthase  28.33 
 
 		 218 aa  52  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.805046  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1621  autoinducer synthesis protein  29.03 
 
 		 226 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.672835  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1760  autoinducer synthesis protein  27.97 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0123  autoinducer synthesis protein  27.97 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0259  autoinducer synthesis protein TraI (conjugation factor synthetase)  26.9 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3641  autoinducer synthesis protein  27.12 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000011065  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5823  autoinducer synthesis protein  25.6 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.960322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4726  autoinducer synthesis protein  27.12 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455128  hitchhiker  0.006335 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4275  autoinducer synthesis protein  25 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.722573  normal  0.550742 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0415  putative autoinducer synthesis protein  28.57 
 
 		 249 aa  50.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2589  autoinducer synthesis protein  27.74 
 
 		 208 aa  49.7  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4437  autoinducer synthesis protein  23.56 
 
 		 195 aa  49.3  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3864  autoinducer synthesis protein PsyI  27.33 
 
 		 244 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.70516  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6053  autoinducer synthesis protein  25.6 
 
 		 201 aa  48.9  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0608  putative autoinducer synthesis protein  24.43 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.216873 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1560  autoinducer synthesis protein  26.85 
 
 		 214 aa  47.4  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.766209  normal  0.485309 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1221  autoinducer synthase BpsI  26.04 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.653596  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2483  N-acylhomoserine lactone synthase  26.04 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9666  autoinducer (acylhomoserine lactone) synthase  38.18 
 
 		 222 aa  46.6  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165621  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1293  autoinducer synthase BpsI  26.04 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.133764  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0098  autoinducer synthesis protein  25.15 
 
 		 205 aa  46.6  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0960  autoinducer synthase BpsI  26.04 
 
 		 203 aa  46.2  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0609  autoinducer synthase BpsI  26.04 
 
 		 203 aa  46.2  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1650  autoinducer synthesis protein RhlI  24.54 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0331  autoinducer synthase BpsI  26.04 
 
 		 203 aa  46.2  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1347  autoinducer synthetase family protein  26.04 
 
 		 203 aa  46.2  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3498  phospholipid/glycerol acyltransferase  23.73 
 
 		 191 aa  46.2  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.364609 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1512  N-acyl homoserine lactone synthase  26.23 
 
 		 203 aa  45.8  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0575581  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0957  autoinducer synthesis protein LuxI  26.28 
 
 		 193 aa  45.4  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.375651  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0965  Acyl-homoserine-lactone synthase  27.11 
 
 		 188 aa  45.4  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.397594  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0701  autoinducer synthesis protein  25.45 
 
 		 208 aa  45.1  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1666  autoinducer synthesis protein  28.11 
 
 		 183 aa  44.7  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.852162 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1999  autoinducer synthesis protein  28.11 
 
 		 183 aa  44.7  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.556283  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1889  autoinducer synthesis protein  28.28 
 
 		 214 aa  44.7  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.889914  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0919  autoinducer synthesis protein  22.09 
 
 		 204 aa  43.5  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.142092 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1765  autoinducer synthesis protein  24.4 
 
 		 201 aa  43.5  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.35237  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01928  autoinducer synthase  25.73 
 
 		 182 aa  43.9  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.697337 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7113  putative autoinducer (acylhomoserine lactone) synthase  22.94 
 
 		 227 aa  43.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.983538  normal  0.575549 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2390  autoinducer synthesis protein  24.85 
 
 		 203 aa  42.4  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0941  autoinducer synthesis protein  30.19 
 
 		 212 aa  41.6  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0285  3(2),5 -bisphosphate nucleotidase  32.06 
 
 		 275 aa  41.6  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.736808  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0792  autoinducer synthesis protein  25.24 
 
 		 216 aa  41.2  0.01  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0719  N-acylhomoserine lactone synthase YtbI  25.24 
 
 		 216 aa  41.2  0.01  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>