More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2776 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2776  amino acid ABC transporter, permease protein  100 
 
 
220 aa  431  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.636718  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2504  amino acid ABC transporter permease  96.82 
 
 
220 aa  394  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.12542  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3091  amino acid ABC transporter permease  89.09 
 
 
220 aa  365  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.832424  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5537  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  67.27 
 
 
220 aa  271  5.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.251581 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5259  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  66.36 
 
 
220 aa  271  8.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.298032  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4547  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  63.64 
 
 
220 aa  271  8.000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.389255  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0966  amino acid ABC transporter permease  63.18 
 
 
220 aa  245  3e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000446908  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2538  glutamine ABC transporter permease protein  39.63 
 
 
219 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000998158  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00777  glutamine ABC transporter permease protein  39.17 
 
 
219 aa  154  7e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2832  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.17 
 
 
219 aa  154  7e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.137324  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00794  hypothetical protein  39.17 
 
 
219 aa  154  7e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2833  glutamine ABC transporter permease protein  39.17 
 
 
219 aa  154  7e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.2982  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0866  glutamine ABC transporter permease protein  39.17 
 
 
219 aa  154  7e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178122  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0879  glutamine ABC transporter permease protein  39.17 
 
 
219 aa  154  7e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000000563749  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0959  glutamine ABC transporter permease protein  39.17 
 
 
219 aa  154  7e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000482918  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0834  glutamine ABC transporter permease protein  39.17 
 
 
219 aa  154  7e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000546906  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0865  glutamine ABC transporter permease protein  37.79 
 
 
219 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.813603  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2054  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.78 
 
 
233 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0956  glutamine ABC transporter permease protein  37.79 
 
 
219 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0688555  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0977  glutamine ABC transporter permease protein  37.79 
 
 
219 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.034777  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0893  glutamine ABC transporter permease protein  37.79 
 
 
219 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.110521  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0924  glutamine ABC transporter permease protein  37.79 
 
 
219 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0141353  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1057  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.86 
 
 
216 aa  146  2.0000000000000003e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000168875  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0469  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, permease protein EhuC  38.28 
 
 
216 aa  146  3e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0728  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.67 
 
 
221 aa  145  5e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000362636  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1052  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.97 
 
 
218 aa  144  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.233768  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1092  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35 
 
 
227 aa  144  1e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.972278  normal  0.0193849 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1155  glutamine ABC transporter permease protein  37.04 
 
 
218 aa  143  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1297  glutamine ABC transporter permease protein  36.87 
 
 
219 aa  142  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0712519  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1707  glutamine ABC transporter permease protein  38.36 
 
 
228 aa  142  4e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.165583  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0500  amino acid ABC transporter permease  41.63 
 
 
242 aa  142  4e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3698  glutamine ABC transporter permease protein  37.16 
 
 
218 aa  141  6e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.143034  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2879  glutamine ABC transporter permease protein  37.16 
 
 
219 aa  140  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0618158  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2598  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.38 
 
 
223 aa  139  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670046  normal  0.181167 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2509  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  40.59 
 
 
219 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.352919 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0684  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  35.48 
 
 
221 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0799785  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4283  glutamine ABC transporter permease protein  35.78 
 
 
235 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4083  glutamine ABC transporter permease protein  35.78 
 
 
235 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292626  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2390  glutamine ABC transporter permease protein  36.53 
 
 
235 aa  138  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3271  glutamine ABC transporter permease protein  36.53 
 
 
235 aa  138  6e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.835494  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1405  glutamine ABC transporter permease protein  36.53 
 
 
235 aa  138  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.182596  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3157  glutamine ABC transporter permease protein  36.53 
 
 
235 aa  138  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0481708  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1125  glutamine ABC transporter permease protein  36.53 
 
 
235 aa  138  6e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1046  L-cystine ABC transporter, permease protein  39.5 
 
 
222 aa  138  7.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0095554  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5949  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.07 
 
 
222 aa  137  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.426102  normal  0.0201858 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0543  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.89 
 
 
214 aa  137  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0582  His/Glu/Gln/Arg/opine ABC transporter permease  32.11 
 
 
223 aa  137  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0325  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.13 
 
 
216 aa  137  1e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1728  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39 
 
 
222 aa  136  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000424447  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2152  L-cystine ABC transporter, permease protein  39 
 
 
222 aa  137  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00489018  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1264  L-cystine ABC transporter, permease protein  39 
 
 
222 aa  136  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0917804  normal  0.0118842 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2017  L-cystine ABC transporter, permease protein  39 
 
 
222 aa  136  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0245386  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2032  amino acid ABC transporter permease  38.5 
 
 
220 aa  136  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2692  L-cystine ABC transporter, permease protein  39 
 
 
222 aa  136  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0324102  normal  0.0361809 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1728  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.1 
 
 
219 aa  136  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3440  glutamine ABC transporter permease protein  35.48 
 
 
218 aa  136  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1721  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39 
 
 
222 aa  136  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.796808 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2356  glutamine ABC transporter permease protein  36.07 
 
 
230 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0343  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.14 
 
 
216 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0609  amino acid ABC transporter permease  40.58 
 
 
214 aa  135  4e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00355475  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0554  glutamine ABC transporter permease  40.58 
 
 
214 aa  135  4e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.282364  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2097  glutamine ABC transporter permease protein  36.57 
 
 
218 aa  135  4e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0754215  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1486  glutamine ABC transporter permease protein  36.57 
 
 
218 aa  135  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0642  amino acid ABC transporter permease  40.58 
 
 
214 aa  135  4e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00728334  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7089  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.14 
 
 
222 aa  135  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.107258  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1376  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.87 
 
 
223 aa  135  5e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000031441  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5459  ABC transporter membrane spanning protein (amino acid)  39.5 
 
 
222 aa  135  6.0000000000000005e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4986  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39 
 
 
222 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.86981 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1478  glutamine ABC transporter permease protein  37.79 
 
 
219 aa  135  7.000000000000001e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1759  putative ABC transporter, permease protein  37.89 
 
 
228 aa  134  8e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00086145  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1919  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.32 
 
 
223 aa  134  9e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0568  amino acid ABC transporter permease  32.11 
 
 
223 aa  134  9e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0699  amino acid ABC transporter, permease protein  40.49 
 
 
214 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2030  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.62 
 
 
598 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0310843  hitchhiker  0.00101821 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2587  amino acid ABC transporter permease  39.11 
 
 
234 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.727948  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0688  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.74 
 
 
232 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.452276  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2935  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.5 
 
 
220 aa  134  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2505  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.5 
 
 
222 aa  134  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.110474  normal  0.780737 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0226  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  38.5 
 
 
222 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00679283 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0555  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.58 
 
 
214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0553  glutamine ABC transporter permease  40.1 
 
 
214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000165212  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1960  glutamine ABC transporter permease protein  34.56 
 
 
218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120832  normal  0.914602 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0442  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.9 
 
 
320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3335  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.35 
 
 
223 aa  134  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0241  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.5 
 
 
222 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.213346 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4703  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.75 
 
 
492 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0678  amino acid ABC transporter, permease protein  40.1 
 
 
214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5023  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  39.39 
 
 
320 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0963279  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4164  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.38 
 
 
226 aa  132  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0771  amino acid ABC transporter, permease protein  40.1 
 
 
214 aa  132  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.199916  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3137  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.8 
 
 
226 aa  133  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.490493  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5073  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.39 
 
 
320 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4897  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.39 
 
 
320 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.691189  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4660  amino acid ABC transporter, permease protein  39.61 
 
 
214 aa  133  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.084926  hitchhiker  1.97521e-21 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0208  amino acid ABC transporter, permease protein  38.86 
 
 
218 aa  132  3e-30  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.549862  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1927  glutamine-binding periplasmic protein/glutamine transport system permease protein  35.86 
 
 
222 aa  132  3.9999999999999996e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3164  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.32 
 
 
493 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.296252  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67040  ABC transporter permease  40.8 
 
 
320 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2489  glutamine ABC transporter permease protein  37.33 
 
 
219 aa  132  5e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4185  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.71 
 
 
223 aa  132  5e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>