267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_69779 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_69779  ATP synthase delta subunit  100 
 
 
161 aa  324  4.0000000000000003e-88  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10032  ATP synthase delta chain, mitochondrial precursor, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03100)  47.59 
 
 
166 aa  144  6e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0262441 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35127  F-ATPase family transporter: protons (mitochondrial)  37.11 
 
 
170 aa  99.4  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00330  ATP synthase delta chain, mitochondrial precursor, putative  46.94 
 
 
104 aa  89  2e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000932509  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0892  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.05 
 
 
136 aa  68.2  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1466  ATP synthase F1, epsilon subunit  35.78 
 
 
132 aa  67  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2082  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.29 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.929878  normal  0.384385 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3289  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.53 
 
 
141 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2948  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.53 
 
 
141 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0098  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.53 
 
 
141 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.712946  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0107  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.53 
 
 
141 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0123  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.53 
 
 
141 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0107  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.53 
 
 
141 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.722454 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0107  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.53 
 
 
141 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2958  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.81 
 
 
141 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4041  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.81 
 
 
141 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3967  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.81 
 
 
141 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0177  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.81 
 
 
141 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.313145  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3016  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.81 
 
 
141 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2211  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.85 
 
 
138 aa  65.5  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3354  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.81 
 
 
141 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1586  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.81 
 
 
141 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3307  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.97 
 
 
141 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.236426  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2800  ATP synthase F1, epsilon subunit  35.4 
 
 
133 aa  63.9  0.0000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.694074  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2921  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.73 
 
 
134 aa  63.2  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3026  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.37 
 
 
141 aa  62  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0140  ATP synthase F1, epsilon subunit  32.04 
 
 
140 aa  62  0.000000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2868  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.33 
 
 
140 aa  62  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2136  ATP synthase F1, epsilon subunit  32.71 
 
 
137 aa  62  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0434  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.95 
 
 
135 aa  61.6  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.639575  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0874  ATP synthase F1, epsilon subunit  34.23 
 
 
135 aa  61.6  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0041  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.67 
 
 
141 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.952205  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3893  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.62 
 
 
141 aa  60.8  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159746  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3219  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.84 
 
 
135 aa  60.8  0.000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.816212  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3525  ATP synthase F1, epsilon subunit  40 
 
 
125 aa  59.7  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.012932 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0560  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.9 
 
 
151 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.624995 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0027  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.29 
 
 
138 aa  58.9  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.155859  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3283  ATP synthase F1, epsilon subunit  47.17 
 
 
141 aa  59.7  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2429  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.57 
 
 
141 aa  59.7  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0464757  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2832  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.45 
 
 
134 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1227  H+-transporting two-sector ATPase, delta/epsilon subunit  32.35 
 
 
134 aa  58.5  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0173  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.03 
 
 
135 aa  58.9  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0528  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.29 
 
 
135 aa  58.9  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.835042  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03615  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.01 
 
 
139 aa  58.2  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.901981  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4236  ATP synthase F1, epsilon subunit  33.01 
 
 
139 aa  58.2  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3947  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.01 
 
 
139 aa  58.2  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4246  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.01 
 
 
139 aa  58.2  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.014203  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0984  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.14 
 
 
134 aa  58.2  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.111243  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04082  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.33 
 
 
137 aa  58.2  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4263  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.01 
 
 
139 aa  58.2  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.634105  normal  0.317947 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4099  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.01 
 
 
139 aa  58.2  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.420004 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5167  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.01 
 
 
139 aa  58.2  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0939649 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03559  hypothetical protein  33.01 
 
 
139 aa  58.2  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.772502  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3058  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.71 
 
 
140 aa  57.4  0.00000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0264  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.58 
 
 
139 aa  57.4  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.300977  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1050  ATP synthase F1, epsilon subunit  35.05 
 
 
132 aa  57.4  0.00000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52150  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.65 
 
 
140 aa  57  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.205122  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1087  ATP synthase F1, epsilon subunit  30.83 
 
 
136 aa  57  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2806  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.22 
 
 
141 aa  56.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.668633 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2423  ATP synthase F1, epsilon subunit, putative  34.29 
 
 
163 aa  55.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.72522  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3202  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.22 
 
 
141 aa  56.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.447549  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2743  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.53 
 
 
141 aa  56.6  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3994  ATP synthase F1, epsilon subunit  33.75 
 
 
140 aa  56.2  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.305683  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2053  ATP synthase F1, epsilon subunit  34.29 
 
 
163 aa  55.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.376983  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2529  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.48 
 
 
140 aa  55.8  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3955  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.03 
 
 
142 aa  56.2  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0052877  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0421  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.45 
 
 
138 aa  56.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0758  ATP synthase F1, epsilon subunit, putative  34.29 
 
 
171 aa  55.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0409  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.13 
 
 
135 aa  55.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.384593 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4074  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.04 
 
 
137 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.69427  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4254  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.04 
 
 
137 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0484  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.43 
 
 
143 aa  55.8  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3302  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.45 
 
 
134 aa  55.8  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4145  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.04 
 
 
139 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3751  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.01 
 
 
142 aa  55.5  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000167376  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4195  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.04 
 
 
137 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0666  F0F1-type ATP synthase, epsilon subunit  34.34 
 
 
142 aa  55.5  0.0000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.177829  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002031  ATP synthase epsilon chain  32.18 
 
 
140 aa  55.5  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4089  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.04 
 
 
139 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0423  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.43 
 
 
143 aa  55.8  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00420  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.33 
 
 
140 aa  55.1  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4485  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.7 
 
 
142 aa  55.1  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.541695  hitchhiker  0.00000768605 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4133  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.04 
 
 
139 aa  55.1  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.490759  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0344  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.53 
 
 
133 aa  55.5  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0213495 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4190  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.04 
 
 
139 aa  54.7  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3819  ATP synthase F1, epsilon subunit  26.79 
 
 
148 aa  54.7  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.590081  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4073  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.2 
 
 
136 aa  54.7  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000149608  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0904  ATP synthase F1, epsilon subunit  33.33 
 
 
171 aa  54.3  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.112177  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4897  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.91 
 
 
142 aa  54.7  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.271639 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2023  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.77 
 
 
138 aa  54.3  0.0000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.471651 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4195  ATP synthase F1, epsilon subunit  29.06 
 
 
140 aa  54.3  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0170  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.56 
 
 
135 aa  54.3  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.41505  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4239  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.7 
 
 
142 aa  54.3  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.785039  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4258  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.33 
 
 
139 aa  54.3  0.0000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6355  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44.44 
 
 
141 aa  54.3  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73230  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44.44 
 
 
141 aa  54.3  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3844  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.89 
 
 
142 aa  54.3  0.0000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000154563 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3149  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.77 
 
 
132 aa  53.9  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3874  ATP synthase F1, epsilon subunit  37.93 
 
 
140 aa  53.9  0.0000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0604  ATP synthase F1, epsilon subunit  31.82 
 
 
133 aa  53.5  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000108005  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>