More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_39093 on replicon NC_011686
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011686  PHATRDRAFT_39093  predicted protein  100 
 
 
552 aa  1161    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0503  aminotransferase class I and II  43.14 
 
 
432 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0470  aminotransferase  43.14 
 
 
432 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.668289  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0498  aminotransferase class I and II  43.14 
 
 
432 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.381464  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1779  aminotransferase class I and II  40.6 
 
 
446 aa  355  1e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0824266  normal  0.278795 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05591  aminotransferase, classes I and II, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G11460)  42.16 
 
 
481 aa  342  1e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.759199  normal  0.780451 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63214  predicted protein  40.77 
 
 
533 aa  342  1e-92  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.220985  normal  0.0880707 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1817  aminotransferase class I and II  21.25 
 
 
385 aa  98.2  4e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0703  aminotransferase  27.63 
 
 
394 aa  94.4  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0710  aminotransferase  24.5 
 
 
394 aa  86.7  9e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0767  aminotransferase  23.63 
 
 
393 aa  85.9  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2696  aminotransferase  23.34 
 
 
393 aa  85.5  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.192367  normal  0.916147 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0910  aminotransferase class I and II  26.07 
 
 
421 aa  85.5  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.111037 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0659  aminotransferase  26.32 
 
 
394 aa  84.7  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.165576 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1189  aminotransferase class I and II  23.06 
 
 
376 aa  84  0.000000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00616768  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0642  aminotransferase class I and II  24.05 
 
 
380 aa  82.8  0.00000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0585  aminotransferase class I and II  23.93 
 
 
375 aa  80.9  0.00000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1128  aminotransferase class I and II  21.04 
 
 
397 aa  80.5  0.00000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.472609  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2454  hypothetical protein  22.46 
 
 
388 aa  80.1  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2598  hypothetical protein  23.4 
 
 
388 aa  79  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0616  aminotransferase  25.89 
 
 
397 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.736327  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0885  aminotransferase class I and II  20.53 
 
 
365 aa  78.6  0.0000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2321  aminotransferase class I and II  21.01 
 
 
397 aa  78.6  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000744146  hitchhiker  0.00241893 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0836  hypothetical protein  24.09 
 
 
390 aa  78.2  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149421 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0633  aminotransferase, class I  20.58 
 
 
394 aa  77.4  0.0000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0813459  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0881  hypothetical protein  24.06 
 
 
385 aa  77  0.0000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1684  aspartate aminotransferase  23.24 
 
 
396 aa  76.6  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.121725  normal  0.0684909 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0426  aminotransferase class I and II  21.06 
 
 
374 aa  76.6  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4803  hypothetical protein  26.3 
 
 
390 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0396768  hitchhiker  0.00689521 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3584  hypothetical protein  25.68 
 
 
393 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.510103 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0973  aminotransferase class I and II  21 
 
 
379 aa  74.7  0.000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0434  aminotransferase class I and II  22.74 
 
 
393 aa  74.3  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2062  aminotransferase class I and II  25.68 
 
 
374 aa  73.9  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.928457  normal  0.422192 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3813  aminotransferase  23.13 
 
 
405 aa  73.6  0.000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.13389  normal  0.512222 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0824  aminotransferase  23.92 
 
 
398 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2443  aminotransferase  26.12 
 
 
398 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.693278  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1128  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  19.95 
 
 
394 aa  73.2  0.00000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2121  aminotransferase  24.51 
 
 
386 aa  72.8  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.799359  normal  0.288455 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3018  aminotransferase class I and II  22.9 
 
 
383 aa  73.2  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5438  hypothetical protein  28.12 
 
 
390 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1766  aminotransferase class I and II  24.79 
 
 
377 aa  72.8  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0019  aromatic amino acid aminotransferase  20.41 
 
 
391 aa  72.4  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0735711  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1380  aminotransferase class I and II  23.23 
 
 
398 aa  72.8  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0129457  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3113  aminotransferase  23.61 
 
 
398 aa  72.8  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.274828  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0323  aspartate aminotransferase  21.04 
 
 
417 aa  72.4  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00219132  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0815  aminotransferase  24.25 
 
 
398 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0916  aminotransferase  26.04 
 
 
398 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.403355  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4053  aspartate aminotransferase  22.87 
 
 
383 aa  72.4  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1870  GntR family transcriptional regulator  26.7 
 
 
476 aa  72  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4055  aminotransferase  23.92 
 
 
414 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1528  aminotransferase  24.48 
 
 
397 aa  72  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.545419  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0475  aminotransferase  26.04 
 
 
398 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  21.67 
 
 
389 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0954  aminotransferase  26.04 
 
 
398 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0046  aromatic amino acid aminotransferase  22.19 
 
 
391 aa  71.6  0.00000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0104565  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2218  aminotransferase class I and II  24.33 
 
 
382 aa  70.9  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.156784  normal  0.455276 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3104  aminotransferase  25.17 
 
 
398 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0542  aminotransferase, class I and II  22.61 
 
 
367 aa  70.9  0.00000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0515807  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2163  aminotransferase, classes I and II  19.82 
 
 
380 aa  70.9  0.00000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0970  aminotransferase, classes I and II  25.16 
 
 
390 aa  70.5  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103563  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0890  aminotransferase  26.02 
 
 
398 aa  70.5  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  21.46 
 
 
395 aa  70.9  0.00000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0568  aminotransferase  24.65 
 
 
391 aa  70.5  0.00000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1353  L-aspartate aminotransferase  24.19 
 
 
391 aa  70.5  0.00000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1506  aminotransferase, class I and II  21.73 
 
 
368 aa  70.1  0.00000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1317  putative aminotransferase  23.72 
 
 
382 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0746  aminotransferase class I and II  22.22 
 
 
387 aa  70.1  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000316977  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0167  aspartate aminotransferase  24.06 
 
 
388 aa  69.7  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.288155 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1888  aminotransferase  20.14 
 
 
370 aa  69.7  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04720  putative aminotransferase  22.49 
 
 
381 aa  69.7  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.291343  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0118  putative aminotransferase  22.91 
 
 
384 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2465  aminotransferase  23.81 
 
 
394 aa  68.9  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0299601  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1903  aminotransferase, class I and II  21.25 
 
 
396 aa  69.3  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0674  L-aspartate aminotransferase  21.48 
 
 
392 aa  68.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1874  aspartate aminotransferase  19.82 
 
 
380 aa  69.3  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14940  putative aminotransferase  23.68 
 
 
382 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.779314 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0045  aromatic amino acid aminotransferase  22.19 
 
 
391 aa  68.9  0.0000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2189  aminotransferase, class I and II  19.83 
 
 
397 aa  68.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0726019  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1877  aminotransferase class I and II  21.72 
 
 
402 aa  68.2  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1136  aspartate aminotransferase  23.87 
 
 
395 aa  68.2  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.358682  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1973  aminotransferase, class I and II  20.1 
 
 
429 aa  68.6  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.238227  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1955  aminotransferase  21.77 
 
 
392 aa  68.6  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0276062 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0994  aspartate aminotransferase  23.87 
 
 
395 aa  68.2  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00992397  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0742  hypothetical protein  24.57 
 
 
390 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107858  hitchhiker  0.00000000116369 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0388  aminotransferase class I and II  20.38 
 
 
392 aa  68.2  0.0000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4556  hypothetical protein  24.91 
 
 
390 aa  68.2  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.331626  hitchhiker  0.00000115439 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3299  putative aminotransferase  22.29 
 
 
384 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2671  aminotransferase  23.01 
 
 
397 aa  67.4  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1131  aminotransferase class I and II  20 
 
 
384 aa  67.4  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000220252  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1108  aminotransferase, class I and II  20 
 
 
384 aa  67.4  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00053469  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0624  aspartate aminotransferase  24.88 
 
 
395 aa  67.4  0.0000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.68726  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62480  hypothetical protein  29.84 
 
 
390 aa  67  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3658  aminotransferase class I and II  23.88 
 
 
387 aa  67  0.0000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.76219  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1440  aminotransferase, classes I and II  23.27 
 
 
382 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0119  putative aminotransferase  22.55 
 
 
384 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0059  aspartate aminotransferase  21.81 
 
 
376 aa  66.2  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3951  aminotransferase class I and II  24.11 
 
 
387 aa  66.6  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal  0.350416 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1089  hypothetical protein  22.85 
 
 
400 aa  66.6  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.806795  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0044  aromatic amino acid aminotransferase  23.24 
 
 
395 aa  66.6  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0119  putative aminotransferase  22.58 
 
 
384 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.234511  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>