More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1779 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1779  aminotransferase class I and II  100 
 
 
446 aa  902    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0824266  normal  0.278795 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0503  aminotransferase class I and II  67.94 
 
 
432 aa  594  1e-168  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0470  aminotransferase  67.54 
 
 
432 aa  594  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.668289  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0498  aminotransferase class I and II  67.94 
 
 
432 aa  593  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.381464  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39093  predicted protein  40.12 
 
 
552 aa  359  7e-98  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05591  aminotransferase, classes I and II, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G11460)  43.2 
 
 
481 aa  328  1.0000000000000001e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.759199  normal  0.780451 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63214  predicted protein  41.26 
 
 
533 aa  318  9e-86  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.220985  normal  0.0880707 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1627  aminotransferase, class I and II  29.76 
 
 
393 aa  122  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.703964 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2206  aminotransferase class I and II  27.22 
 
 
400 aa  119  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1490  L-aspartate aminotransferase  26.76 
 
 
396 aa  119  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2116  aminotransferase class I and II  27.22 
 
 
400 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1731  L-aspartate aminotransferase  27.22 
 
 
400 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2066  aminotransferase class I and II  25.3 
 
 
400 aa  116  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0959735  normal  0.858432 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4880  aminotransferase  31.12 
 
 
389 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.10288 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07871  aminotransferase class-I  25.68 
 
 
393 aa  115  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.404062  hitchhiker  0.00724094 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  23.95 
 
 
395 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1684  aspartate aminotransferase  27.09 
 
 
396 aa  113  6e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.121725  normal  0.0684909 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0674  L-aspartate aminotransferase  25.69 
 
 
392 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6897  aspartate aminotransferase  30.12 
 
 
388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4355  succinyldiaminopimelate aminotransferase  30.32 
 
 
385 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.339813  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1817  aminotransferase class I and II  25.29 
 
 
385 aa  111  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2269  aminotransferase class I and II  28.64 
 
 
412 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2793  aminotransferase  28.72 
 
 
390 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2121  aminotransferase  30.96 
 
 
386 aa  110  6e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.799359  normal  0.288455 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0542  aminotransferase, class I and II  26.45 
 
 
367 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0515807  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3951  aminotransferase class I and II  29.6 
 
 
387 aa  109  9.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal  0.350416 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0746  aminotransferase class I and II  26.52 
 
 
387 aa  109  9.000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000316977  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2813  aminotransferase class I and II  29.28 
 
 
401 aa  109  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.140428  normal  0.350751 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0568  aminotransferase  28.54 
 
 
391 aa  108  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3164  aspartate aminotransferase  29.65 
 
 
460 aa  108  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.808038  normal  0.139624 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1128  aminotransferase class I and II  24.45 
 
 
397 aa  108  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.472609  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07271  aminotransferases class-I  25.62 
 
 
392 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.232753  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07291  aminotransferases class-I  25.86 
 
 
392 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.122313  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3018  aminotransferase class I and II  27.45 
 
 
383 aa  107  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0911  aminotransferase, class I  27.65 
 
 
387 aa  107  4e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.390413  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0907  aminotransferase, class I  27.65 
 
 
387 aa  107  4e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0895132  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2956  aminotransferase class I and II  28.9 
 
 
387 aa  107  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00270718  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1877  aminotransferase class I and II  24.86 
 
 
402 aa  107  5e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3658  aminotransferase class I and II  29.31 
 
 
387 aa  106  8e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.76219  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5428  aminotransferase class I and II  28.45 
 
 
387 aa  106  8e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.89261 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0295  aspartate aminotransferase  29.08 
 
 
393 aa  106  8e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1818  aminotransferase, class I and II  30.57 
 
 
378 aa  106  9e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.11769 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3944  aminotransferase class I and II  29.89 
 
 
387 aa  105  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6045  aminotransferase class I and II  28.86 
 
 
390 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0434  aminotransferase class I and II  25.91 
 
 
393 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0835  aminotransferase class I and II  27.75 
 
 
400 aa  106  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3861  aminotransferase  30.65 
 
 
397 aa  105  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4497  aminotransferase  30.61 
 
 
389 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1128  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  24.39 
 
 
394 aa  105  2e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4584  aminotransferase  30.61 
 
 
389 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.344557 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03600  aspartate aminotransferase  27.63 
 
 
411 aa  104  4e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589987  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1295  L-aspartate aminotransferase  26.72 
 
 
392 aa  103  4e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4251  aminotransferase  29.97 
 
 
397 aa  104  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0228978  normal  0.0474481 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2679  aminotransferase class I and II  28.14 
 
 
411 aa  103  5e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1476  aspartate aminotransferase  30.02 
 
 
384 aa  103  5e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5290  aspartate aminotransferase  30.33 
 
 
384 aa  103  6e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.482624  normal  0.084891 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0865  aminotransferase  28.25 
 
 
381 aa  102  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.424405  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1220  putative aspartate transaminase  25.97 
 
 
412 aa  102  2e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000208657 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  23.69 
 
 
390 aa  101  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10875  aminotransferase  28.89 
 
 
397 aa  102  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.069515 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38110  aminotransferase  29.15 
 
 
392 aa  102  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.115353  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2702  aminotransferase class I and II  29.75 
 
 
384 aa  101  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.496987  normal  0.10024 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1680  aminotransferase  29.19 
 
 
391 aa  101  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591573  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  26.75 
 
 
392 aa  100  4e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2218  aminotransferase class I and II  29.06 
 
 
382 aa  100  5e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.156784  normal  0.455276 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2537  aminotransferase  27.38 
 
 
381 aa  100  5e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.7413  normal  0.0409069 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2696  aminotransferase  26.95 
 
 
393 aa  100  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.192367  normal  0.916147 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1844  L-aspartate aminotransferase  23.59 
 
 
399 aa  100  7e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.716649  normal  0.149603 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0111  putative aspartate transaminase  25.84 
 
 
401 aa  100  7e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0165  aminotransferase, class I and II  28.33 
 
 
390 aa  100  7e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13598  aspartate aminotransferase  29.29 
 
 
388 aa  100  7e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0143941  normal  0.389087 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6777  aminotransferase class I and II  29.98 
 
 
381 aa  99.8  9e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.655387  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0945  aminotransferase class I and II  29.68 
 
 
392 aa  99.4  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.090244  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2980  aminotransferase  28.65 
 
 
383 aa  99  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.289509  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1189  aminotransferase class I and II  26.08 
 
 
376 aa  99.4  1e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00616768  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1626  aminotransferase, class I and II  28.65 
 
 
383 aa  99.4  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.608674  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0047  aminotransferase class I and II  31.23 
 
 
395 aa  99.4  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2514  aminotransferase  26.21 
 
 
374 aa  99  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2943  aminotransferase, class I and II  25.55 
 
 
382 aa  99  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00452348  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1745  aminotransferase class I and II  28.78 
 
 
393 aa  99  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2513  aminotransferase  28.61 
 
 
385 aa  98.6  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0124388  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0568  L-aspartate aminotransferase  22.93 
 
 
399 aa  98.6  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0641673 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1131  aminotransferase class I and II  25.71 
 
 
384 aa  98.2  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000220252  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09980  succinyldiaminopimelate aminotransferase  29.52 
 
 
387 aa  99  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.466854  normal  0.440994 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2321  aminotransferase class I and II  23.28 
 
 
397 aa  98.2  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000744146  hitchhiker  0.00241893 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0804  aminotransferase class I and II  28.72 
 
 
389 aa  98.2  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1108  aminotransferase, class I and II  25.71 
 
 
384 aa  98.2  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00053469  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0673  aspartate aminotransferase  28.89 
 
 
415 aa  97.8  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.185971  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0836  hypothetical protein  26.86 
 
 
390 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149421 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  23.76 
 
 
387 aa  98.2  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1642  aspartate aminotransferase  24.63 
 
 
397 aa  97.8  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1382  aminotransferase  22.3 
 
 
397 aa  98.2  3e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6643  aspartate aminotransferase  28.38 
 
 
413 aa  97.8  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1621  aspartate aminotransferase  23.33 
 
 
395 aa  97.8  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.624357  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2932  aminotransferase class I and II  28.89 
 
 
386 aa  97.4  5e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.805427  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0292  aspartate aminotransferase  27.99 
 
 
400 aa  97.4  5e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4527  aminotransferase class I and II  27.55 
 
 
415 aa  97.4  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0429  aminotransferase class I and II  24.31 
 
 
390 aa  97.1  6e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1924  aspartate aminotransferase  24.46 
 
 
397 aa  97.1  6e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0698  L-aspartate aminotransferase  24.88 
 
 
401 aa  96.7  7e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00325114  normal  0.844303 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>