91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_37960 on replicon NC_011682
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011682  PHATRDRAFT_37960  predicted protein  100 
 
 		 512 aa  1067    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0196  Beta-carotene 15,15'-dioxygenase  25.84 
 
 		 493 aa  127  6e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4340  Carotenoid oxygenase  25.76 
 
 		 495 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4402  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  25.56 
 
 		 495 aa  125  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000371573 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03071  retinal pigment epithelial membrane protein  27.13 
 
 		 495 aa  124  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0449  Carotenoid oxygenase  26.4 
 
 		 491 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1236  retinal pigment epithelial membrane protein  26 
 
 		 510 aa  118  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0229916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03601  retinal pigment epithelial membrane protein  25.2 
 
 		 497 aa  115  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_48352  predicted protein  25 
 
 		 551 aa  114  3e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1646  retinal pigment epithelial membrane protein  25.2 
 
 		 497 aa  114  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0221  lignostilbene-alpha,beta-dioxygenase and related enzyme-like  26.06 
 
 		 488 aa  114  6e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4222  Carotenoid oxygenase  25.35 
 
 		 501 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0865656 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3212  carotenoid oxygenase  24.44 
 
 		 489 aa  108  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.415925  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0248  lignostilbene-alpha,beta-dioxygenase and related enzyme-like  25.9 
 
 		 489 aa  107  6e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03041  retinal pigment epithelial membrane protein  25.34 
 
 		 494 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03031  retinal pigment epithelial membrane protein  23.87 
 
 		 494 aa  104  3e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0282  retinal pigment epithelial membrane protein  24.36 
 
 		 494 aa  101  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0182948  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25111  retinal pigment epithelial membrane protein  24.65 
 
 		 507 aa  101  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03131  retinal pigment epithelial membrane protein  24.95 
 
 		 495 aa  97.1  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.608355  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4841  Carotenoid oxygenase  23.32 
 
 		 464 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.659326 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30717  predicted protein  22.44 
 
 		 533 aa  81.6  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.990452 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43490  predicted protein  21.97 
 
 		 630 aa  79.7  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.416955  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3359  carotenoid oxygenase  23.98 
 
 		 502 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.120702  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3417  dioxygenase, putative  24.01 
 
 		 509 aa  77.4  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5950  crocetin dialdehyde  22.4 
 
 		 488 aa  77  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.444357  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1008  carotenoid oxygenase  23.58 
 
 		 498 aa  74.3  0.000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0158946  normal  0.495511 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3964  Carotenoid oxygenase  22.54 
 
 		 486 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.99286  normal  0.591573 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2446  twin-arginine translocation pathway signal  21.46 
 
 		 517 aa  70.5  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000341259  normal  0.858746 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_86865  predicted protein  23.36 
 
 		 554 aa  70.1  0.00000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.241734 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0611  carotenoid oxygenase  24.32 
 
 		 481 aa  67.4  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.951978 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0352  Carotenoid oxygenase  21.88 
 
 		 487 aa  67  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0359  Carotenoid oxygenase  21.88 
 
 		 487 aa  65.1  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.235865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0013  Carotenoid oxygenase  23.33 
 
 		 468 aa  65.1  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.768827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0015  Carotenoid oxygenase  23.33 
 
 		 468 aa  65.1  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5321  Carotenoid oxygenase  20.28 
 
 		 477 aa  64.3  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3944  Carotenoid oxygenase  23.16 
 
 		 481 aa  64.3  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6035  carotenoid oxygenase  30.22 
 
 		 479 aa  63.5  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.96012  normal  0.0939223 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3710  retinal pigment epithelial membrane protein  23.88 
 
 		 463 aa  63.2  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3688  carotenoid oxygenase  22.24 
 
 		 485 aa  61.2  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2656  carotenoid oxygenase  21.94 
 
 		 477 aa  60.8  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0935  Carotenoid oxygenase  22.4 
 
 		 488 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934106 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4083  Carotenoid oxygenase  24.88 
 
 		 472 aa  58.2  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3399  retinal pigment epithelial membrane protein  22.57 
 
 		 443 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.452417  normal  0.802561 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4862  Beta-carotene 15,15'-monooxygenase  24.07 
 
 		 470 aa  57.8  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.169022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0203  carotenoid oxygenase  25.27 
 
 		 464 aa  57.4  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.297924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0802  carotenoid oxygenase  21.77 
 
 		 494 aa  57.4  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.957651  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3118  carotenoid oxygenase  21.72 
 
 		 496 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.704266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0281  carotenoid oxygenase  22.32 
 
 		 445 aa  55.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.772775  hitchhiker  0.000581153 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3794  carotenoid oxygenase  20.73 
 
 		 464 aa  55.1  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0662225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2806  carotenoid oxygenase  22.38 
 
 		 445 aa  54.7  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.561211  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0300  carotenoid oxygenase  22.38 
 
 		 445 aa  54.7  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473918  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3098  carotenoid oxygenase  21.52 
 
 		 496 aa  54.3  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3158  carotenoid oxygenase  21.52 
 
 		 496 aa  54.3  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.350488 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2168  retinal pigment epithelial membrane protein  20.28 
 
 		 472 aa  53.9  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.123356 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5459  Carotenoid oxygenase  22.33 
 
 		 514 aa  53.9  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176097  normal  0.349671 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0441  carotenoid oxygenase  22.78 
 
 		 460 aa  53.9  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.786971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0518  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  26.45 
 
 		 443 aa  53.5  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.615695  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3058  carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase, putative  26.45 
 
 		 443 aa  53.5  0.000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1233  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  26.45 
 
 		 443 aa  53.5  0.000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0130033  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1401  Carotenoid oxygenase  22.05 
 
 		 467 aa  53.5  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1562  putative dioxygenase  26.45 
 
 		 443 aa  53.5  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0635  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  26.45 
 
 		 443 aa  53.5  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.617766  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1459  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  26.45 
 
 		 443 aa  53.5  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0219  carotenoid oxygenase  22.16 
 
 		 445 aa  52.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3052  carotenoid oxygenase  21.48 
 
 		 515 aa  52  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4053  Carotenoid oxygenase  20.56 
 
 		 466 aa  52  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2824  carotenoid oxygenase  23.48 
 
 		 504 aa  51.2  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0227  carotenoid oxygenase  21.91 
 
 		 445 aa  50.8  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000205038 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1216  carotenoid oxygenase  22.88 
 
 		 467 aa  50.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.548821 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1428  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  25.81 
 
 		 443 aa  50.4  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1317  carotenoid oxygenase  21.84 
 
 		 467 aa  50.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3919  Carotenoid oxygenase  25.81 
 
 		 508 aa  50.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4033  Carotenoid oxygenase  25.81 
 
 		 508 aa  50.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.804116  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05214  dioxygenase signal peptide protein  21.54 
 
 		 520 aa  49.7  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2946  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  24.1 
 
 		 473 aa  49.3  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000652034  hitchhiker  0.000168571 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01643  lignostilbene dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G01500)  22.52 
 
 		 480 aa  48.9  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.600702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1036  lignostilbene-alpha,beta-dioxygenase  20.9 
 
 		 470 aa  48.9  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1332  carotenoid oxygenase  23.42 
 
 		 444 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.447717 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1535  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  22.74 
 
 		 483 aa  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194369  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3269  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  31.11 
 
 		 419 aa  47.8  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2484  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  23.63 
 
 		 461 aa  47.8  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.217647  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10931  dioxygenase  24.35 
 
 		 502 aa  46.6  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1536  carotenoid oxygenase  39.39 
 
 		 467 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0771367  normal  0.379655 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5477  putative carotenoid oxygenase  38.46 
 
 		 467 aa  45.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07062  conserved hypothetical protein  18.79 
 
 		 555 aa  45.1  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3580  carotenoid oxygenase  22.5 
 
 		 469 aa  44.3  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5235  carotenoid oxygenase  20.72 
 
 		 451 aa  44.3  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.751022 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2047  retinal pigment epithelial membrane protein  22.5 
 
 		 765 aa  44.3  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.211058  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3952  Carotenoid oxygenase  21.2 
 
 		 499 aa  44.3  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.273513  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5460  carotenoid oxygenase  21.49 
 
 		 459 aa  44.3  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645484 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5644  carotenoid oxygenase  25.66 
 
 		 478 aa  43.9  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.427984 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>