116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_1036 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009727  CBUD_1036  lignostilbene-alpha,beta-dioxygenase  100 
 
 
470 aa  973    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0091  Carotenoid oxygenase  48.61 
 
 
477 aa  482  1e-135  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.848261  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4862  Beta-carotene 15,15'-monooxygenase  48.84 
 
 
470 aa  470  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.169022  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4083  Carotenoid oxygenase  36.02 
 
 
472 aa  327  3e-88  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01704  dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14410)  27.97 
 
 
575 aa  208  2e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.108285 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1236  retinal pigment epithelial membrane protein  30.72 
 
 
510 aa  204  4e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0229916  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3212  carotenoid oxygenase  31.39 
 
 
489 aa  195  2e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.415925  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0221  lignostilbene-alpha,beta-dioxygenase and related enzyme-like  28.04 
 
 
488 aa  194  3e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4402  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  30.79 
 
 
495 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000371573 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4340  Carotenoid oxygenase  30.94 
 
 
495 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0196  Beta-carotene 15,15'-dioxygenase  30.56 
 
 
493 aa  189  8e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0248  lignostilbene-alpha,beta-dioxygenase and related enzyme-like  26.86 
 
 
489 aa  185  2.0000000000000003e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4222  Carotenoid oxygenase  29.66 
 
 
501 aa  183  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0865656 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1646  retinal pigment epithelial membrane protein  27.86 
 
 
497 aa  180  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03601  retinal pigment epithelial membrane protein  27.86 
 
 
497 aa  180  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0935  Carotenoid oxygenase  32.13 
 
 
488 aa  173  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934106 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0203  carotenoid oxygenase  27.29 
 
 
464 aa  172  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.297924  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0359  Carotenoid oxygenase  29.68 
 
 
487 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.235865  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0352  Carotenoid oxygenase  29.46 
 
 
487 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0449  Carotenoid oxygenase  28.27 
 
 
491 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2446  twin-arginine translocation pathway signal  27.96 
 
 
517 aa  171  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000341259  normal  0.858746 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03071  retinal pigment epithelial membrane protein  27.74 
 
 
495 aa  170  5e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0611  carotenoid oxygenase  28.1 
 
 
481 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.951978 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03131  retinal pigment epithelial membrane protein  28.63 
 
 
495 aa  161  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.608355  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25111  retinal pigment epithelial membrane protein  26.09 
 
 
507 aa  161  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3964  Carotenoid oxygenase  26.62 
 
 
486 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.99286  normal  0.591573 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2806  carotenoid oxygenase  30.33 
 
 
445 aa  159  8e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.561211  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0300  carotenoid oxygenase  30.33 
 
 
445 aa  159  8e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473918  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0282  retinal pigment epithelial membrane protein  28.01 
 
 
494 aa  157  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0182948  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2656  carotenoid oxygenase  28.03 
 
 
477 aa  157  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0281  carotenoid oxygenase  30.33 
 
 
445 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.772775  hitchhiker  0.000581153 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2047  retinal pigment epithelial membrane protein  27.12 
 
 
765 aa  155  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.211058  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03031  retinal pigment epithelial membrane protein  27.59 
 
 
494 aa  155  1e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3399  retinal pigment epithelial membrane protein  28.33 
 
 
443 aa  155  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.452417  normal  0.802561 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03041  retinal pigment epithelial membrane protein  27.31 
 
 
494 aa  154  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5459  Carotenoid oxygenase  25.88 
 
 
514 aa  154  4e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176097  normal  0.349671 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3417  dioxygenase, putative  27.74 
 
 
509 aa  152  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0219  carotenoid oxygenase  28.6 
 
 
445 aa  152  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0227  carotenoid oxygenase  28.6 
 
 
445 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000205038 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3710  retinal pigment epithelial membrane protein  26.61 
 
 
463 aa  145  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1317  carotenoid oxygenase  27.39 
 
 
467 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0013  Carotenoid oxygenase  25.21 
 
 
468 aa  143  6e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.768827  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0015  Carotenoid oxygenase  25.21 
 
 
468 aa  143  6e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2168  retinal pigment epithelial membrane protein  27 
 
 
472 aa  142  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.123356 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1216  carotenoid oxygenase  27.39 
 
 
467 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.548821 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3359  carotenoid oxygenase  24.06 
 
 
502 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.120702  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1332  carotenoid oxygenase  27.04 
 
 
444 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.447717 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10667  dioxygenase  24.81 
 
 
501 aa  137  5e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.181912  normal  0.435726 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3944  Carotenoid oxygenase  26.01 
 
 
481 aa  136  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3688  carotenoid oxygenase  24.09 
 
 
485 aa  135  9.999999999999999e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1401  Carotenoid oxygenase  27.1 
 
 
467 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5644  carotenoid oxygenase  26.01 
 
 
478 aa  134  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.427984 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5477  putative carotenoid oxygenase  26.6 
 
 
467 aa  134  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3058  carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase, putative  26.27 
 
 
443 aa  133  5e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1562  putative dioxygenase  26.27 
 
 
443 aa  133  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1233  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  26.27 
 
 
443 aa  133  5e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0130033  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0635  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  26.27 
 
 
443 aa  133  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.617766  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1459  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  26.27 
 
 
443 aa  133  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0518  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  26.27 
 
 
443 aa  133  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.615695  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4841  Carotenoid oxygenase  28.14 
 
 
464 aa  133  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.659326 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5321  Carotenoid oxygenase  25.22 
 
 
477 aa  133  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0441  carotenoid oxygenase  25.49 
 
 
460 aa  132  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.786971  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05214  dioxygenase signal peptide protein  24.18 
 
 
520 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2946  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  23.5 
 
 
473 aa  131  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000652034  hitchhiker  0.000168571 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1698  carotenoid oxygenase  25.95 
 
 
480 aa  130  7.000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.459113  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1428  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  26.06 
 
 
443 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4867  carotenoid oxygenase  25 
 
 
451 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4956  carotenoid oxygenase  25 
 
 
451 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1244  carotenoid oxygenase  27.81 
 
 
556 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0442261  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5235  carotenoid oxygenase  25 
 
 
451 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.751022 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3066  Carotenoid oxygenase  27.5 
 
 
558 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.061004  hitchhiker  0.0000000132751 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3052  carotenoid oxygenase  23.22 
 
 
515 aa  127  5e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4595  carotenoid oxygenase  24.37 
 
 
479 aa  127  6e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1288  carotenoid oxygenase  27.1 
 
 
554 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.528505  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3919  Carotenoid oxygenase  22.84 
 
 
508 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4033  Carotenoid oxygenase  22.84 
 
 
508 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.804116  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5460  carotenoid oxygenase  25.26 
 
 
459 aa  124  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.645484 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2111  carotenoid oxygenase  23.15 
 
 
480 aa  123  6e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.457029 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1322  carotenoid oxygenase  27.19 
 
 
556 aa  123  8e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487019 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5723  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  26.4 
 
 
441 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00560936  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4053  Carotenoid oxygenase  23.99 
 
 
466 aa  121  3e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1535  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  24.8 
 
 
483 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194369  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1536  carotenoid oxygenase  26.01 
 
 
467 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0771367  normal  0.379655 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3952  Carotenoid oxygenase  23.08 
 
 
499 aa  119  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.273513  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6035  carotenoid oxygenase  24.95 
 
 
479 aa  117  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.96012  normal  0.0939223 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_48352  predicted protein  25 
 
 
551 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1272  carotenoid oxygenase  25.94 
 
 
487 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.261404  hitchhiker  0.00803245 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5950  crocetin dialdehyde  23.96 
 
 
488 aa  114  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.444357  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2484  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  24.07 
 
 
461 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.217647  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0802  carotenoid oxygenase  25.05 
 
 
494 aa  111  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.957651  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30717  predicted protein  26.86 
 
 
533 aa  111  3e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.990452 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3269  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  22.52 
 
 
419 aa  109  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1008  carotenoid oxygenase  23.45 
 
 
498 aa  103  6e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0158946  normal  0.495511 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2824  carotenoid oxygenase  23.74 
 
 
504 aa  103  8e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3794  carotenoid oxygenase  26.05 
 
 
464 aa  103  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0662225  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3580  carotenoid oxygenase  24.1 
 
 
469 aa  100  4e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10931  dioxygenase  22.98 
 
 
502 aa  99  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3098  carotenoid oxygenase  24.95 
 
 
496 aa  99  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3158  carotenoid oxygenase  24.95 
 
 
496 aa  99  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.350488 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3118  carotenoid oxygenase  24.95 
 
 
496 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.704266  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>