118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5460 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4867  carotenoid oxygenase  79.06 
 
 
451 aa  749    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4956  carotenoid oxygenase  79.06 
 
 
451 aa  749    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5460  carotenoid oxygenase  100 
 
 
459 aa  934    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.645484 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5235  carotenoid oxygenase  81.86 
 
 
451 aa  754    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.751022 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1332  carotenoid oxygenase  82.51 
 
 
444 aa  774    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.447717 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5723  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  49.78 
 
 
441 aa  376  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00560936  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2484  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  43.17 
 
 
461 aa  334  2e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.217647  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2111  carotenoid oxygenase  42.23 
 
 
480 aa  325  1e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.457029 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4595  carotenoid oxygenase  40.96 
 
 
479 aa  311  2e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3710  retinal pigment epithelial membrane protein  40.35 
 
 
463 aa  301  1e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3794  carotenoid oxygenase  40.17 
 
 
464 aa  299  6e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0662225  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2047  retinal pigment epithelial membrane protein  37.65 
 
 
765 aa  296  4e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.211058  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1698  carotenoid oxygenase  40.4 
 
 
480 aa  295  1e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.459113  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6035  carotenoid oxygenase  39.21 
 
 
479 aa  290  3e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.96012  normal  0.0939223 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3580  carotenoid oxygenase  40.39 
 
 
469 aa  289  7e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10667  dioxygenase  39.55 
 
 
501 aa  288  2e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.181912  normal  0.435726 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5477  putative carotenoid oxygenase  40.48 
 
 
467 aa  276  8e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1317  carotenoid oxygenase  39.31 
 
 
467 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3269  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  40.83 
 
 
419 aa  268  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0227  carotenoid oxygenase  41.26 
 
 
445 aa  267  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000205038 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0219  carotenoid oxygenase  41.26 
 
 
445 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0281  carotenoid oxygenase  40.36 
 
 
445 aa  266  8e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.772775  hitchhiker  0.000581153 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2656  carotenoid oxygenase  37.79 
 
 
477 aa  265  8.999999999999999e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3399  retinal pigment epithelial membrane protein  39.33 
 
 
443 aa  265  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.452417  normal  0.802561 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2806  carotenoid oxygenase  40.36 
 
 
445 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.561211  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0300  carotenoid oxygenase  40.36 
 
 
445 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473918  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3058  carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase, putative  40.4 
 
 
443 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1562  putative dioxygenase  40.4 
 
 
443 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1233  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  40.4 
 
 
443 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0130033  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0635  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  40.4 
 
 
443 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.617766  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1459  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  40.4 
 
 
443 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0518  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  40.4 
 
 
443 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.615695  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1216  carotenoid oxygenase  39.09 
 
 
467 aa  257  3e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.548821 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1401  Carotenoid oxygenase  38.23 
 
 
467 aa  257  3e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1535  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  39.11 
 
 
483 aa  257  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194369  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0359  Carotenoid oxygenase  32.22 
 
 
487 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.235865  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1428  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  39.73 
 
 
443 aa  254  3e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0352  Carotenoid oxygenase  32 
 
 
487 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0935  Carotenoid oxygenase  32.16 
 
 
488 aa  250  3e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934106 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4841  Carotenoid oxygenase  35.81 
 
 
464 aa  249  5e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.659326 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0441  carotenoid oxygenase  36.29 
 
 
460 aa  249  6e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.786971  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1536  carotenoid oxygenase  36.8 
 
 
467 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0771367  normal  0.379655 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5644  carotenoid oxygenase  36.33 
 
 
478 aa  228  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.427984 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2946  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  36.13 
 
 
473 aa  200  5e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000652034  hitchhiker  0.000168571 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1272  carotenoid oxygenase  33.33 
 
 
487 aa  196  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.261404  hitchhiker  0.00803245 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4053  Carotenoid oxygenase  34.12 
 
 
466 aa  194  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5950  crocetin dialdehyde  31.99 
 
 
488 aa  191  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.444357  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3098  carotenoid oxygenase  32.99 
 
 
496 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3158  carotenoid oxygenase  32.99 
 
 
496 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.350488 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3118  carotenoid oxygenase  32.59 
 
 
496 aa  186  7e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.704266  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4402  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  29.47 
 
 
495 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000371573 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119472  Carotenoid dioxygenase plastidic fusion protein, putative  29.78 
 
 
914 aa  184  3e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0452333  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_3050  predicted protein  31.95 
 
 
467 aa  184  3e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.601284  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4340  Carotenoid oxygenase  29.07 
 
 
495 aa  183  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1807  carotenoid oxygenase  32.01 
 
 
512 aa  182  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.581411  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4940  carotenoid oxygenase  31.67 
 
 
537 aa  179  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.97423  normal  0.0157069 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10931  dioxygenase  31.01 
 
 
502 aa  177  3e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0611  carotenoid oxygenase  31.47 
 
 
481 aa  174  3.9999999999999995e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.951978 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1236  retinal pigment epithelial membrane protein  30.33 
 
 
510 aa  171  4e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0229916  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0203  carotenoid oxygenase  33.41 
 
 
464 aa  169  8e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.297924  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1008  carotenoid oxygenase  29.05 
 
 
498 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0158946  normal  0.495511 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4222  Carotenoid oxygenase  30.19 
 
 
501 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0865656 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0449  Carotenoid oxygenase  29.32 
 
 
491 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0196  Beta-carotene 15,15'-dioxygenase  31.66 
 
 
493 aa  163  6e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0802  carotenoid oxygenase  30.43 
 
 
494 aa  159  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.957651  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3212  carotenoid oxygenase  28.98 
 
 
489 aa  157  4e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.415925  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0013  Carotenoid oxygenase  28.86 
 
 
468 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.768827  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0015  Carotenoid oxygenase  28.86 
 
 
468 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0221  lignostilbene-alpha,beta-dioxygenase and related enzyme-like  30.33 
 
 
488 aa  145  2e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03071  retinal pigment epithelial membrane protein  28.57 
 
 
495 aa  144  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3964  Carotenoid oxygenase  29.42 
 
 
486 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.99286  normal  0.591573 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25111  retinal pigment epithelial membrane protein  29.65 
 
 
507 aa  144  4e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5459  Carotenoid oxygenase  30.28 
 
 
514 aa  142  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176097  normal  0.349671 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03601  retinal pigment epithelial membrane protein  26.43 
 
 
497 aa  141  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1646  retinal pigment epithelial membrane protein  26.22 
 
 
497 aa  140  7e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2446  twin-arginine translocation pathway signal  28.76 
 
 
517 aa  138  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000341259  normal  0.858746 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0282  retinal pigment epithelial membrane protein  27.94 
 
 
494 aa  138  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0182948  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3919  Carotenoid oxygenase  29.84 
 
 
508 aa  136  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6365  Carotenoid oxygenase  30.27 
 
 
408 aa  136  7.000000000000001e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.259005 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4033  Carotenoid oxygenase  29.84 
 
 
508 aa  136  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.804116  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0248  lignostilbene-alpha,beta-dioxygenase and related enzyme-like  29.54 
 
 
489 aa  135  9.999999999999999e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03041  retinal pigment epithelial membrane protein  27.92 
 
 
494 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03031  retinal pigment epithelial membrane protein  27.73 
 
 
494 aa  134  3e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4862  Beta-carotene 15,15'-monooxygenase  30.95 
 
 
470 aa  132  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.169022  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05214  dioxygenase signal peptide protein  30.17 
 
 
520 aa  130  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03131  retinal pigment epithelial membrane protein  26.74 
 
 
495 aa  131  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.608355  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2168  retinal pigment epithelial membrane protein  29.11 
 
 
472 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.123356 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01643  lignostilbene dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G01500)  29.54 
 
 
480 aa  129  1.0000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.600702  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3417  dioxygenase, putative  29.93 
 
 
509 aa  127  5e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2809  carotenoid oxygenase  27.63 
 
 
497 aa  126  6e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.220593  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3944  Carotenoid oxygenase  29.17 
 
 
481 aa  124  4e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3359  carotenoid oxygenase  29.49 
 
 
502 aa  123  8e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.120702  normal  0.796578 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07062  conserved hypothetical protein  25.53 
 
 
555 aa  122  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1036  lignostilbene-alpha,beta-dioxygenase  25.05 
 
 
470 aa  119  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4537  carotenoid oxygenase  33.72 
 
 
411 aa  117  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.368379 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5321  Carotenoid oxygenase  28.88 
 
 
477 aa  117  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28795  predicted protein  27.37 
 
 
556 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.813535  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43374  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  25.87 
 
 
617 aa  109  8.000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0989754  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3688  carotenoid oxygenase  25.93 
 
 
485 aa  105  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0091  Carotenoid oxygenase  27.75 
 
 
477 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.848261  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>