118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_25111 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1646  retinal pigment epithelial membrane protein  63.88 
 
 
497 aa  671    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0248  lignostilbene-alpha,beta-dioxygenase and related enzyme-like  70.21 
 
 
489 aa  719    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0221  lignostilbene-alpha,beta-dioxygenase and related enzyme-like  72.23 
 
 
488 aa  730    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03601  retinal pigment epithelial membrane protein  64.09 
 
 
497 aa  673    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25111  retinal pigment epithelial membrane protein  100 
 
 
507 aa  1048    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03071  retinal pigment epithelial membrane protein  67.55 
 
 
495 aa  723    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03031  retinal pigment epithelial membrane protein  57.93 
 
 
494 aa  622  1e-177  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03131  retinal pigment epithelial membrane protein  58.16 
 
 
495 aa  618  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.608355  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03041  retinal pigment epithelial membrane protein  57.93 
 
 
494 aa  619  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0282  retinal pigment epithelial membrane protein  57.52 
 
 
494 aa  617  1e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0182948  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0196  Beta-carotene 15,15'-dioxygenase  47.27 
 
 
493 aa  451  1e-125  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1236  retinal pigment epithelial membrane protein  45.13 
 
 
510 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0229916  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3212  carotenoid oxygenase  44.92 
 
 
489 aa  438  1e-121  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.415925  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4402  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  42.33 
 
 
495 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000371573 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4340  Carotenoid oxygenase  42.13 
 
 
495 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0449  Carotenoid oxygenase  41.03 
 
 
491 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4222  Carotenoid oxygenase  41.41 
 
 
501 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0865656 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0013  Carotenoid oxygenase  32.36 
 
 
468 aa  227  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.768827  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0015  Carotenoid oxygenase  32.36 
 
 
468 aa  227  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_86865  predicted protein  31.64 
 
 
554 aa  220  6e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.241734 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5321  Carotenoid oxygenase  31.33 
 
 
477 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0203  carotenoid oxygenase  33.26 
 
 
464 aa  213  9e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.297924  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3710  retinal pigment epithelial membrane protein  31.07 
 
 
463 aa  210  6e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3688  carotenoid oxygenase  29.94 
 
 
485 aa  207  3e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2047  retinal pigment epithelial membrane protein  30.96 
 
 
765 aa  199  7e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.211058  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4841  Carotenoid oxygenase  30.89 
 
 
464 aa  195  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.659326 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3964  Carotenoid oxygenase  30.96 
 
 
486 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.99286  normal  0.591573 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3359  carotenoid oxygenase  28.27 
 
 
502 aa  187  5e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.120702  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30717  predicted protein  28.69 
 
 
533 aa  184  4.0000000000000006e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.990452 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2168  retinal pigment epithelial membrane protein  28.57 
 
 
472 aa  180  5.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.123356 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1535  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  30.5 
 
 
483 aa  177  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194369  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5477  putative carotenoid oxygenase  32.36 
 
 
467 aa  176  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4862  Beta-carotene 15,15'-monooxygenase  29.15 
 
 
470 aa  173  7.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.169022  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3417  dioxygenase, putative  29.53 
 
 
509 aa  172  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3794  carotenoid oxygenase  29.52 
 
 
464 aa  172  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0662225  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1272  carotenoid oxygenase  28.63 
 
 
487 aa  172  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.261404  hitchhiker  0.00803245 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1317  carotenoid oxygenase  32.92 
 
 
467 aa  171  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2446  twin-arginine translocation pathway signal  29.42 
 
 
517 aa  170  6e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000341259  normal  0.858746 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5644  carotenoid oxygenase  31.04 
 
 
478 aa  169  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.427984 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1216  carotenoid oxygenase  32.43 
 
 
467 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.548821 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3944  Carotenoid oxygenase  31.38 
 
 
481 aa  167  2.9999999999999998e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0091  Carotenoid oxygenase  28.57 
 
 
477 aa  168  2.9999999999999998e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.848261  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43490  predicted protein  27.57 
 
 
630 aa  167  2.9999999999999998e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.416955  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_48352  predicted protein  27.52 
 
 
551 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1536  carotenoid oxygenase  31.78 
 
 
467 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0771367  normal  0.379655 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1401  Carotenoid oxygenase  32.7 
 
 
467 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0352  Carotenoid oxygenase  25.16 
 
 
487 aa  160  7e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5459  Carotenoid oxygenase  28.21 
 
 
514 aa  159  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176097  normal  0.349671 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0441  carotenoid oxygenase  30.11 
 
 
460 aa  159  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.786971  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0359  Carotenoid oxygenase  25.38 
 
 
487 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.235865  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4867  carotenoid oxygenase  29.83 
 
 
451 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4956  carotenoid oxygenase  29.83 
 
 
451 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2656  carotenoid oxygenase  29.12 
 
 
477 aa  155  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3919  Carotenoid oxygenase  29.03 
 
 
508 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4033  Carotenoid oxygenase  29.03 
 
 
508 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.804116  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0935  Carotenoid oxygenase  25.11 
 
 
488 aa  154  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934106 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1008  carotenoid oxygenase  28.3 
 
 
498 aa  152  1e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0158946  normal  0.495511 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5235  carotenoid oxygenase  29.77 
 
 
451 aa  151  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.751022 
 
 
-
 
NC_003296  RS05214  dioxygenase signal peptide protein  30.12 
 
 
520 aa  150  4e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1036  lignostilbene-alpha,beta-dioxygenase  26.09 
 
 
470 aa  150  7e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0611  carotenoid oxygenase  28.3 
 
 
481 aa  148  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.951978 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10931  dioxygenase  26.71 
 
 
502 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5950  crocetin dialdehyde  28.78 
 
 
488 aa  147  4.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.444357  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4083  Carotenoid oxygenase  28.54 
 
 
472 aa  146  8.000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3098  carotenoid oxygenase  27.8 
 
 
496 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3158  carotenoid oxygenase  27.8 
 
 
496 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.350488 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119472  Carotenoid dioxygenase plastidic fusion protein, putative  26.99 
 
 
914 aa  145  2e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0452333  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2824  carotenoid oxygenase  29.96 
 
 
504 aa  144  3e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5460  carotenoid oxygenase  29.65 
 
 
459 aa  144  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.645484 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3118  carotenoid oxygenase  27.69 
 
 
496 aa  143  6e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.704266  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2946  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  27.97 
 
 
473 aa  142  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000652034  hitchhiker  0.000168571 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1332  carotenoid oxygenase  29.34 
 
 
444 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.447717 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1807  carotenoid oxygenase  27.81 
 
 
512 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.581411  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3952  Carotenoid oxygenase  26.71 
 
 
499 aa  135  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.273513  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0802  carotenoid oxygenase  25.68 
 
 
494 aa  133  6e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.957651  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4940  carotenoid oxygenase  26.08 
 
 
537 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.97423  normal  0.0157069 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3052  carotenoid oxygenase  25.39 
 
 
515 aa  131  3e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25051  hypothetical protein  100 
 
 
64 aa  131  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25081  hypothetical protein  100 
 
 
64 aa  131  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4053  Carotenoid oxygenase  27.18 
 
 
466 aa  131  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3399  retinal pigment epithelial membrane protein  27.22 
 
 
443 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.452417  normal  0.802561 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5723  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  28.93 
 
 
441 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00560936  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_4021  predicted protein  40.82 
 
 
163 aa  127  5e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.274127  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_3050  predicted protein  27.02 
 
 
467 aa  127  6e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.601284  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10667  dioxygenase  26.37 
 
 
501 aa  127  6e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.181912  normal  0.435726 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2111  carotenoid oxygenase  25.75 
 
 
480 aa  125  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.457029 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4595  carotenoid oxygenase  26.33 
 
 
479 aa  124  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01643  lignostilbene dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G01500)  27.57 
 
 
480 aa  122  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.600702  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2484  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  27.69 
 
 
461 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.217647  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0227  carotenoid oxygenase  26.58 
 
 
445 aa  120  7e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000205038 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07062  conserved hypothetical protein  25.3 
 
 
555 aa  119  9.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0281  carotenoid oxygenase  26.32 
 
 
445 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.772775  hitchhiker  0.000581153 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3058  carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase, putative  28.04 
 
 
443 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1562  putative dioxygenase  28.04 
 
 
443 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0219  carotenoid oxygenase  27 
 
 
445 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1233  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  28.04 
 
 
443 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0130033  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0635  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  28.04 
 
 
443 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.617766  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1459  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  28.04 
 
 
443 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0518  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  28.04 
 
 
443 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.615695  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2806  carotenoid oxygenase  26.11 
 
 
445 aa  118  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.561211  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>