132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2047 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_2047  retinal pigment epithelial membrane protein  100 
 
 		 765 aa  1588    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.211058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3710  retinal pigment epithelial membrane protein  52.56 
 
 		 463 aa  519  1e-146  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3794  carotenoid oxygenase  49.58 
 
 		 464 aa  467  9.999999999999999e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0662225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4841  Carotenoid oxygenase  49.68 
 
 		 464 aa  439  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.659326 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1535  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  41.53 
 
 		 483 aa  388  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194369  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1008  carotenoid oxygenase  37.78 
 
 		 498 aa  309  1.0000000000000001e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0158946  normal  0.495511 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5235  carotenoid oxygenase  39.46 
 
 		 451 aa  307  6e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.751022 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1272  carotenoid oxygenase  37.16 
 
 		 487 aa  306  9.000000000000001e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.261404  hitchhiker  0.00803245 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4867  carotenoid oxygenase  39.11 
 
 		 451 aa  306  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4956  carotenoid oxygenase  39.11 
 
 		 451 aa  306  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2656  carotenoid oxygenase  39.29 
 
 		 477 aa  303  1e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119472  Carotenoid dioxygenase plastidic fusion protein, putative  34.37 
 
 		 914 aa  298  3e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0452333  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5460  carotenoid oxygenase  37.65 
 
 		 459 aa  296  8e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645484 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3118  carotenoid oxygenase  37.01 
 
 		 496 aa  296  1e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.704266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3098  carotenoid oxygenase  36.8 
 
 		 496 aa  295  2e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3158  carotenoid oxygenase  36.8 
 
 		 496 aa  295  2e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.350488 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1332  carotenoid oxygenase  38.19 
 
 		 444 aa  292  1e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.447717 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5644  carotenoid oxygenase  38.38 
 
 		 478 aa  289  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.427984 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5477  putative carotenoid oxygenase  38.09 
 
 		 467 aa  288  2.9999999999999996e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10931  dioxygenase  35.14 
 
 		 502 aa  283  1e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1807  carotenoid oxygenase  35.6 
 
 		 512 aa  280  6e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.581411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0227  carotenoid oxygenase  36.31 
 
 		 445 aa  278  4e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000205038 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1216  carotenoid oxygenase  37.47 
 
 		 467 aa  276  9e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.548821 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0219  carotenoid oxygenase  36.52 
 
 		 445 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0281  carotenoid oxygenase  36.09 
 
 		 445 aa  274  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.772775  hitchhiker  0.000581153 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4940  carotenoid oxygenase  34.99 
 
 		 537 aa  273  7e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.97423  normal  0.0157069 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2806  carotenoid oxygenase  36.09 
 
 		 445 aa  273  8.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.561211  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0300  carotenoid oxygenase  36.09 
 
 		 445 aa  273  8.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473918  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1317  carotenoid oxygenase  37.26 
 
 		 467 aa  273  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0441  carotenoid oxygenase  34.96 
 
 		 460 aa  273  1e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.786971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2111  carotenoid oxygenase  34.7 
 
 		 480 aa  268  2e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.457029 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1401  Carotenoid oxygenase  36.13 
 
 		 467 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_3050  predicted protein  35.32 
 
 		 467 aa  266  8e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.601284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0352  Carotenoid oxygenase  32.68 
 
 		 487 aa  266  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2484  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  35.34 
 
 		 461 aa  265  3e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.217647  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3399  retinal pigment epithelial membrane protein  35.53 
 
 		 443 aa  264  4e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.452417  normal  0.802561 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1536  carotenoid oxygenase  35.76 
 
 		 467 aa  264  6e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0771367  normal  0.379655 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0359  Carotenoid oxygenase  32.03 
 
 		 487 aa  262  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.235865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2946  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  32.59 
 
 		 473 aa  254  6e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000652034  hitchhiker  0.000168571 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4595  carotenoid oxygenase  33.98 
 
 		 479 aa  253  7e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0935  Carotenoid oxygenase  29.83 
 
 		 488 aa  251  3e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934106 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10667  dioxygenase  32.77 
 
 		 501 aa  249  1e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.181912  normal  0.435726 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1698  carotenoid oxygenase  33.61 
 
 		 480 aa  239  1e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.459113  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3058  carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase, putative  33.91 
 
 		 443 aa  238  4e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1562  putative dioxygenase  33.91 
 
 		 443 aa  238  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1233  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  33.91 
 
 		 443 aa  238  4e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0130033  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0635  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  33.91 
 
 		 443 aa  238  4e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.617766  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1459  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  33.91 
 
 		 443 aa  238  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0518  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  33.91 
 
 		 443 aa  238  4e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.615695  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1236  retinal pigment epithelial membrane protein  32.83 
 
 		 510 aa  237  7e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0229916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3212  carotenoid oxygenase  31.83 
 
 		 489 aa  236  1.0000000000000001e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.415925  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0196  Beta-carotene 15,15'-dioxygenase  34.63 
 
 		 493 aa  236  2.0000000000000002e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0611  carotenoid oxygenase  32.29 
 
 		 481 aa  235  2.0000000000000002e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.951978 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5723  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  34.35 
 
 		 441 aa  236  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00560936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1428  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  33.48 
 
 		 443 aa  230  6e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3580  carotenoid oxygenase  33.54 
 
 		 469 aa  230  7e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4340  Carotenoid oxygenase  30.75 
 
 		 495 aa  228  4e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0449  Carotenoid oxygenase  31.85 
 
 		 491 aa  224  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4402  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  30.54 
 
 		 495 aa  225  3e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000371573 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5950  crocetin dialdehyde  29.94 
 
 		 488 aa  222  1.9999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.444357  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0802  carotenoid oxygenase  32.3 
 
 		 494 aa  221  3.9999999999999997e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.957651  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4222  Carotenoid oxygenase  31.2 
 
 		 501 aa  218  4e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0865656 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3269  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  30.32 
 
 		 419 aa  217  7e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6035  carotenoid oxygenase  31.32 
 
 		 479 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.96012  normal  0.0939223 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4053  Carotenoid oxygenase  31.14 
 
 		 466 aa  216  9.999999999999999e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0221  lignostilbene-alpha,beta-dioxygenase and related enzyme-like  31.61 
 
 		 488 aa  211  3e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0203  carotenoid oxygenase  34.07 
 
 		 464 aa  205  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.297924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0248  lignostilbene-alpha,beta-dioxygenase and related enzyme-like  29.7 
 
 		 489 aa  201  3e-50  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25111  retinal pigment epithelial membrane protein  30.96 
 
 		 507 aa  199  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03071  retinal pigment epithelial membrane protein  30.5 
 
 		 495 aa  196  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3944  Carotenoid oxygenase  32.64 
 
 		 481 aa  185  4.0000000000000006e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3952  Carotenoid oxygenase  28.97 
 
 		 499 aa  180  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.273513  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07062  conserved hypothetical protein  26.96 
 
 		 555 aa  179  2e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0013  Carotenoid oxygenase  29.96 
 
 		 468 aa  177  9e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.768827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0015  Carotenoid oxygenase  29.96 
 
 		 468 aa  177  9e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01643  lignostilbene dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G01500)  29.57 
 
 		 480 aa  176  9.999999999999999e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.600702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2446  twin-arginine translocation pathway signal  29.24 
 
 		 517 aa  177  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000341259  normal  0.858746 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3359  carotenoid oxygenase  29.06 
 
 		 502 aa  176  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.120702  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1646  retinal pigment epithelial membrane protein  27.74 
 
 		 497 aa  173  9e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2809  carotenoid oxygenase  30.5 
 
 		 497 aa  171  4e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.220593  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03601  retinal pigment epithelial membrane protein  27.54 
 
 		 497 aa  171  5e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03131  retinal pigment epithelial membrane protein  28.66 
 
 		 495 aa  171  6e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.608355  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03031  retinal pigment epithelial membrane protein  28.84 
 
 		 494 aa  170  1e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03041  retinal pigment epithelial membrane protein  28.22 
 
 		 494 aa  168  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0282  retinal pigment epithelial membrane protein  28.63 
 
 		 494 aa  167  5e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0182948  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05214  dioxygenase signal peptide protein  28.19 
 
 		 520 aa  164  5.0000000000000005e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5459  Carotenoid oxygenase  28.43 
 
 		 514 aa  161  4e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176097  normal  0.349671 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3919  Carotenoid oxygenase  27.52 
 
 		 508 aa  159  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4033  Carotenoid oxygenase  27.52 
 
 		 508 aa  159  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.804116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5321  Carotenoid oxygenase  28.42 
 
 		 477 aa  156  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0091  Carotenoid oxygenase  28.95 
 
 		 477 aa  155  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.848261  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3417  dioxygenase, putative  29.75 
 
 		 509 aa  155  4e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28795  predicted protein  27.93 
 
 		 556 aa  148  4.0000000000000006e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.813535  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4862  Beta-carotene 15,15'-monooxygenase  29.14 
 
 		 470 aa  147  6e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.169022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3964  Carotenoid oxygenase  29.18 
 
 		 486 aa  146  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.99286  normal  0.591573 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1036  lignostilbene-alpha,beta-dioxygenase  27.12 
 
 		 470 aa  145  2e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3688  carotenoid oxygenase  26.28 
 
 		 485 aa  143  9.999999999999999e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_48352  predicted protein  27.94 
 
 		 551 aa  143  9.999999999999999e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2824  carotenoid oxygenase  27.9 
 
 		 504 aa  142  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30717  predicted protein  27.48 
 
 		 533 aa  141  3.9999999999999997e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.990452 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>