120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3710 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_3710  retinal pigment epithelial membrane protein  100 
 
 
463 aa  963    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3794  carotenoid oxygenase  57.92 
 
 
464 aa  550  1e-155  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0662225  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2047  retinal pigment epithelial membrane protein  52.56 
 
 
765 aa  519  1e-146  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.211058  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4841  Carotenoid oxygenase  53.96 
 
 
464 aa  512  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.659326 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1535  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  44.47 
 
 
483 aa  425  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194369  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1008  carotenoid oxygenase  37.95 
 
 
498 aa  345  1e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0158946  normal  0.495511 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2656  carotenoid oxygenase  39.87 
 
 
477 aa  341  2e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1272  carotenoid oxygenase  38.43 
 
 
487 aa  328  1.0000000000000001e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.261404  hitchhiker  0.00803245 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5477  putative carotenoid oxygenase  40.81 
 
 
467 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1317  carotenoid oxygenase  39.87 
 
 
467 aa  325  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1216  carotenoid oxygenase  39.43 
 
 
467 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.548821 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1536  carotenoid oxygenase  39.61 
 
 
467 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0771367  normal  0.379655 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1401  Carotenoid oxygenase  38.85 
 
 
467 aa  317  3e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0441  carotenoid oxygenase  38.51 
 
 
460 aa  313  5.999999999999999e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.786971  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4867  carotenoid oxygenase  39.39 
 
 
451 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4956  carotenoid oxygenase  39.39 
 
 
451 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3118  carotenoid oxygenase  37.29 
 
 
496 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.704266  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3098  carotenoid oxygenase  37.08 
 
 
496 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3158  carotenoid oxygenase  37.08 
 
 
496 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.350488 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1332  carotenoid oxygenase  40.69 
 
 
444 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.447717 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5460  carotenoid oxygenase  40.35 
 
 
459 aa  301  1e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.645484 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5235  carotenoid oxygenase  39.18 
 
 
451 aa  301  1e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.751022 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1807  carotenoid oxygenase  38.08 
 
 
512 aa  301  2e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.581411  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2111  carotenoid oxygenase  37.78 
 
 
480 aa  298  1e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.457029 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0352  Carotenoid oxygenase  34.87 
 
 
487 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0281  carotenoid oxygenase  39.08 
 
 
445 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.772775  hitchhiker  0.000581153 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2806  carotenoid oxygenase  38.91 
 
 
445 aa  297  3e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.561211  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0300  carotenoid oxygenase  38.91 
 
 
445 aa  297  3e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473918  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0227  carotenoid oxygenase  38.65 
 
 
445 aa  297  3e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000205038 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0219  carotenoid oxygenase  38.73 
 
 
445 aa  296  8e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0359  Carotenoid oxygenase  34.43 
 
 
487 aa  294  2e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.235865  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4595  carotenoid oxygenase  36.33 
 
 
479 aa  292  1e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10931  dioxygenase  36.92 
 
 
502 aa  291  2e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0935  Carotenoid oxygenase  34.49 
 
 
488 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934106 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3399  retinal pigment epithelial membrane protein  38.46 
 
 
443 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.452417  normal  0.802561 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4940  carotenoid oxygenase  35.79 
 
 
537 aa  286  5e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.97423  normal  0.0157069 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5644  carotenoid oxygenase  37.58 
 
 
478 aa  284  3.0000000000000004e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.427984 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1698  carotenoid oxygenase  37.17 
 
 
480 aa  284  3.0000000000000004e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.459113  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5723  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  38.6 
 
 
441 aa  278  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00560936  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10667  dioxygenase  37 
 
 
501 aa  277  2e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.181912  normal  0.435726 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2484  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  35.97 
 
 
461 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.217647  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119472  Carotenoid dioxygenase plastidic fusion protein, putative  32.18 
 
 
914 aa  272  1e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0452333  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3058  carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase, putative  38.31 
 
 
443 aa  267  4e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1562  putative dioxygenase  38.31 
 
 
443 aa  267  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1233  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  38.31 
 
 
443 aa  267  4e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0130033  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0635  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  38.31 
 
 
443 aa  267  4e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.617766  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1459  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  38.31 
 
 
443 aa  267  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0518  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  38.31 
 
 
443 aa  267  4e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.615695  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6035  carotenoid oxygenase  35.23 
 
 
479 aa  263  6e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.96012  normal  0.0939223 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1428  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  37.88 
 
 
443 aa  259  7e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2946  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  35.9 
 
 
473 aa  257  3e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000652034  hitchhiker  0.000168571 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5950  crocetin dialdehyde  32.63 
 
 
488 aa  256  7e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.444357  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_3050  predicted protein  33.54 
 
 
467 aa  253  7e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.601284  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3580  carotenoid oxygenase  34.14 
 
 
469 aa  249  9e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3269  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  34.85 
 
 
419 aa  242  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0449  Carotenoid oxygenase  31.36 
 
 
491 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0611  carotenoid oxygenase  31.36 
 
 
481 aa  234  3e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.951978 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1236  retinal pigment epithelial membrane protein  31.72 
 
 
510 aa  229  6e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0229916  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0802  carotenoid oxygenase  30.43 
 
 
494 aa  229  1e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.957651  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3212  carotenoid oxygenase  31.26 
 
 
489 aa  228  1e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.415925  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4053  Carotenoid oxygenase  33.95 
 
 
466 aa  228  2e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4402  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  32.46 
 
 
495 aa  225  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000371573 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4340  Carotenoid oxygenase  32.02 
 
 
495 aa  222  9e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0196  Beta-carotene 15,15'-dioxygenase  30.94 
 
 
493 aa  215  1.9999999999999998e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0203  carotenoid oxygenase  35.14 
 
 
464 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.297924  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0221  lignostilbene-alpha,beta-dioxygenase and related enzyme-like  32.22 
 
 
488 aa  210  4e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25111  retinal pigment epithelial membrane protein  31.07 
 
 
507 aa  210  5e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4033  Carotenoid oxygenase  31.63 
 
 
508 aa  206  7e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.804116  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3919  Carotenoid oxygenase  31.63 
 
 
508 aa  206  7e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03071  retinal pigment epithelial membrane protein  31.46 
 
 
495 aa  205  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0248  lignostilbene-alpha,beta-dioxygenase and related enzyme-like  31.16 
 
 
489 aa  204  2e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4222  Carotenoid oxygenase  30.96 
 
 
501 aa  205  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0865656 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2809  carotenoid oxygenase  31.61 
 
 
497 aa  204  3e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.220593  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01643  lignostilbene dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G01500)  30.61 
 
 
480 aa  202  9.999999999999999e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.600702  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07062  conserved hypothetical protein  27.8 
 
 
555 aa  191  2.9999999999999997e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2446  twin-arginine translocation pathway signal  29.26 
 
 
517 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000341259  normal  0.858746 
 
 
-
 
NC_003296  RS05214  dioxygenase signal peptide protein  29.4 
 
 
520 aa  178  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4862  Beta-carotene 15,15'-monooxygenase  30.8 
 
 
470 aa  179  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.169022  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5459  Carotenoid oxygenase  30.85 
 
 
514 aa  179  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176097  normal  0.349671 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1646  retinal pigment epithelial membrane protein  27.77 
 
 
497 aa  175  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03601  retinal pigment epithelial membrane protein  27.77 
 
 
497 aa  175  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03131  retinal pigment epithelial membrane protein  27.88 
 
 
495 aa  173  5e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.608355  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3417  dioxygenase, putative  27.35 
 
 
509 aa  171  4e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_48352  predicted protein  29.13 
 
 
551 aa  169  8e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0282  retinal pigment epithelial membrane protein  27.67 
 
 
494 aa  169  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0182948  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03031  retinal pigment epithelial membrane protein  27.71 
 
 
494 aa  168  2e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03041  retinal pigment epithelial membrane protein  27.04 
 
 
494 aa  166  8e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3952  Carotenoid oxygenase  29.5 
 
 
499 aa  165  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.273513  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28795  predicted protein  27.36 
 
 
556 aa  162  2e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.813535  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3944  Carotenoid oxygenase  31.24 
 
 
481 aa  161  3e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0013  Carotenoid oxygenase  28.73 
 
 
468 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.768827  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0015  Carotenoid oxygenase  28.73 
 
 
468 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3964  Carotenoid oxygenase  29.41 
 
 
486 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.99286  normal  0.591573 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3688  carotenoid oxygenase  28.32 
 
 
485 aa  158  2e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3359  carotenoid oxygenase  28.4 
 
 
502 aa  153  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.120702  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2168  retinal pigment epithelial membrane protein  27.12 
 
 
472 aa  151  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.123356 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5321  Carotenoid oxygenase  27.92 
 
 
477 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30717  predicted protein  25.89 
 
 
533 aa  144  4e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.990452 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1036  lignostilbene-alpha,beta-dioxygenase  26.18 
 
 
470 aa  141  3e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3052  carotenoid oxygenase  26.69 
 
 
515 aa  139  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>