114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4940 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3098  carotenoid oxygenase  68.53 
 
 		 496 aa  711    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3158  carotenoid oxygenase  68.53 
 
 		 496 aa  711    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.350488 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4940  carotenoid oxygenase  100 
 
 		 537 aa  1102    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.97423  normal  0.0157069 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3118  carotenoid oxygenase  68.34 
 
 		 496 aa  710    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.704266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1807  carotenoid oxygenase  84.73 
 
 		 512 aa  939    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.581411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10931  dioxygenase  71.64 
 
 		 502 aa  781    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1008  carotenoid oxygenase  49.15 
 
 		 498 aa  503  1e-141  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0158946  normal  0.495511 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1272  carotenoid oxygenase  52.62 
 
 		 487 aa  491  1e-137  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.261404  hitchhiker  0.00803245 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1535  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  41.83 
 
 		 483 aa  357  3.9999999999999996e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194369  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3710  retinal pigment epithelial membrane protein  35.79 
 
 		 463 aa  286  5.999999999999999e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2047  retinal pigment epithelial membrane protein  34.99 
 
 		 765 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.211058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3794  carotenoid oxygenase  34.53 
 
 		 464 aa  262  1e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0662225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4841  Carotenoid oxygenase  33.67 
 
 		 464 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.659326 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5235  carotenoid oxygenase  31.69 
 
 		 451 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.751022 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2946  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  30.86 
 
 		 473 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000652034  hitchhiker  0.000168571 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4867  carotenoid oxygenase  30.86 
 
 		 451 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4956  carotenoid oxygenase  30.86 
 
 		 451 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5460  carotenoid oxygenase  31.67 
 
 		 459 aa  179  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645484 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0352  Carotenoid oxygenase  25.84 
 
 		 487 aa  179  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0359  Carotenoid oxygenase  25.65 
 
 		 487 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.235865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2484  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  30.83 
 
 		 461 aa  173  5e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.217647  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3212  carotenoid oxygenase  27.2 
 
 		 489 aa  173  5.999999999999999e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.415925  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2656  carotenoid oxygenase  29.32 
 
 		 477 aa  173  5.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2806  carotenoid oxygenase  29.72 
 
 		 445 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.561211  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0300  carotenoid oxygenase  29.72 
 
 		 445 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473918  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3399  retinal pigment epithelial membrane protein  29.96 
 
 		 443 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.452417  normal  0.802561 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0281  carotenoid oxygenase  30 
 
 		 445 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.772775  hitchhiker  0.000581153 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3058  carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase, putative  30.45 
 
 		 443 aa  171  3e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1562  putative dioxygenase  30.45 
 
 		 443 aa  171  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1233  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  30.45 
 
 		 443 aa  171  3e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0130033  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0635  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  30.45 
 
 		 443 aa  171  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.617766  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1459  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  30.45 
 
 		 443 aa  171  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0518  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  30.45 
 
 		 443 aa  171  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.615695  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4053  Carotenoid oxygenase  30.56 
 
 		 466 aa  171  4e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1332  carotenoid oxygenase  30.31 
 
 		 444 aa  170  6e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.447717 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0449  Carotenoid oxygenase  26.87 
 
 		 491 aa  170  6e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4595  carotenoid oxygenase  30.66 
 
 		 479 aa  170  7e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5644  carotenoid oxygenase  30.08 
 
 		 478 aa  169  9e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.427984 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2111  carotenoid oxygenase  31.49 
 
 		 480 aa  169  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.457029 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4402  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  28.37 
 
 		 495 aa  167  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000371573 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1428  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  30.4 
 
 		 443 aa  167  5e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4340  Carotenoid oxygenase  26.62 
 
 		 495 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0935  Carotenoid oxygenase  25.86 
 
 		 488 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934106 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5723  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  30.77 
 
 		 441 aa  165  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00560936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0441  carotenoid oxygenase  30.1 
 
 		 460 aa  164  4.0000000000000004e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.786971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1236  retinal pigment epithelial membrane protein  27.44 
 
 		 510 aa  162  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0229916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0611  carotenoid oxygenase  27.9 
 
 		 481 aa  161  3e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.951978 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0227  carotenoid oxygenase  28.77 
 
 		 445 aa  161  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000205038 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1698  carotenoid oxygenase  29.08 
 
 		 480 aa  159  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.459113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0219  carotenoid oxygenase  28.74 
 
 		 445 aa  159  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1216  carotenoid oxygenase  30.66 
 
 		 467 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.548821 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119472  Carotenoid dioxygenase plastidic fusion protein, putative  26.28 
 
 		 914 aa  154  4e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0452333  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_3050  predicted protein  28.46 
 
 		 467 aa  154  4e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.601284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5477  putative carotenoid oxygenase  30.17 
 
 		 467 aa  153  7e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10667  dioxygenase  29.14 
 
 		 501 aa  152  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.181912  normal  0.435726 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1317  carotenoid oxygenase  30 
 
 		 467 aa  150  7e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6035  carotenoid oxygenase  28.88 
 
 		 479 aa  147  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.96012  normal  0.0939223 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0196  Beta-carotene 15,15'-dioxygenase  27.01 
 
 		 493 aa  145  1e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2446  twin-arginine translocation pathway signal  28.69 
 
 		 517 aa  144  5e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000341259  normal  0.858746 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1401  Carotenoid oxygenase  29.3 
 
 		 467 aa  143  6e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0203  carotenoid oxygenase  28.83 
 
 		 464 aa  143  8e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.297924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3269  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  28.68 
 
 		 419 aa  142  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5950  crocetin dialdehyde  24.67 
 
 		 488 aa  141  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.444357  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1536  carotenoid oxygenase  29.06 
 
 		 467 aa  140  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0771367  normal  0.379655 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0802  carotenoid oxygenase  26.55 
 
 		 494 aa  138  3.0000000000000003e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.957651  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03071  retinal pigment epithelial membrane protein  24.75 
 
 		 495 aa  136  9e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0221  lignostilbene-alpha,beta-dioxygenase and related enzyme-like  26.24 
 
 		 488 aa  134  5e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25111  retinal pigment epithelial membrane protein  26.08 
 
 		 507 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4222  Carotenoid oxygenase  26.1 
 
 		 501 aa  131  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0865656 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2809  carotenoid oxygenase  27.15 
 
 		 497 aa  129  9.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.220593  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3580  carotenoid oxygenase  26.82 
 
 		 469 aa  127  7e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3359  carotenoid oxygenase  27.26 
 
 		 502 aa  126  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.120702  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0248  lignostilbene-alpha,beta-dioxygenase and related enzyme-like  25.48 
 
 		 489 aa  123  7e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4083  Carotenoid oxygenase  28.68 
 
 		 472 aa  122  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07062  conserved hypothetical protein  23.93 
 
 		 555 aa  118  3e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5459  Carotenoid oxygenase  26.47 
 
 		 514 aa  117  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176097  normal  0.349671 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01643  lignostilbene dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G01500)  26.22 
 
 		 480 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.600702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3919  Carotenoid oxygenase  25.92 
 
 		 508 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4033  Carotenoid oxygenase  25.92 
 
 		 508 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.804116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_48352  predicted protein  25.77 
 
 		 551 aa  113  1.0000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1646  retinal pigment epithelial membrane protein  23.38 
 
 		 497 aa  111  3e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03601  retinal pigment epithelial membrane protein  23.38 
 
 		 497 aa  110  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0282  retinal pigment epithelial membrane protein  24.44 
 
 		 494 aa  110  8.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0182948  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3417  dioxygenase, putative  26.99 
 
 		 509 aa  108  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03031  retinal pigment epithelial membrane protein  24.6 
 
 		 494 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5321  Carotenoid oxygenase  25.1 
 
 		 477 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4537  carotenoid oxygenase  29.45 
 
 		 411 aa  108  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.368379 
 
 
-
 
NC_003296  RS05214  dioxygenase signal peptide protein  26.1 
 
 		 520 aa  107  8e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03131  retinal pigment epithelial membrane protein  24.04 
 
 		 495 aa  106  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.608355  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3964  Carotenoid oxygenase  26.49 
 
 		 486 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.99286  normal  0.591573 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03041  retinal pigment epithelial membrane protein  24.25 
 
 		 494 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43374  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  24.44 
 
 		 617 aa  105  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0989754  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4862  Beta-carotene 15,15'-monooxygenase  26.15 
 
 		 470 aa  104  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.169022  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3944  Carotenoid oxygenase  26.87 
 
 		 481 aa  103  6e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0015  Carotenoid oxygenase  24.39 
 
 		 468 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0013  Carotenoid oxygenase  24.39 
 
 		 468 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.768827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2824  carotenoid oxygenase  25.2 
 
 		 504 aa  94.4  5e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2168  retinal pigment epithelial membrane protein  25.41 
 
 		 472 aa  92.4  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.123356 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3952  Carotenoid oxygenase  23.89 
 
 		 499 aa  92  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.273513  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3688  carotenoid oxygenase  23.77 
 
 		 485 aa  91.3  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>