119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1646 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1646  retinal pigment epithelial membrane protein  100 
 
 		 497 aa  1022    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0248  lignostilbene-alpha,beta-dioxygenase and related enzyme-like  64.3 
 
 		 489 aa  672    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0221  lignostilbene-alpha,beta-dioxygenase and related enzyme-like  63.41 
 
 		 488 aa  666    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0282  retinal pigment epithelial membrane protein  64.79 
 
 		 494 aa  649    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0182948  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03031  retinal pigment epithelial membrane protein  64.17 
 
 		 494 aa  654    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03131  retinal pigment epithelial membrane protein  63.31 
 
 		 495 aa  650    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.608355  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03601  retinal pigment epithelial membrane protein  99.4 
 
 		 497 aa  1017    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25111  retinal pigment epithelial membrane protein  63.88 
 
 		 507 aa  671    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03041  retinal pigment epithelial membrane protein  65 
 
 		 494 aa  650    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03071  retinal pigment epithelial membrane protein  68.33 
 
 		 495 aa  710    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0196  Beta-carotene 15,15'-dioxygenase  45.1 
 
 		 493 aa  432  1e-120  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1236  retinal pigment epithelial membrane protein  44.14 
 
 		 510 aa  426  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0229916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3212  carotenoid oxygenase  45.04 
 
 		 489 aa  422  1e-117  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.415925  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4222  Carotenoid oxygenase  41.11 
 
 		 501 aa  405  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0865656 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4340  Carotenoid oxygenase  42.68 
 
 		 495 aa  401  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4402  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  42.28 
 
 		 495 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000371573 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0449  Carotenoid oxygenase  40.69 
 
 		 491 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_86865  predicted protein  29.53 
 
 		 554 aa  232  1e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.241734 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3688  carotenoid oxygenase  30.63 
 
 		 485 aa  217  4e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0013  Carotenoid oxygenase  31.06 
 
 		 468 aa  208  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.768827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0015  Carotenoid oxygenase  31.06 
 
 		 468 aa  208  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2168  retinal pigment epithelial membrane protein  30.72 
 
 		 472 aa  203  5e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.123356 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30717  predicted protein  29.69 
 
 		 533 aa  202  1.9999999999999998e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.990452 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0203  carotenoid oxygenase  29.46 
 
 		 464 aa  199  7.999999999999999e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.297924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5321  Carotenoid oxygenase  28.78 
 
 		 477 aa  196  9e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3944  Carotenoid oxygenase  29.39 
 
 		 481 aa  186  1.0000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3964  Carotenoid oxygenase  28.83 
 
 		 486 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.99286  normal  0.591573 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3359  carotenoid oxygenase  26.53 
 
 		 502 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.120702  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3417  dioxygenase, putative  27.37 
 
 		 509 aa  178  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3710  retinal pigment epithelial membrane protein  27.77 
 
 		 463 aa  175  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2047  retinal pigment epithelial membrane protein  27.74 
 
 		 765 aa  173  5e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.211058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0359  Carotenoid oxygenase  27.27 
 
 		 487 aa  172  9e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.235865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0352  Carotenoid oxygenase  27.06 
 
 		 487 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2446  twin-arginine translocation pathway signal  27.02 
 
 		 517 aa  169  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000341259  normal  0.858746 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1036  lignostilbene-alpha,beta-dioxygenase  27.86 
 
 		 470 aa  167  2.9999999999999998e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5644  carotenoid oxygenase  27.63 
 
 		 478 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.427984 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2656  carotenoid oxygenase  27.72 
 
 		 477 aa  165  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5477  putative carotenoid oxygenase  29.11 
 
 		 467 aa  164  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1216  carotenoid oxygenase  29.14 
 
 		 467 aa  163  6e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.548821 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4841  Carotenoid oxygenase  27.49 
 
 		 464 aa  161  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.659326 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43490  predicted protein  26.73 
 
 		 630 aa  160  5e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.416955  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_48352  predicted protein  27.25 
 
 		 551 aa  159  1e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1401  Carotenoid oxygenase  28.87 
 
 		 467 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0935  Carotenoid oxygenase  27.37 
 
 		 488 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934106 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1317  carotenoid oxygenase  28.51 
 
 		 467 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4862  Beta-carotene 15,15'-monooxygenase  26.61 
 
 		 470 aa  156  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.169022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0441  carotenoid oxygenase  26.6 
 
 		 460 aa  156  6e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.786971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0091  Carotenoid oxygenase  25 
 
 		 477 aa  155  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.848261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1536  carotenoid oxygenase  27.72 
 
 		 467 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0771367  normal  0.379655 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2824  carotenoid oxygenase  27.8 
 
 		 504 aa  154  4e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5950  crocetin dialdehyde  28.18 
 
 		 488 aa  152  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.444357  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5459  Carotenoid oxygenase  25.61 
 
 		 514 aa  149  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176097  normal  0.349671 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_4021  predicted protein  46.26 
 
 		 163 aa  147  3e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.274127  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05214  dioxygenase signal peptide protein  27.33 
 
 		 520 aa  145  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3919  Carotenoid oxygenase  26.33 
 
 		 508 aa  144  4e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4033  Carotenoid oxygenase  26.33 
 
 		 508 aa  144  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.804116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4083  Carotenoid oxygenase  24.59 
 
 		 472 aa  142  1.9999999999999998e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3952  Carotenoid oxygenase  25.87 
 
 		 499 aa  141  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.273513  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1272  carotenoid oxygenase  25.56 
 
 		 487 aa  140  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.261404  hitchhiker  0.00803245 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4867  carotenoid oxygenase  25.42 
 
 		 451 aa  140  6e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4956  carotenoid oxygenase  25.42 
 
 		 451 aa  140  6e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5460  carotenoid oxygenase  26.22 
 
 		 459 aa  140  7e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645484 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119472  Carotenoid dioxygenase plastidic fusion protein, putative  25.89 
 
 		 914 aa  140  7e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0452333  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5235  carotenoid oxygenase  25.42 
 
 		 451 aa  138  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.751022 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1332  carotenoid oxygenase  26.01 
 
 		 444 aa  138  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.447717 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5723  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  25.84 
 
 		 441 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00560936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1535  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  25.47 
 
 		 483 aa  136  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194369  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0611  carotenoid oxygenase  26.4 
 
 		 481 aa  134  5e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.951978 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3794  carotenoid oxygenase  26.31 
 
 		 464 aa  130  5.0000000000000004e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0662225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0802  carotenoid oxygenase  25.25 
 
 		 494 aa  130  6e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.957651  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4053  Carotenoid oxygenase  25.66 
 
 		 466 aa  130  8.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01643  lignostilbene dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G01500)  27.57 
 
 		 480 aa  125  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.600702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1244  carotenoid oxygenase  30.06 
 
 		 556 aa  124  5e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0442261  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3066  Carotenoid oxygenase  30.06 
 
 		 558 aa  124  5e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.061004  hitchhiker  0.0000000132751 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3052  carotenoid oxygenase  24.9 
 
 		 515 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1288  carotenoid oxygenase  30.06 
 
 		 554 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.528505  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1322  carotenoid oxygenase  30.06 
 
 		 556 aa  121  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487019 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3098  carotenoid oxygenase  25.53 
 
 		 496 aa  118  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3158  carotenoid oxygenase  25.53 
 
 		 496 aa  118  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.350488 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3118  carotenoid oxygenase  25.53 
 
 		 496 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.704266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28795  predicted protein  22.87 
 
 		 556 aa  114  3e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.813535  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37960  predicted protein  25.2 
 
 		 512 aa  114  4.0000000000000004e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3399  retinal pigment epithelial membrane protein  23.46 
 
 		 443 aa  114  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.452417  normal  0.802561 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_3050  predicted protein  25.1 
 
 		 467 aa  114  5e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.601284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2946  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  23.4 
 
 		 473 aa  114  6e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000652034  hitchhiker  0.000168571 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1008  carotenoid oxygenase  24.54 
 
 		 498 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0158946  normal  0.495511 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0281  carotenoid oxygenase  23.34 
 
 		 445 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.772775  hitchhiker  0.000581153 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4940  carotenoid oxygenase  23.38 
 
 		 537 aa  111  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.97423  normal  0.0157069 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07062  conserved hypothetical protein  23.05 
 
 		 555 aa  110  4.0000000000000004e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0219  carotenoid oxygenase  24.5 
 
 		 445 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0227  carotenoid oxygenase  24.1 
 
 		 445 aa  110  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000205038 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2806  carotenoid oxygenase  23.14 
 
 		 445 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.561211  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0300  carotenoid oxygenase  23.14 
 
 		 445 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473918  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3580  carotenoid oxygenase  26.76 
 
 		 469 aa  109  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1807  carotenoid oxygenase  24.64 
 
 		 512 aa  107  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.581411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4595  carotenoid oxygenase  23.53 
 
 		 479 aa  105  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3058  carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase, putative  22.27 
 
 		 443 aa  104  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1562  putative dioxygenase  22.27 
 
 		 443 aa  104  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0635  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  22.27 
 
 		 443 aa  104  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.617766  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1459  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  22.27 
 
 		 443 aa  104  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>