116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2168 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_2168  retinal pigment epithelial membrane protein  100 
 
 		 472 aa  981    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.123356 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3688  carotenoid oxygenase  65.35 
 
 		 485 aa  659    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5321  Carotenoid oxygenase  59.37 
 
 		 477 aa  590  1e-167  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0015  Carotenoid oxygenase  58.01 
 
 		 468 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0013  Carotenoid oxygenase  58.01 
 
 		 468 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.768827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3964  Carotenoid oxygenase  53.36 
 
 		 486 aa  511  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.99286  normal  0.591573 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0196  Beta-carotene 15,15'-dioxygenase  36.38 
 
 		 493 aa  248  2e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5459  Carotenoid oxygenase  31.77 
 
 		 514 aa  245  9.999999999999999e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176097  normal  0.349671 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3212  carotenoid oxygenase  31.28 
 
 		 489 aa  226  6e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.415925  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4402  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  33.55 
 
 		 495 aa  223  8e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000371573 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4340  Carotenoid oxygenase  33.33 
 
 		 495 aa  222  9e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1236  retinal pigment epithelial membrane protein  30.88 
 
 		 510 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0229916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0203  carotenoid oxygenase  33.7 
 
 		 464 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.297924  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3417  dioxygenase, putative  30.91 
 
 		 509 aa  210  4e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03071  retinal pigment epithelial membrane protein  31.75 
 
 		 495 aa  208  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03601  retinal pigment epithelial membrane protein  30.93 
 
 		 497 aa  206  1e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0221  lignostilbene-alpha,beta-dioxygenase and related enzyme-like  30.18 
 
 		 488 aa  205  2e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0449  Carotenoid oxygenase  30.97 
 
 		 491 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0248  lignostilbene-alpha,beta-dioxygenase and related enzyme-like  30.17 
 
 		 489 aa  204  4e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2446  twin-arginine translocation pathway signal  31.07 
 
 		 517 aa  204  4e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000341259  normal  0.858746 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1646  retinal pigment epithelial membrane protein  30.72 
 
 		 497 aa  203  5e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4222  Carotenoid oxygenase  31.95 
 
 		 501 aa  203  5e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0865656 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3359  carotenoid oxygenase  30.53 
 
 		 502 aa  193  6e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.120702  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3944  Carotenoid oxygenase  30.29 
 
 		 481 aa  186  7e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0282  retinal pigment epithelial membrane protein  28.48 
 
 		 494 aa  185  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0182948  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2824  carotenoid oxygenase  29.87 
 
 		 504 aa  185  2.0000000000000003e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03031  retinal pigment epithelial membrane protein  27.52 
 
 		 494 aa  185  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03041  retinal pigment epithelial membrane protein  28.08 
 
 		 494 aa  184  3e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0359  Carotenoid oxygenase  30.17 
 
 		 487 aa  180  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.235865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25111  retinal pigment epithelial membrane protein  28.57 
 
 		 507 aa  180  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0352  Carotenoid oxygenase  29.55 
 
 		 487 aa  179  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03131  retinal pigment epithelial membrane protein  28.13 
 
 		 495 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.608355  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2656  carotenoid oxygenase  27.73 
 
 		 477 aa  168  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05214  dioxygenase signal peptide protein  26.9 
 
 		 520 aa  162  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3919  Carotenoid oxygenase  25.73 
 
 		 508 aa  162  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4033  Carotenoid oxygenase  25.73 
 
 		 508 aa  162  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.804116  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3952  Carotenoid oxygenase  27.41 
 
 		 499 aa  162  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.273513  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4841  Carotenoid oxygenase  29.81 
 
 		 464 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.659326 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0935  Carotenoid oxygenase  28.13 
 
 		 488 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934106 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1322  carotenoid oxygenase  26.68 
 
 		 556 aa  154  4e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487019 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1288  carotenoid oxygenase  26.59 
 
 		 554 aa  153  7e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.528505  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28795  predicted protein  27.45 
 
 		 556 aa  152  8.999999999999999e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.813535  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1244  carotenoid oxygenase  26.49 
 
 		 556 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0442261  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0091  Carotenoid oxygenase  26.92 
 
 		 477 aa  152  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.848261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3710  retinal pigment epithelial membrane protein  27.12 
 
 		 463 aa  151  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3052  carotenoid oxygenase  26.18 
 
 		 515 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4862  Beta-carotene 15,15'-monooxygenase  27.49 
 
 		 470 aa  147  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.169022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4083  Carotenoid oxygenase  25.87 
 
 		 472 aa  147  4.0000000000000006e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0441  carotenoid oxygenase  27.07 
 
 		 460 aa  145  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.786971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5723  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  28.92 
 
 		 441 aa  144  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00560936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3066  Carotenoid oxygenase  31.52 
 
 		 558 aa  144  4e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.061004  hitchhiker  0.0000000132751 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1535  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  26.46 
 
 		 483 aa  139  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194369  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0611  carotenoid oxygenase  26.12 
 
 		 481 aa  138  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.951978 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30717  predicted protein  26.95 
 
 		 533 aa  138  2e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.990452 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2047  retinal pigment epithelial membrane protein  25.56 
 
 		 765 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.211058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2111  carotenoid oxygenase  28.57 
 
 		 480 aa  136  8e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.457029 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1036  lignostilbene-alpha,beta-dioxygenase  27 
 
 		 470 aa  135  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5477  putative carotenoid oxygenase  26.9 
 
 		 467 aa  134  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1536  carotenoid oxygenase  26.25 
 
 		 467 aa  131  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0771367  normal  0.379655 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5644  carotenoid oxygenase  26.37 
 
 		 478 aa  131  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.427984 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5460  carotenoid oxygenase  29.11 
 
 		 459 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645484 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4867  carotenoid oxygenase  27.9 
 
 		 451 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3794  carotenoid oxygenase  27.99 
 
 		 464 aa  130  5.0000000000000004e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0662225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4956  carotenoid oxygenase  27.9 
 
 		 451 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5235  carotenoid oxygenase  27.9 
 
 		 451 aa  130  6e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.751022 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5950  crocetin dialdehyde  25.47 
 
 		 488 aa  129  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.444357  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2946  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  26.49 
 
 		 473 aa  127  6e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000652034  hitchhiker  0.000168571 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1216  carotenoid oxygenase  26.11 
 
 		 467 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.548821 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1401  Carotenoid oxygenase  25.88 
 
 		 467 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48408  predicted protein  26.85 
 
 		 577 aa  124  4e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1317  carotenoid oxygenase  25.94 
 
 		 467 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4595  carotenoid oxygenase  27.24 
 
 		 479 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43490  predicted protein  23.45 
 
 		 630 aa  117  5e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.416955  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1332  carotenoid oxygenase  27.33 
 
 		 444 aa  116  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.447717 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1698  carotenoid oxygenase  25.46 
 
 		 480 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.459113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_48352  predicted protein  24.24 
 
 		 551 aa  109  1e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6035  carotenoid oxygenase  24 
 
 		 479 aa  109  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.96012  normal  0.0939223 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2809  carotenoid oxygenase  23.01 
 
 		 497 aa  107  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.220593  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4053  Carotenoid oxygenase  24.95 
 
 		 466 aa  107  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2484  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  25.67 
 
 		 461 aa  107  5e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.217647  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3118  carotenoid oxygenase  26.34 
 
 		 496 aa  106  9e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.704266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3098  carotenoid oxygenase  26.34 
 
 		 496 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3158  carotenoid oxygenase  26.34 
 
 		 496 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.350488 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01643  lignostilbene dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G01500)  25.96 
 
 		 480 aa  105  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.600702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0802  carotenoid oxygenase  23.59 
 
 		 494 aa  104  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.957651  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_4021  predicted protein  38.31 
 
 		 163 aa  103  9e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.274127  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_86865  predicted protein  24.24 
 
 		 554 aa  102  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.241734 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1807  carotenoid oxygenase  25.74 
 
 		 512 aa  101  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.581411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3580  carotenoid oxygenase  25.05 
 
 		 469 aa  98.6  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10931  dioxygenase  26.25 
 
 		 502 aa  98.2  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3058  carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase, putative  26.24 
 
 		 443 aa  97.8  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1562  putative dioxygenase  26.24 
 
 		 443 aa  97.8  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3399  retinal pigment epithelial membrane protein  26.1 
 
 		 443 aa  97.4  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.452417  normal  0.802561 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1233  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  26.24 
 
 		 443 aa  97.8  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0130033  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0635  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  26.24 
 
 		 443 aa  97.8  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.617766  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1428  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  25.93 
 
 		 443 aa  97.4  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1459  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  26.24 
 
 		 443 aa  97.8  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0518  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  26.24 
 
 		 443 aa  97.8  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.615695  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07062  conserved hypothetical protein  27.05 
 
 		 555 aa  97.4  5e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1008  carotenoid oxygenase  25 
 
 		 498 aa  93.6  6e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0158946  normal  0.495511 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>