104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1288 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_1244  carotenoid oxygenase  96.58 
 
 		 556 aa  1107    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0442261  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1288  carotenoid oxygenase  100 
 
 		 554 aa  1147    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.528505  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1322  carotenoid oxygenase  96.4 
 
 		 556 aa  1105    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487019 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3066  Carotenoid oxygenase  96.42 
 
 		 558 aa  1095    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.061004  hitchhiker  0.0000000132751 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3052  carotenoid oxygenase  51.86 
 
 		 515 aa  550  1e-155  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3952  Carotenoid oxygenase  32.28 
 
 		 499 aa  273  7e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.273513  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3919  Carotenoid oxygenase  31.5 
 
 		 508 aa  269  1e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4033  Carotenoid oxygenase  31.5 
 
 		 508 aa  269  1e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.804116  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05214  dioxygenase signal peptide protein  36.76 
 
 		 520 aa  251  3e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2824  carotenoid oxygenase  34.55 
 
 		 504 aa  187  3e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2168  retinal pigment epithelial membrane protein  26.59 
 
 		 472 aa  153  8.999999999999999e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.123356 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0015  Carotenoid oxygenase  24.57 
 
 		 468 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0013  Carotenoid oxygenase  24.57 
 
 		 468 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.768827  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3688  carotenoid oxygenase  25.23 
 
 		 485 aa  144  6e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2446  twin-arginine translocation pathway signal  25.48 
 
 		 517 aa  141  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000341259  normal  0.858746 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3964  Carotenoid oxygenase  32.01 
 
 		 486 aa  141  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.99286  normal  0.591573 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3417  dioxygenase, putative  33.11 
 
 		 509 aa  140  6e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0203  carotenoid oxygenase  29.97 
 
 		 464 aa  140  8.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.297924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4340  Carotenoid oxygenase  31.03 
 
 		 495 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4402  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  25.23 
 
 		 495 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000371573 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5321  Carotenoid oxygenase  31.23 
 
 		 477 aa  134  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4862  Beta-carotene 15,15'-monooxygenase  29.64 
 
 		 470 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.169022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1236  retinal pigment epithelial membrane protein  28.57 
 
 		 510 aa  130  6e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0229916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1401  Carotenoid oxygenase  26.67 
 
 		 467 aa  127  7e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0196  Beta-carotene 15,15'-dioxygenase  29.54 
 
 		 493 aa  126  1e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3212  carotenoid oxygenase  27.36 
 
 		 489 aa  126  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.415925  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1646  retinal pigment epithelial membrane protein  30.06 
 
 		 497 aa  122  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1036  lignostilbene-alpha,beta-dioxygenase  27.1 
 
 		 470 aa  122  9.999999999999999e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03601  retinal pigment epithelial membrane protein  30.16 
 
 		 497 aa  122  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0449  Carotenoid oxygenase  28.75 
 
 		 491 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1216  carotenoid oxygenase  25.93 
 
 		 467 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.548821 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03071  retinal pigment epithelial membrane protein  29.72 
 
 		 495 aa  120  7e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0441  carotenoid oxygenase  29.25 
 
 		 460 aa  119  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.786971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0221  lignostilbene-alpha,beta-dioxygenase and related enzyme-like  30.06 
 
 		 488 aa  118  3e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4841  Carotenoid oxygenase  31.18 
 
 		 464 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.659326 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5459  Carotenoid oxygenase  25.84 
 
 		 514 aa  117  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176097  normal  0.349671 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3710  retinal pigment epithelial membrane protein  28.43 
 
 		 463 aa  117  5e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5477  putative carotenoid oxygenase  32.08 
 
 		 467 aa  117  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4222  Carotenoid oxygenase  29.82 
 
 		 501 aa  117  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0865656 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1317  carotenoid oxygenase  36.06 
 
 		 467 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0091  Carotenoid oxygenase  28.95 
 
 		 477 aa  116  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.848261  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3944  Carotenoid oxygenase  23.96 
 
 		 481 aa  114  3e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25111  retinal pigment epithelial membrane protein  28.87 
 
 		 507 aa  114  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0248  lignostilbene-alpha,beta-dioxygenase and related enzyme-like  29.65 
 
 		 489 aa  114  5e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1536  carotenoid oxygenase  26.24 
 
 		 467 aa  114  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0771367  normal  0.379655 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2047  retinal pigment epithelial membrane protein  23.17 
 
 		 765 aa  110  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.211058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28795  predicted protein  28.09 
 
 		 556 aa  109  1e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.813535  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2656  carotenoid oxygenase  32.56 
 
 		 477 aa  109  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5644  carotenoid oxygenase  32.1 
 
 		 478 aa  107  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.427984 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0282  retinal pigment epithelial membrane protein  22.98 
 
 		 494 aa  106  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0182948  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03131  retinal pigment epithelial membrane protein  26.83 
 
 		 495 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.608355  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1535  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  30.28 
 
 		 483 aa  105  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194369  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0359  Carotenoid oxygenase  25.07 
 
 		 487 aa  103  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.235865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0935  Carotenoid oxygenase  27.27 
 
 		 488 aa  103  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934106 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0352  Carotenoid oxygenase  24.49 
 
 		 487 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3359  carotenoid oxygenase  21.34 
 
 		 502 aa  102  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.120702  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03031  retinal pigment epithelial membrane protein  26.69 
 
 		 494 aa  102  2e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03041  retinal pigment epithelial membrane protein  26.69 
 
 		 494 aa  100  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5950  crocetin dialdehyde  28.37 
 
 		 488 aa  99.8  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.444357  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2809  carotenoid oxygenase  29.89 
 
 		 497 aa  94.7  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.220593  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_4021  predicted protein  37.32 
 
 		 163 aa  94  6e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.274127  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3794  carotenoid oxygenase  30.24 
 
 		 464 aa  89.4  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0662225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0802  carotenoid oxygenase  21.65 
 
 		 494 aa  87.8  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.957651  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0611  carotenoid oxygenase  30.94 
 
 		 481 aa  86.7  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.951978 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30717  predicted protein  35.37 
 
 		 533 aa  86.3  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.990452 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4053  Carotenoid oxygenase  26.82 
 
 		 466 aa  86.3  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5723  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  22.9 
 
 		 441 aa  85.5  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00560936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_86865  predicted protein  32.84 
 
 		 554 aa  84.7  0.000000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.241734 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4867  carotenoid oxygenase  25.25 
 
 		 451 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4956  carotenoid oxygenase  25.25 
 
 		 451 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01643  lignostilbene dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G01500)  23.68 
 
 		 480 aa  82  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.600702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5235  carotenoid oxygenase  24.92 
 
 		 451 aa  80.1  0.00000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.751022 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10931  dioxygenase  27.24 
 
 		 502 aa  78.6  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4595  carotenoid oxygenase  27.89 
 
 		 479 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4083  Carotenoid oxygenase  23.4 
 
 		 472 aa  73.6  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5460  carotenoid oxygenase  23.92 
 
 		 459 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645484 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3098  carotenoid oxygenase  25.09 
 
 		 496 aa  70.5  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3158  carotenoid oxygenase  25.09 
 
 		 496 aa  70.5  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.350488 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3118  carotenoid oxygenase  26.1 
 
 		 496 aa  70.5  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.704266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2111  carotenoid oxygenase  29.41 
 
 		 480 aa  70.1  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.457029 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1332  carotenoid oxygenase  24.26 
 
 		 444 aa  69.3  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.447717 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2946  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  20.89 
 
 		 473 aa  68.9  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000652034  hitchhiker  0.000168571 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10667  dioxygenase  27.8 
 
 		 501 aa  68.6  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.181912  normal  0.435726 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3580  carotenoid oxygenase  25.62 
 
 		 469 aa  67  0.0000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_3050  predicted protein  32.35 
 
 		 467 aa  66.6  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.601284  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07062  conserved hypothetical protein  25.1 
 
 		 555 aa  65.5  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_48352  predicted protein  30.99 
 
 		 551 aa  65.9  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1272  carotenoid oxygenase  26.37 
 
 		 487 aa  65.1  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.261404  hitchhiker  0.00803245 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0281  carotenoid oxygenase  20.04 
 
 		 445 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.772775  hitchhiker  0.000581153 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2484  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  24.92 
 
 		 461 aa  64.3  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.217647  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119472  Carotenoid dioxygenase plastidic fusion protein, putative  31.39 
 
 		 914 aa  63.9  0.000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0452333  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2806  carotenoid oxygenase  20.24 
 
 		 445 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.561211  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0300  carotenoid oxygenase  20.24 
 
 		 445 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473918  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1698  carotenoid oxygenase  25.51 
 
 		 480 aa  63.5  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.459113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3399  retinal pigment epithelial membrane protein  21.33 
 
 		 443 aa  62  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.452417  normal  0.802561 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4940  carotenoid oxygenase  24.91 
 
 		 537 aa  60.8  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.97423  normal  0.0157069 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1807  carotenoid oxygenase  25.15 
 
 		 512 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.581411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48408  predicted protein  29.09 
 
 		 577 aa  60.1  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3269  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  22.76 
 
 		 419 aa  59.3  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3700  Carotenoid oxygenase  25.65 
 
 		 560 aa  56.2  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.101903  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>