121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3212 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_1236  retinal pigment epithelial membrane protein  62.11 
 
 		 510 aa  653    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0229916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3212  carotenoid oxygenase  100 
 
 		 489 aa  1013    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.415925  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0449  Carotenoid oxygenase  59.46 
 
 		 491 aa  623  1e-177  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0196  Beta-carotene 15,15'-dioxygenase  60.91 
 
 		 493 aa  616  1e-175  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4402  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  57.46 
 
 		 495 aa  601  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000371573 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4340  Carotenoid oxygenase  57.26 
 
 		 495 aa  599  1e-170  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4222  Carotenoid oxygenase  54.66 
 
 		 501 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0865656 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0221  lignostilbene-alpha,beta-dioxygenase and related enzyme-like  47.03 
 
 		 488 aa  460  9.999999999999999e-129  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0248  lignostilbene-alpha,beta-dioxygenase and related enzyme-like  45.81 
 
 		 489 aa  440  9.999999999999999e-123  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25111  retinal pigment epithelial membrane protein  44.92 
 
 		 507 aa  438  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03071  retinal pigment epithelial membrane protein  44.26 
 
 		 495 aa  437  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1646  retinal pigment epithelial membrane protein  45.04 
 
 		 497 aa  422  1e-117  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03601  retinal pigment epithelial membrane protein  44.83 
 
 		 497 aa  421  1e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0282  retinal pigment epithelial membrane protein  43.75 
 
 		 494 aa  417  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0182948  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03031  retinal pigment epithelial membrane protein  43.55 
 
 		 494 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03041  retinal pigment epithelial membrane protein  43.55 
 
 		 494 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03131  retinal pigment epithelial membrane protein  43.58 
 
 		 495 aa  406  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.608355  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0013  Carotenoid oxygenase  34.22 
 
 		 468 aa  266  8e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.768827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0015  Carotenoid oxygenase  34.22 
 
 		 468 aa  266  8e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30717  predicted protein  33.86 
 
 		 533 aa  262  1e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.990452 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5459  Carotenoid oxygenase  32.15 
 
 		 514 aa  259  5.0000000000000005e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176097  normal  0.349671 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0203  carotenoid oxygenase  31.9 
 
 		 464 aa  248  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.297924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_86865  predicted protein  31.99 
 
 		 554 aa  247  4e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.241734 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4841  Carotenoid oxygenase  33.41 
 
 		 464 aa  239  6.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.659326 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5321  Carotenoid oxygenase  31.09 
 
 		 477 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2047  retinal pigment epithelial membrane protein  31.83 
 
 		 765 aa  236  6e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.211058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3359  carotenoid oxygenase  31.25 
 
 		 502 aa  234  3e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.120702  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3688  carotenoid oxygenase  31.67 
 
 		 485 aa  232  1e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3964  Carotenoid oxygenase  30.7 
 
 		 486 aa  232  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.99286  normal  0.591573 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_48352  predicted protein  30.72 
 
 		 551 aa  231  3e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2446  twin-arginine translocation pathway signal  31.01 
 
 		 517 aa  229  9e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000341259  normal  0.858746 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3710  retinal pigment epithelial membrane protein  31.26 
 
 		 463 aa  228  2e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2168  retinal pigment epithelial membrane protein  31.28 
 
 		 472 aa  226  6e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.123356 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3417  dioxygenase, putative  29.65 
 
 		 509 aa  226  9e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3944  Carotenoid oxygenase  34.18 
 
 		 481 aa  221  3e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0935  Carotenoid oxygenase  31.28 
 
 		 488 aa  211  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934106 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0359  Carotenoid oxygenase  30.2 
 
 		 487 aa  203  5e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.235865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3794  carotenoid oxygenase  30.8 
 
 		 464 aa  202  8e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0662225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0352  Carotenoid oxygenase  29.76 
 
 		 487 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1535  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  29.54 
 
 		 483 aa  197  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194369  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43490  predicted protein  29.34 
 
 		 630 aa  196  7e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.416955  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4033  Carotenoid oxygenase  28.42 
 
 		 508 aa  193  5e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.804116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3919  Carotenoid oxygenase  28.42 
 
 		 508 aa  193  5e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1401  Carotenoid oxygenase  30.92 
 
 		 467 aa  193  5e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0611  carotenoid oxygenase  30.43 
 
 		 481 aa  193  6e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.951978 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5477  putative carotenoid oxygenase  31.44 
 
 		 467 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2656  carotenoid oxygenase  28.67 
 
 		 477 aa  191  2.9999999999999997e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1536  carotenoid oxygenase  30.52 
 
 		 467 aa  189  7e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0771367  normal  0.379655 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0441  carotenoid oxygenase  29.32 
 
 		 460 aa  189  7e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.786971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2946  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  29.98 
 
 		 473 aa  186  6e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000652034  hitchhiker  0.000168571 
 
 
-
 
NC_003296  RS05214  dioxygenase signal peptide protein  27.52 
 
 		 520 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1216  carotenoid oxygenase  29.46 
 
 		 467 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.548821 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5950  crocetin dialdehyde  30.18 
 
 		 488 aa  184  3e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.444357  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1036  lignostilbene-alpha,beta-dioxygenase  31.24 
 
 		 470 aa  184  4.0000000000000006e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3399  retinal pigment epithelial membrane protein  30 
 
 		 443 aa  183  7e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.452417  normal  0.802561 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1317  carotenoid oxygenase  30.63 
 
 		 467 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10931  dioxygenase  28.21 
 
 		 502 aa  177  4e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1272  carotenoid oxygenase  29.68 
 
 		 487 aa  176  8e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.261404  hitchhiker  0.00803245 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0219  carotenoid oxygenase  30.09 
 
 		 445 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0281  carotenoid oxygenase  29.61 
 
 		 445 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.772775  hitchhiker  0.000581153 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3952  Carotenoid oxygenase  27.57 
 
 		 499 aa  175  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.273513  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0227  carotenoid oxygenase  30.09 
 
 		 445 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000205038 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1807  carotenoid oxygenase  28.45 
 
 		 512 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.581411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2806  carotenoid oxygenase  29.46 
 
 		 445 aa  174  5e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.561211  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0300  carotenoid oxygenase  29.46 
 
 		 445 aa  174  5e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473918  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4940  carotenoid oxygenase  27.2 
 
 		 537 aa  173  5e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.97423  normal  0.0157069 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3118  carotenoid oxygenase  28 
 
 		 496 aa  173  5e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.704266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1008  carotenoid oxygenase  28.63 
 
 		 498 aa  173  6.999999999999999e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0158946  normal  0.495511 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3098  carotenoid oxygenase  28 
 
 		 496 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3158  carotenoid oxygenase  28 
 
 		 496 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.350488 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4083  Carotenoid oxygenase  26.68 
 
 		 472 aa  171  2e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6035  carotenoid oxygenase  29.39 
 
 		 479 aa  171  4e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.96012  normal  0.0939223 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2111  carotenoid oxygenase  29.09 
 
 		 480 aa  170  6e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.457029 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4862  Beta-carotene 15,15'-monooxygenase  28.31 
 
 		 470 aa  168  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.169022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1332  carotenoid oxygenase  28.46 
 
 		 444 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.447717 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119472  Carotenoid dioxygenase plastidic fusion protein, putative  28.63 
 
 		 914 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0452333  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4867  carotenoid oxygenase  28.88 
 
 		 451 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4956  carotenoid oxygenase  28.88 
 
 		 451 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4053  Carotenoid oxygenase  27.55 
 
 		 466 aa  163  7e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5644  carotenoid oxygenase  26.91 
 
 		 478 aa  162  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.427984 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5235  carotenoid oxygenase  28.45 
 
 		 451 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.751022 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5723  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  27.96 
 
 		 441 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00560936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0091  Carotenoid oxygenase  25.42 
 
 		 477 aa  160  5e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.848261  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3058  carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase, putative  29.22 
 
 		 443 aa  159  8e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1562  putative dioxygenase  29.22 
 
 		 443 aa  159  8e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1233  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  29.22 
 
 		 443 aa  159  8e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0130033  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0635  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  29.22 
 
 		 443 aa  159  8e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.617766  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1459  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  29.22 
 
 		 443 aa  159  8e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0518  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  29.22 
 
 		 443 aa  159  8e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.615695  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1698  carotenoid oxygenase  29.82 
 
 		 480 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.459113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5460  carotenoid oxygenase  28.98 
 
 		 459 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645484 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_3050  predicted protein  27.37 
 
 		 467 aa  157  6e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.601284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1428  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  29 
 
 		 443 aa  156  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2824  carotenoid oxygenase  27.89 
 
 		 504 aa  155  2e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4595  carotenoid oxygenase  27.8 
 
 		 479 aa  155  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2484  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  26.97 
 
 		 461 aa  151  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.217647  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28795  predicted protein  25.93 
 
 		 556 aa  150  4e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.813535  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0802  carotenoid oxygenase  26.37 
 
 		 494 aa  145  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.957651  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48408  predicted protein  28.51 
 
 		 577 aa  143  7e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3580  carotenoid oxygenase  28.6 
 
 		 469 aa  141  3e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>