211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_12241 on replicon NC_011675
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011675  PHATRDRAFT_12241  predicted protein  100 
 
 		 101 aa  203  7e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0687182  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1938  putative periplasmic protease  52.69 
 
 		 349 aa  89.4  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1759  peptidase S49  47.52 
 
 		 356 aa  86.3  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.257491  normal  0.0518499 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0841  putative periplasmic protease  46.08 
 
 		 347 aa  84.7  3e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0227554  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1184  putative periplasmic protease  47.52 
 
 		 326 aa  84.3  5e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.084263  normal  0.0267663 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27550  putative periplasmic protease  45.92 
 
 		 342 aa  84.3  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_5396  predicted protein  46.15 
 
 		 165 aa  84  7e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.751288  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0992  putative periplasmic protease  49.47 
 
 		 332 aa  83.6  8e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0462132  unclonable  0.000000000696502 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2530  putative periplasmic protease  44.9 
 
 		 339 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.581434  normal  0.322286 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2013  putative periplasmic protease  47.96 
 
 		 348 aa  83.2  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0439516  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2314  putative periplasmic protease  47.96 
 
 		 348 aa  82.8  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1202  putative periplasmic protease  46.53 
 
 		 324 aa  82.8  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.184937  normal  0.0260504 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2306  putative periplasmic protease  45.92 
 
 		 348 aa  82.4  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2036  putative periplasmic protease  45.92 
 
 		 348 aa  82.4  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.210716  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40840  putative periplasmic protease  44.9 
 
 		 341 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3463  putative periplasmic protease  44.9 
 
 		 341 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.145757  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1925  putative periplasmic protease  45.92 
 
 		 348 aa  82.4  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0571162  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2659  putative periplasmic protease  46.08 
 
 		 348 aa  81.6  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0477819  unclonable  0.0000000288065 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1612  putative periplasmic protease  45.92 
 
 		 348 aa  81.3  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000117623 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1843  putative periplasmic protease  45.92 
 
 		 348 aa  81.3  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000005383 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2166  putative periplasmic protease  45.54 
 
 		 348 aa  80.9  0.000000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0622193  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1906  putative periplasmic protease  45.92 
 
 		 348 aa  81.3  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000137079 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1848  putative periplasmic protease  45.92 
 
 		 348 aa  81.3  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.805473  normal  0.10396 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1430  putative periplasmic protease  45.92 
 
 		 348 aa  81.3  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.28088  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1707  putative periplasmic protease  46.08 
 
 		 347 aa  80.9  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.122025 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1694  putative periplasmic protease  45.54 
 
 		 343 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0077753  normal  0.738833 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1897  Peptidase S49 domain protein  48.89 
 
 		 347 aa  80.1  0.000000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1530  putative periplasmic protease  46.08 
 
 		 353 aa  80.1  0.000000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000285162  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3211  putative periplasmic protease  42.57 
 
 		 339 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.888582  normal  0.61318 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1904  putative periplasmic protease  43.56 
 
 		 349 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000180069 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01248  predicted inner membrane peptidase  43.56 
 
 		 349 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.57179  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2377  Peptidase S49 domain protein  43.56 
 
 		 349 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00026529  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2629  putative periplasmic protease  45.54 
 
 		 333 aa  79.3  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.751964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1859  putative periplasmic protease  43.56 
 
 		 349 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000140347 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2356  putative periplasmic protease  43.56 
 
 		 349 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.203735  hitchhiker  0.000000387336 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1926  putative periplasmic protease  43.56 
 
 		 348 aa  79  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3556  putative periplasmic protease  42.57 
 
 		 339 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.132568  normal  0.518214 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1381  putative periplasmic protease  43.56 
 
 		 349 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2198  putative periplasmic protease  44.9 
 
 		 347 aa  79  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000353353 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1088  putative periplasmic protease  44.55 
 
 		 334 aa  78.6  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3922  putative periplasmic protease  42.57 
 
 		 339 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113918  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2460  putative periplasmic protease  40.59 
 
 		 340 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0165849  hitchhiker  0.0077968 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0973  putative periplasmic protease  44.55 
 
 		 334 aa  78.6  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3114  putative periplasmic protease  41.58 
 
 		 340 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0953569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2016  putative periplasmic protease  46 
 
 		 365 aa  78.6  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000438973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2471  putative periplasmic protease  44.33 
 
 		 337 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000173214  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1913  putative periplasmic protease  42.57 
 
 		 339 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.786378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1496  putative periplasmic protease  43.56 
 
 		 349 aa  78.6  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1471  putative periplasmic protease  42.57 
 
 		 349 aa  78.2  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.251936  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2728  peptidase, U7 family  40.59 
 
 		 340 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2570  putative periplasmic protease  46.39 
 
 		 336 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2407  putative periplasmic protease  45.54 
 
 		 343 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000170796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2119  putative periplasmic protease  44.55 
 
 		 337 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000182338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2903  putative periplasmic protease  46.39 
 
 		 343 aa  77  0.00000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000180746  normal  0.0386673 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0917  putative periplasmic protease  40.82 
 
 		 312 aa  76.6  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0886  putative periplasmic protease  40.82 
 
 		 312 aa  76.6  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1726  putative periplasmic protease  43.56 
 
 		 338 aa  76.6  0.0000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0461  putative periplasmic protease  43.56 
 
 		 338 aa  76.6  0.0000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2394  putative periplasmic protease  42.57 
 
 		 338 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000216852  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1651  putative periplasmic protease  44.33 
 
 		 342 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000359076  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1470  putative periplasmic protease  45.36 
 
 		 338 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000101356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0332  putative periplasmic protease  47 
 
 		 332 aa  75.1  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1530  putative periplasmic protease  45.36 
 
 		 338 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000234628  unclonable  0.0000000000765641 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_5654  predicted protein  44.21 
 
 		 234 aa  75.1  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.221345  normal  0.32323 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1605  putative periplasmic protease  43.56 
 
 		 334 aa  75.1  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.741471  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2790  putative periplasmic protease  41.58 
 
 		 338 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000021118  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1193  putative periplasmic protease  45.26 
 
 		 349 aa  74.7  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2933  putative periplasmic protease  44.33 
 
 		 338 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1536  putative periplasmic protease  45.36 
 
 		 338 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000229962  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1674  putative periplasmic protease  41.58 
 
 		 330 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000678362  hitchhiker  0.00314277 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2692  putative periplasmic protease  41.58 
 
 		 338 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000260799  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2713  putative periplasmic protease  41.58 
 
 		 338 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000822492  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01896  putative periplasmic protease  43.56 
 
 		 340 aa  73.9  0.0000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000105224  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0578  putative periplasmic protease  44.33 
 
 		 353 aa  72.8  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000048636  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1972  putative periplasmic protease  44.33 
 
 		 349 aa  73.6  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.114164  normal  0.766223 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2181  putative periplasmic protease  41.58 
 
 		 344 aa  72  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0119902  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0843  putative periplasmic protease  43.43 
 
 		 325 aa  71.6  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1161  putative periplasmic protease  43.3 
 
 		 353 aa  69.7  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.189873  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02863  putative periplasmic protease  43.3 
 
 		 353 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003018  SohB protein peptidase U7 family  43.3 
 
 		 353 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000939  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_4014  predicted protein  37.62 
 
 		 216 aa  67.4  0.00000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.545391  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0102  putative periplasmic protease  44.44 
 
 		 335 aa  66.2  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2241  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.43 
 
 		 339 aa  62.8  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0781  protease IV, putative  37.89 
 
 		 332 aa  57  0.00000008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4351  peptidase S49  36.63 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.244861  hitchhiker  0.00437217 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0166  peptidase S49  40 
 
 		 297 aa  56.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2153  peptidase S49  45.95 
 
 		 285 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0385  S49 family peptidase  38.46 
 
 		 283 aa  55.1  0.0000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1091  peptidase S49  41.89 
 
 		 302 aa  54.7  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.62395 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1478  signal peptide peptidase SppA, putative  38.83 
 
 		 327 aa  54.3  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.484654  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1376  peptidase S49  43.84 
 
 		 295 aa  53.5  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.972193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2353  putative serine protease SohB  36.59 
 
 		 283 aa  52.8  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.169927 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0640  peptidase S49  41.03 
 
 		 265 aa  53.5  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0307  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.18 
 
 		 324 aa  52.8  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1428  peptidase S49  40.51 
 
 		 311 aa  53.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574443 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2757  peptidase S49  45.95 
 
 		 287 aa  52  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00860  ClpP class periplasmic serine protease  33.75 
 
 		 300 aa  52  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3877  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36 
 
 		 656 aa  51.6  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.725611  normal  0.0235537 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1076  S49 family peptidase  37.5 
 
 		 265 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2737  peptidase S49  37.5 
 
 		 265 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.224887  normal  0.140523 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>