48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_29647 on replicon NC_009375
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009375  OSTLU_29647  predicted protein  100 
 
 		 410 aa  830    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00179494 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27264  predicted protein  100 
 
 		 410 aa  830    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_35966  predicted protein  28.02 
 
 		 488 aa  80.1  0.00000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.205341  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  25.46 
 
 		 1484 aa  51.6  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.21 
 
 		 1599 aa  51.2  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.15 
 
 		 642 aa  51.2  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0987  Serine/threonine protein kinase-related protein  27.8 
 
 		 842 aa  50.4  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.466827  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0059  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.84 
 
 		 692 aa  50.8  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  34.67 
 
 		 1330 aa  50.4  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  30.77 
 
 		 1211 aa  50.1  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1541  WD-40 repeat-containing protein  29.35 
 
 		 589 aa  49.7  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32128  predicted protein  27.1 
 
 		 319 aa  49.7  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0599879 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2154  WD-40 repeat-containing protein  35.51 
 
 		 1041 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  37.5 
 
 		 1217 aa  48.5  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_21983  predicted protein  28.21 
 
 		 484 aa  48.5  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.383606  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  25.2 
 
 		 1652 aa  48.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36366  predicted protein  23.76 
 
 		 430 aa  47.4  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.32878 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3489  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  36.25 
 
 		 1039 aa  47.4  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  36.49 
 
 		 1831 aa  47  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  36.62 
 
 		 1364 aa  46.6  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.22 
 
 		 1823 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  24.09 
 
 		 1454 aa  45.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.06 
 
 		 930 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  26.23 
 
 		 1807 aa  45.8  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03830  general transcriptional repressor, putative  28.93 
 
 		 564 aa  45.1  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15280  predicted protein  31.17 
 
 		 534 aa  45.8  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  25.66 
 
 		 1510 aa  45.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4060  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.87 
 
 		 792 aa  45.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602409  hitchhiker  0.000910651 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  33.33 
 
 		 1416 aa  45.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  20.5 
 
 		 505 aa  44.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3455  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  28.04 
 
 		 1205 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0147973  normal  0.02414 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  32.95 
 
 		 1357 aa  44.3  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  27.88 
 
 		 1213 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  27.4 
 
 		 1190 aa  44.3  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  25.25 
 
 		 1242 aa  44.3  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.14 
 
 		 1557 aa  44.3  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  27.27 
 
 		 924 aa  43.9  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.56 
 
 		 1684 aa  43.9  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0759  WD-40 repeat-containing protein  22.39 
 
 		 307 aa  43.9  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  26.97 
 
 		 1196 aa  43.5  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0633  WD-40 repeat protein  32.47 
 
 		 1183 aa  43.5  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00230  U5 snRNP-specific 40 kDa protein, putative  27.94 
 
 		 374 aa  43.5  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.718611  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  24.76 
 
 		 1193 aa  43.5  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3896  serine/threonine protein kinase  23.28 
 
 		 687 aa  43.5  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25 
 
 		 1481 aa  42.7  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  26.43 
 
 		 1553 aa  43.1  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2761  WD-40 repeat-containing protein  30.7 
 
 		 1117 aa  43.1  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.645221  normal  0.818272 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  28.09 
 
 		 1523 aa  43.1  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>