61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_27647 on replicon NC_009368
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009368  OSTLU_27647  predicted protein  100 
 
 		 202 aa  404  1.0000000000000001e-112  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.885803  normal  0.289397 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2047  Holliday junction resolvase YqgF  32.28 
 
 		 141 aa  52.4  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0484  Holliday junction resolvase-like protein  30.77 
 
 		 146 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5038  hypothetical protein  30.13 
 
 		 146 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2406  Holliday junction resolvase YqgF  29.22 
 
 		 142 aa  49.7  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.406379  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2162  Holliday junction resolvase YqgF  27.39 
 
 		 142 aa  49.7  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.337322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2326  Holliday junction resolvase-like protein  28.48 
 
 		 151 aa  48.9  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0635951 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1131  Holliday junction resolvase-like protein  25.93 
 
 		 141 aa  48.9  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.111461  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1790  Holliday junction resolvase YqgF  27.45 
 
 		 133 aa  48.9  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00751815  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_51570  predicted protein  31.41 
 
 		 190 aa  48.9  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.107223  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2570  Holliday junction resolvase YqgF  27.27 
 
 		 142 aa  47.8  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00347975  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5312  Holliday junction resolvase-like protein  30.77 
 
 		 145 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0190801  normal  0.217295 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2805  Holliday junction resolvase YqgF  25.62 
 
 		 145 aa  47.4  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0527  Holliday junction resolvase-like protein  29.05 
 
 		 130 aa  47  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0265  Holliday junction resolvase-like protein  28.1 
 
 		 147 aa  47  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2682  Holliday junction resolvase-like protein  26.75 
 
 		 141 aa  47.4  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0331396  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0014  Holliday junction resolvase YqgF  27.92 
 
 		 140 aa  46.2  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.639301  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3020  Holliday junction resolvase-like protein  25.32 
 
 		 141 aa  45.4  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00101053  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3178  Holliday junction resolvase-like protein  25.32 
 
 		 141 aa  45.4  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000555794  normal  0.0157194 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3035  Holliday junction resolvase-like protein  25.32 
 
 		 141 aa  45.4  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000814628  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1343  Holliday junction resolvase-like protein  25.32 
 
 		 141 aa  45.4  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00897927  hitchhiker  0.00000000052642 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2673  Holliday junction resolvase-like protein  25 
 
 		 141 aa  45.4  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000201914  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3347  Holliday junction resolvase-like protein  24.05 
 
 		 141 aa  45.4  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1199  Holliday junction resolvase-like protein  25.32 
 
 		 141 aa  45.1  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0107111  normal  0.529497 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1269  Holliday junction resolvase-like protein  25.32 
 
 		 141 aa  45.1  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000329275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1198  Holliday junction resolvase-like protein  25.32 
 
 		 141 aa  45.1  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000276178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0873  Holliday junction resolvase YqgF  24.7 
 
 		 145 aa  45.1  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0307  Holliday junction resolvase YqgF  27.81 
 
 		 142 aa  43.9  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0468  Holliday junction resolvase-like protein  29.11 
 
 		 141 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1143  Holliday junction resolvase-like protein  26.28 
 
 		 139 aa  44.7  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.997205  normal  0.0325702 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0869  Holliday junction resolvase-like protein  27.33 
 
 		 146 aa  44.7  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0747835 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2407  Holliday junction resolvase YqgF  34.19 
 
 		 130 aa  44.3  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.664688  normal  0.90932 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2849  Holliday junction resolvase-like protein  23.72 
 
 		 139 aa  43.5  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1395  Holliday junction resolvase YqgF  27.04 
 
 		 143 aa  43.5  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2398  Holliday junction resolvase-like protein  29.41 
 
 		 149 aa  43.5  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0366153  hitchhiker  0.00151496 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4870  Holliday junction resolvase-like protein  29.11 
 
 		 141 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0143218 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2800  Holliday junction resolvase YqgF  26.97 
 
 		 141 aa  43.1  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5046  Holliday junction resolvase-like protein  29.11 
 
 		 141 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.433304  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2202  Holliday junction resolvase-like protein  27.1 
 
 		 138 aa  43.1  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0556  Holliday junction resolvase YqgF  28.76 
 
 		 153 aa  43.1  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.901255  normal  0.0480752 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1285  Holliday junction resolvase YqgF  27.16 
 
 		 145 aa  43.1  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0394867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0143  Holliday junction resolvase YqgF  27.45 
 
 		 177 aa  43.1  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4996  Holliday junction resolvase-like protein  29.11 
 
 		 141 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0244  Holliday junction resolvase-like protein  27.63 
 
 		 138 aa  42.7  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.535412  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5430  Holliday junction resolvase YqgF  25.97 
 
 		 142 aa  42  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1378  Holliday junction resolvase-like protein  30.67 
 
 		 156 aa  42  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1236  Holliday junction resolvase-like protein  24.2 
 
 		 139 aa  42  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.578906  normal  0.405452 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0836  Holliday junction resolvase-like protein  26.45 
 
 		 149 aa  42  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.311364  hitchhiker  0.00221177 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02742  hypothetical protein  26.92 
 
 		 138 aa  42  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.395069  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0383  Holliday junction resolvase-like protein  26.45 
 
 		 149 aa  42  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0865  Holliday junction resolvase-like protein  26.45 
 
 		 149 aa  42  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2429  Holliday junction resolvase YqgF  24.36 
 
 		 144 aa  41.6  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02779  Holliday junction resolvase-like protein  26.92 
 
 		 138 aa  42  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.358182  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4252  Holliday junction resolvase-like protein  26.92 
 
 		 138 aa  41.6  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.367892  normal  0.370097 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1336  Holliday junction resolvase-like protein  22.56 
 
 		 139 aa  41.6  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.164432  hitchhiker  0.000378103 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0474  Holliday junction resolvase YqgF  24.67 
 
 		 145 aa  41.6  0.008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00800439  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2473  Holliday junction resolvase-like protein  24.05 
 
 		 139 aa  41.6  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.641283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2911  Holliday junction resolvase YqgF  28.82 
 
 		 163 aa  41.2  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.816073  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0746  Holliday junction resolvase YqgF  26.92 
 
 		 138 aa  41.2  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.61838  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3107  Holliday junction resolvase-like protein  26.92 
 
 		 138 aa  41.2  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0765  Holliday junction resolvase-like protein  26.92 
 
 		 138 aa  41.2  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.809741  hitchhiker  0.0000191582 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>