105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1295 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1295  protein of unknown function DUF397  100 
 
 
82 aa  175  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3501  protein of unknown function DUF397  75 
 
 
79 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0708  hypothetical protein  64.81 
 
 
64 aa  75.1  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0973  hypothetical protein  65.38 
 
 
64 aa  73.2  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0972  hypothetical protein  64.71 
 
 
61 aa  72.4  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4695  protein of unknown function DUF397  46.75 
 
 
127 aa  65.1  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0228  hypothetical protein  59.32 
 
 
80 aa  63.5  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24730  protein of unknown function (DUF397)  55.56 
 
 
69 aa  63.2  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7553  hypothetical protein  45.16 
 
 
99 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0037  hypothetical protein  58.06 
 
 
69 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8369  hypothetical protein  56.36 
 
 
67 aa  57.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4682  protein of unknown function DUF397  54.1 
 
 
63 aa  57.4  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0091  hypothetical protein  56.86 
 
 
63 aa  56.6  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.407205  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20560  protein of unknown function (DUF397)  39.34 
 
 
66 aa  55.1  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715891  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0215  hypothetical protein  56.86 
 
 
60 aa  54.7  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6122  protein of unknown function DUF397  50.98 
 
 
61 aa  53.9  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.464343  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1657  hypothetical protein  48.15 
 
 
68 aa  53.5  0.0000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2703  hypothetical protein  51.85 
 
 
67 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6649  hypothetical protein  57.14 
 
 
79 aa  52  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.476212  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1781  hypothetical protein  57.14 
 
 
69 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0643  hypothetical protein  55.77 
 
 
61 aa  50.8  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4087  protein of unknown function DUF397  54.17 
 
 
60 aa  50.8  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1543  protein of unknown function DUF397  51.06 
 
 
55 aa  50.8  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185149  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0262  hypothetical protein  44.64 
 
 
62 aa  50.4  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4609  protein of unknown function DUF397  47.17 
 
 
66 aa  50.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1943  protein of unknown function DUF397  49.02 
 
 
55 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2540  protein of unknown function DUF397  51.02 
 
 
60 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000021023  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5452  protein of unknown function DUF397  42.11 
 
 
59 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.455168  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4124  hypothetical protein  48.21 
 
 
75 aa  48.9  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701856  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1480  protein of unknown function DUF397  52.08 
 
 
59 aa  48.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0393  hypothetical protein  56.41 
 
 
63 aa  48.1  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4784  protein of unknown function DUF397  45 
 
 
61 aa  48.1  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5232  hypothetical protein  41.56 
 
 
79 aa  47.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.664195  normal  0.424507 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4137  protein of unknown function DUF397  43.4 
 
 
58 aa  47.8  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2538  protein of unknown function DUF397  48.98 
 
 
62 aa  47.8  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000230929  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4783  protein of unknown function DUF397  54.76 
 
 
64 aa  47.8  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6374  protein of unknown function DUF397  45.45 
 
 
61 aa  47.4  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2689  protein of unknown function DUF397  50 
 
 
63 aa  47.4  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00137319  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2579  protein of unknown function DUF397  43.64 
 
 
57 aa  47.4  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0222791 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5445  protein of unknown function DUF397  51.06 
 
 
81 aa  47  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.644753  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6435  protein of unknown function DUF397  48.94 
 
 
57 aa  47  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2448  hypothetical protein  51.92 
 
 
62 aa  46.2  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.14038  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0905  hypothetical protein  40.3 
 
 
76 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0955654 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1802  hypothetical protein  34.62 
 
 
63 aa  45.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1162  protein of unknown function DUF397  42.86 
 
 
62 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.490498  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3777  protein of unknown function DUF397  43.86 
 
 
66 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3778  protein of unknown function DUF397  45.45 
 
 
66 aa  46.2  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1019  hypothetical protein  34.15 
 
 
81 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1876  protein of unknown function DUF397  45.28 
 
 
56 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3930  protein of unknown function DUF397  43.48 
 
 
57 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4515  protein of unknown function DUF397  44.07 
 
 
65 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1728  hypothetical protein  41.54 
 
 
78 aa  45.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0749322  hitchhiker  0.00877773 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2601  hypothetical protein  52.08 
 
 
62 aa  45.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0203178  normal  0.0405865 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5396  protein of unknown function DUF397  50 
 
 
66 aa  45.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.051071  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0487  protein of unknown function DUF397  50 
 
 
63 aa  45.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0673  protein of unknown function DUF397  44.83 
 
 
62 aa  45.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2541  protein of unknown function DUF397  44.44 
 
 
63 aa  45.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000122631  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20610  protein of unknown function (DUF397)  35.59 
 
 
64 aa  44.7  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.069741  normal  0.682793 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0718  protein of unknown function DUF397  44.44 
 
 
73 aa  44.7  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2539  protein of unknown function DUF397  44.9 
 
 
60 aa  44.7  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000183418  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4781  protein of unknown function DUF397  44.23 
 
 
64 aa  44.7  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3743  hypothetical protein  47.27 
 
 
75 aa  44.7  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1329  hypothetical protein  48.94 
 
 
68 aa  44.7  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14270  protein of unknown function (DUF397)  41.67 
 
 
66 aa  44.3  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.784152  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7828  hypothetical protein  42.59 
 
 
69 aa  44.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1379  hypothetical protein  54 
 
 
63 aa  44.3  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.383201  hitchhiker  0.00799748 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12060  protein of unknown function (DUF397)  38.6 
 
 
65 aa  44.3  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4088  protein of unknown function DUF397  53.85 
 
 
57 aa  44.3  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0397  hypothetical protein  53.06 
 
 
69 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3929  protein of unknown function DUF397  42.55 
 
 
57 aa  43.9  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3155  protein of unknown function DUF397  42.31 
 
 
65 aa  43.9  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.093301  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2071  hypothetical protein  47.27 
 
 
67 aa  43.9  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.392038  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0906  hypothetical protein  41.94 
 
 
73 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0599  hypothetical protein  47.37 
 
 
69 aa  43.5  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5039  protein of unknown function DUF397  45.83 
 
 
61 aa  42.7  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.643266 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6482  hypothetical protein  33.33 
 
 
76 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.435568 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2580  protein of unknown function DUF397  37.25 
 
 
59 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0232734 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2090  hypothetical protein  43.1 
 
 
79 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.161003  normal  0.0235666 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3009  hypothetical protein  42.19 
 
 
113 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2128  hypothetical protein  53.06 
 
 
62 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12020  protein of unknown function (DUF397)  31.15 
 
 
65 aa  42.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7763  hypothetical protein  48.21 
 
 
68 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1230  hypothetical protein  40 
 
 
77 aa  42.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.375294 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1090  protein of unknown function DUF397  46.81 
 
 
57 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.552456 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2768  protein of unknown function DUF397  41.18 
 
 
56 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.141211  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1432  hypothetical protein  49.06 
 
 
62 aa  41.6  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353493  hitchhiker  0.000418088 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2231  hypothetical protein  43.1 
 
 
79 aa  42  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0143015  normal  0.145093 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5037  protein of unknown function DUF397  34.67 
 
 
73 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0716  protein of unknown function DUF397  40.74 
 
 
65 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1161  protein of unknown function DUF397  39.29 
 
 
62 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.653899  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1652  protein of unknown function DUF397  39.29 
 
 
59 aa  41.6  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0828203  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2767  protein of unknown function DUF397  43.4 
 
 
60 aa  41.6  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0824129  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1159  hypothetical protein  47.83 
 
 
66 aa  41.2  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0339608  unclonable  0.0000000343885 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3776  protein of unknown function DUF397  42.59 
 
 
66 aa  40.8  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0485  protein of unknown function DUF397  48 
 
 
63 aa  40.4  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4159  protein of unknown function DUF397  41.51 
 
 
67 aa  40.8  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3657  hypothetical protein  49.06 
 
 
62 aa  40.4  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0042  hypothetical protein  48.08 
 
 
73 aa  40.4  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0567  protein of unknown function DUF397  41.51 
 
 
95 aa  40.4  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0486  protein of unknown function DUF397  46.94 
 
 
63 aa  40.4  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>