109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2090 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2090  hypothetical protein  100 
 
 
79 aa  163  8e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.161003  normal  0.0235666 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2231  hypothetical protein  94.87 
 
 
79 aa  154  3e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0143015  normal  0.145093 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5736  hypothetical protein  71.62 
 
 
80 aa  110  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.534328 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1295  hypothetical protein  61.54 
 
 
78 aa  104  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.471559  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2305  putative regulator  65.75 
 
 
77 aa  101  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2513  hypothetical protein  64.1 
 
 
78 aa  101  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4075  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3445  hypothetical protein  58.23 
 
 
78 aa  101  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0876  protein of unknown function DUF397  64.1 
 
 
80 aa  101  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1230  hypothetical protein  62.82 
 
 
77 aa  98.6  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.375294 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4153  protein of unknown function DUF397  64.1 
 
 
78 aa  98.2  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1969  protein of unknown function DUF397  74.6 
 
 
76 aa  98.6  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00185784  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0521  protein of unknown function DUF397  60.27 
 
 
77 aa  97.1  8e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5628  hypothetical protein  63.01 
 
 
78 aa  90.5  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.524184 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0567  protein of unknown function DUF397  61.64 
 
 
95 aa  89.4  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37900  protein of unknown function (DUF397)  56.58 
 
 
82 aa  85.9  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1504  protein of unknown function DUF397  53.42 
 
 
103 aa  77.8  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0037  hypothetical protein  61.29 
 
 
69 aa  75.1  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1781  hypothetical protein  52.94 
 
 
69 aa  68.9  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8369  hypothetical protein  53.12 
 
 
67 aa  67.8  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14270  protein of unknown function (DUF397)  50 
 
 
66 aa  67.4  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.784152  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2703  hypothetical protein  43.48 
 
 
67 aa  64.7  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0235  hypothetical protein  47.69 
 
 
77 aa  63.9  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1588  hypothetical protein  47.76 
 
 
71 aa  63.9  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1548  hypothetical protein  47.76 
 
 
71 aa  63.5  0.0000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0220305  normal  0.0244583 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8470  protein of unknown function DUF397  44.62 
 
 
92 aa  61.6  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0228  hypothetical protein  51.67 
 
 
80 aa  61.6  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0265  protein of unknown function DUF397  50.79 
 
 
68 aa  60.1  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138869  normal  0.97902 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0397  hypothetical protein  48.44 
 
 
69 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1597  hypothetical protein  43.75 
 
 
70 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6482  hypothetical protein  41.89 
 
 
76 aa  57.4  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.435568 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0266  protein of unknown function DUF397  43.55 
 
 
69 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.687438  normal  0.998664 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4695  protein of unknown function DUF397  37.35 
 
 
127 aa  55.1  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20610  protein of unknown function (DUF397)  41.27 
 
 
64 aa  53.9  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.069741  normal  0.682793 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6312  protein of unknown function DUF397  45.45 
 
 
74 aa  53.9  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61619  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7763  hypothetical protein  43.94 
 
 
68 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0905  hypothetical protein  36 
 
 
76 aa  50.4  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0955654 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0599  hypothetical protein  43.1 
 
 
69 aa  50.1  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1159  hypothetical protein  45.61 
 
 
66 aa  49.7  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0339608  unclonable  0.0000000343885 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1984  protein of unknown function DUF397  43.75 
 
 
69 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00383957  normal  0.845583 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12020  protein of unknown function (DUF397)  44.83 
 
 
65 aa  49.7  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3763  protein of unknown function DUF397  41.18 
 
 
83 aa  50.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3476  hypothetical protein  43.75 
 
 
72 aa  48.9  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0973  hypothetical protein  38.71 
 
 
64 aa  48.5  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3856  hypothetical protein  46.55 
 
 
72 aa  48.1  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12060  protein of unknown function (DUF397)  42.42 
 
 
65 aa  48.5  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20560  protein of unknown function (DUF397)  41.38 
 
 
66 aa  48.9  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715891  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0993  hypothetical protein  43.33 
 
 
67 aa  48.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3743  hypothetical protein  40.3 
 
 
75 aa  48.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6649  hypothetical protein  47.54 
 
 
79 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.476212  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24730  protein of unknown function (DUF397)  38.24 
 
 
69 aa  48.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3503  protein of unknown function DUF397  36.07 
 
 
65 aa  48.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0535915  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1329  hypothetical protein  42.86 
 
 
68 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0643  hypothetical protein  44.07 
 
 
61 aa  47.8  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7828  hypothetical protein  36.92 
 
 
69 aa  47.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2128  protein of unknown function DUF397  41.38 
 
 
64 aa  47.4  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.996693  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0718  protein of unknown function DUF397  39.06 
 
 
73 aa  47.4  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1517  hypothetical protein  41.82 
 
 
68 aa  47.4  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0185029 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1767  hypothetical protein  44.07 
 
 
127 aa  47  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3357  hypothetical protein  47.37 
 
 
64 aa  47  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0411145  normal  0.0781791 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7976  hypothetical protein  40.54 
 
 
80 aa  47  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0545278  normal  0.164909 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4685  hypothetical protein  43.28 
 
 
69 aa  46.2  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.144765  normal  0.226614 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6435  protein of unknown function DUF397  45.24 
 
 
57 aa  47  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1019  hypothetical protein  36.25 
 
 
81 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0708  hypothetical protein  43.64 
 
 
64 aa  46.2  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0037  hypothetical protein  40 
 
 
73 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.727174  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1132  hypothetical protein  41.38 
 
 
65 aa  46.2  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1269  hypothetical protein  47.92 
 
 
66 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0042  hypothetical protein  39.39 
 
 
73 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2969  hypothetical protein  45.28 
 
 
68 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000849623 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6018  protein of unknown function DUF397  36.76 
 
 
89 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.260789  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0906  hypothetical protein  30.67 
 
 
73 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5396  protein of unknown function DUF397  48.15 
 
 
66 aa  45.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.051071  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2071  hypothetical protein  42.37 
 
 
67 aa  45.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.392038  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2543  hypothetical protein  44.44 
 
 
67 aa  45.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258706  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4255  hypothetical protein  40 
 
 
69 aa  45.1  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.912797  normal  0.127607 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0787  hypothetical protein  38.98 
 
 
106 aa  45.1  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.679584  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1505  protein of unknown function DUF397  45.76 
 
 
139 aa  44.7  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.272297  hitchhiker  0.00205006 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0972  hypothetical protein  33.33 
 
 
61 aa  44.7  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3649  protein of unknown function DUF397  46.15 
 
 
75 aa  44.3  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.375701  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36640  protein of unknown function (DUF397)  39.06 
 
 
83 aa  44.3  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.0015395  normal  0.323981 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4454  protein of unknown function DUF397  45.83 
 
 
69 aa  43.9  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1657  hypothetical protein  34.92 
 
 
68 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2448  hypothetical protein  40.68 
 
 
62 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.14038  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3657  hypothetical protein  41.67 
 
 
62 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4569  hypothetical protein  38.46 
 
 
77 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.246526 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2601  hypothetical protein  43.4 
 
 
62 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0203178  normal  0.0405865 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0441  protein of unknown function DUF397  41.82 
 
 
63 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1444  protein of unknown function DUF397  43.86 
 
 
72 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.184265  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2266  hypothetical protein  43.28 
 
 
159 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0142951  hitchhiker  0.00561226 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1295  protein of unknown function DUF397  43.1 
 
 
82 aa  42.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2128  hypothetical protein  44.64 
 
 
62 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0413  protein of unknown function DUF397  41.27 
 
 
68 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0175926  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3941  protein of unknown function DUF397  36.21 
 
 
64 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272319  normal  0.0398541 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0716  protein of unknown function DUF397  35.94 
 
 
65 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1413  protein of unknown function DUF397  35.48 
 
 
66 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194771  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1445  protein of unknown function DUF397  40.74 
 
 
64 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.12043  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0513  hypothetical protein  45.45 
 
 
62 aa  41.6  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.47229  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0099  hypothetical protein  42.86 
 
 
63 aa  41.6  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0419317  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1786  hypothetical protein  44.64 
 
 
63 aa  42  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0673  protein of unknown function DUF397  39.34 
 
 
62 aa  41.6  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>