48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3930 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3930  protein of unknown function DUF397  100 
 
 
57 aa  121  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4137  protein of unknown function DUF397  62.5 
 
 
58 aa  75.1  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3929  protein of unknown function DUF397  64.81 
 
 
57 aa  74.7  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5452  protein of unknown function DUF397  52.73 
 
 
59 aa  66.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.455168  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2580  protein of unknown function DUF397  61.22 
 
 
59 aa  66.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0232734 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1543  protein of unknown function DUF397  58 
 
 
55 aa  62.8  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185149  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2689  protein of unknown function DUF397  49.09 
 
 
63 aa  58.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00137319  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2539  protein of unknown function DUF397  51.85 
 
 
60 aa  55.5  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000183418  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3155  protein of unknown function DUF397  47.17 
 
 
65 aa  54.7  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.093301  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2768  protein of unknown function DUF397  54 
 
 
56 aa  53.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.141211  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2579  protein of unknown function DUF397  55.36 
 
 
57 aa  53.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0222791 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2538  protein of unknown function DUF397  43.4 
 
 
62 aa  52.4  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000230929  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2540  protein of unknown function DUF397  50.94 
 
 
60 aa  52.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000021023  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1653  protein of unknown function DUF397  48.08 
 
 
59 aa  51.6  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0244936  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1657  hypothetical protein  43.64 
 
 
68 aa  51.2  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1876  protein of unknown function DUF397  50.91 
 
 
56 aa  51.2  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1652  protein of unknown function DUF397  50.98 
 
 
59 aa  50.4  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0828203  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1802  hypothetical protein  49.09 
 
 
63 aa  50.1  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20610  protein of unknown function (DUF397)  41.51 
 
 
64 aa  50.1  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.069741  normal  0.682793 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2541  protein of unknown function DUF397  45.28 
 
 
63 aa  50.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000122631  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0091  hypothetical protein  47.92 
 
 
63 aa  48.9  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.407205  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0708  hypothetical protein  41.67 
 
 
64 aa  48.5  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4609  protein of unknown function DUF397  43.4 
 
 
66 aa  48.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0262  hypothetical protein  44.64 
 
 
62 aa  47.8  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0215  hypothetical protein  41.82 
 
 
60 aa  47  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0973  hypothetical protein  40.43 
 
 
64 aa  47  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1090  protein of unknown function DUF397  51.06 
 
 
57 aa  46.2  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.552456 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20560  protein of unknown function (DUF397)  40 
 
 
66 aa  46.6  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715891  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12060  protein of unknown function (DUF397)  43.4 
 
 
65 aa  47  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1295  protein of unknown function DUF397  43.48 
 
 
82 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12020  protein of unknown function (DUF397)  40.74 
 
 
65 aa  46.2  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1875  protein of unknown function DUF397  47.17 
 
 
52 aa  46.2  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4682  protein of unknown function DUF397  42.31 
 
 
63 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1162  protein of unknown function DUF397  41.38 
 
 
62 aa  45.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.490498  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5445  protein of unknown function DUF397  49.06 
 
 
81 aa  45.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.644753  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6706  protein of unknown function DUF397  46.3 
 
 
59 aa  45.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7828  hypothetical protein  39.62 
 
 
69 aa  44.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24730  protein of unknown function (DUF397)  38.89 
 
 
69 aa  44.3  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1943  protein of unknown function DUF397  46.81 
 
 
55 aa  43.9  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2208  hypothetical protein  37.04 
 
 
61 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.280221  normal  0.523605 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0972  hypothetical protein  37.25 
 
 
61 aa  42.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2767  protein of unknown function DUF397  46.3 
 
 
60 aa  41.6  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0824129  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0228  hypothetical protein  44.44 
 
 
80 aa  41.6  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4244  protein of unknown function DUF397  38.89 
 
 
117 aa  41.6  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.258284 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5039  protein of unknown function DUF397  47.92 
 
 
61 aa  41.6  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.643266 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4784  protein of unknown function DUF397  35.59 
 
 
61 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2703  hypothetical protein  37.04 
 
 
67 aa  40.8  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2308  protein of unknown function DUF397  46.67 
 
 
60 aa  40.4  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>