52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1652 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1652  protein of unknown function DUF397  100 
 
 
59 aa  122  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0828203  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1653  protein of unknown function DUF397  81.36 
 
 
59 aa  102  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0244936  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1876  protein of unknown function DUF397  61.54 
 
 
56 aa  67  0.00000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2767  protein of unknown function DUF397  62.96 
 
 
60 aa  66.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0824129  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4682  protein of unknown function DUF397  59.26 
 
 
63 aa  65.9  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1657  hypothetical protein  50.94 
 
 
68 aa  65.9  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2768  protein of unknown function DUF397  60.34 
 
 
56 aa  61.2  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.141211  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2580  protein of unknown function DUF397  54.72 
 
 
59 aa  58.9  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0232734 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2541  protein of unknown function DUF397  49.06 
 
 
63 aa  57.8  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000122631  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2579  protein of unknown function DUF397  57.89 
 
 
57 aa  57.4  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0222791 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1802  hypothetical protein  55.56 
 
 
63 aa  57.4  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2538  protein of unknown function DUF397  46.43 
 
 
62 aa  56.6  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000230929  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1543  protein of unknown function DUF397  60.42 
 
 
55 aa  56.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185149  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3155  protein of unknown function DUF397  46.15 
 
 
65 aa  55.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.093301  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2689  protein of unknown function DUF397  49.06 
 
 
63 aa  56.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00137319  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3929  protein of unknown function DUF397  55.77 
 
 
57 aa  55.1  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2540  protein of unknown function DUF397  46.43 
 
 
60 aa  54.7  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000021023  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4137  protein of unknown function DUF397  48.21 
 
 
58 aa  53.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2539  protein of unknown function DUF397  44.64 
 
 
60 aa  53.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000183418  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0262  hypothetical protein  50 
 
 
62 aa  53.5  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5452  protein of unknown function DUF397  49.06 
 
 
59 aa  52  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.455168  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1090  protein of unknown function DUF397  58.33 
 
 
57 aa  50.1  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.552456 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5445  protein of unknown function DUF397  50.94 
 
 
81 aa  50.4  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.644753  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3930  protein of unknown function DUF397  50.98 
 
 
57 aa  50.4  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0228  hypothetical protein  52.83 
 
 
80 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1875  protein of unknown function DUF397  55.77 
 
 
52 aa  48.5  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5039  protein of unknown function DUF397  54.9 
 
 
61 aa  48.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.643266 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3777  protein of unknown function DUF397  43.64 
 
 
66 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4088  hypothetical protein  48.28 
 
 
57 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4609  protein of unknown function DUF397  46.15 
 
 
66 aa  47  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2308  protein of unknown function DUF397  55.56 
 
 
60 aa  45.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3778  protein of unknown function DUF397  44.23 
 
 
66 aa  45.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0485  protein of unknown function DUF397  38.6 
 
 
63 aa  44.3  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3776  protein of unknown function DUF397  40.38 
 
 
66 aa  44.3  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0091  hypothetical protein  43.64 
 
 
63 aa  43.9  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.407205  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1943  protein of unknown function DUF397  42.59 
 
 
55 aa  43.9  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5679  protein of unknown function DUF397  38.6 
 
 
63 aa  43.9  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0708  hypothetical protein  43.86 
 
 
64 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0487  protein of unknown function DUF397  38.46 
 
 
63 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3779  protein of unknown function DUF397  38.18 
 
 
66 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1230  protein of unknown function DUF397  38.46 
 
 
64 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0779142  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24730  protein of unknown function (DUF397)  48.08 
 
 
69 aa  42  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1295  protein of unknown function DUF397  39.29 
 
 
82 aa  41.6  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4515  protein of unknown function DUF397  48.98 
 
 
65 aa  41.6  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4159  protein of unknown function DUF397  42.31 
 
 
67 aa  41.6  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3780  protein of unknown function DUF397  40.38 
 
 
66 aa  42.4  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0486  protein of unknown function DUF397  40.38 
 
 
63 aa  41.2  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6706  protein of unknown function DUF397  41.07 
 
 
59 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1781  hypothetical protein  47.17 
 
 
69 aa  41.2  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6649  hypothetical protein  47.06 
 
 
79 aa  40.8  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.476212  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0631  hypothetical protein  40 
 
 
72 aa  40.8  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.243928  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0972  hypothetical protein  35.71 
 
 
61 aa  40  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>