94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6706 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6706  protein of unknown function DUF397  100 
 
 		 59 aa  122  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24730  protein of unknown function (DUF397)  52.83 
 
 		 69 aa  58.5  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7003  protein of unknown function DUF397  50.94 
 
 		 84 aa  55.5  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0228  hypothetical protein  51.79 
 
 		 80 aa  54.3  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3649  protein of unknown function DUF397  48.08 
 
 		 75 aa  52.8  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.375701  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2071  hypothetical protein  45.45 
 
 		 67 aa  50.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.392038  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1161  protein of unknown function DUF397  48.15 
 
 		 62 aa  50.8  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.653899  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1162  protein of unknown function DUF397  47.27 
 
 		 62 aa  50.4  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.490498  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0037  hypothetical protein  49.09 
 
 		 73 aa  50.4  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.727174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0042  hypothetical protein  49.09 
 
 		 73 aa  50.4  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6374  protein of unknown function DUF397  42.11 
 
 		 61 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0037  hypothetical protein  49.02 
 
 		 69 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3778  protein of unknown function DUF397  43.64 
 
 		 66 aa  48.9  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2538  protein of unknown function DUF397  40.35 
 
 		 62 aa  48.9  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000230929  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0487  protein of unknown function DUF397  38.18 
 
 		 63 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20610  protein of unknown function (DUF397)  41.82 
 
 		 64 aa  48.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.069741  normal  0.682793 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4783  protein of unknown function DUF397  41.38 
 
 		 64 aa  48.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2703  hypothetical protein  47.27 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1943  protein of unknown function DUF397  55.32 
 
 		 55 aa  48.1  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1834  protein of unknown function DUF397  44.44 
 
 		 59 aa  47.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0903  protein of unknown function DUF397  59.46 
 
 		 64 aa  47.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.558023  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1802  hypothetical protein  51.85 
 
 		 63 aa  47.8  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1230  protein of unknown function DUF397  41.51 
 
 		 64 aa  47.4  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0779142  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1413  protein of unknown function DUF397  39.29 
 
 		 66 aa  47.4  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194771  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2540  protein of unknown function DUF397  46.43 
 
 		 60 aa  47.4  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000021023  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0441  protein of unknown function DUF397  47.37 
 
 		 63 aa  47  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5232  hypothetical protein  37.97 
 
 		 79 aa  47.4  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.664195  normal  0.424507 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2539  protein of unknown function DUF397  43.86 
 
 		 60 aa  47  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000183418  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2580  protein of unknown function DUF397  44.23 
 
 		 59 aa  47  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0232734 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1416  hypothetical protein  49.06 
 
 		 63 aa  47  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0509701 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6122  protein of unknown function DUF397  45.28 
 
 		 61 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.464343  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4454  protein of unknown function DUF397  43.64 
 
 		 69 aa  47  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4784  protein of unknown function DUF397  40.35 
 
 		 61 aa  47  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2689  protein of unknown function DUF397  40.74 
 
 		 63 aa  46.2  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00137319  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0927  hypothetical protein  45.28 
 
 		 63 aa  46.2  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1159  hypothetical protein  46.15 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0339608  unclonable  0.0000000343885 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0972  hypothetical protein  45.28 
 
 		 61 aa  46.6  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1379  hypothetical protein  49.06 
 
 		 63 aa  46.6  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.383201  hitchhiker  0.00799748 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3657  hypothetical protein  41.82 
 
 		 62 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4235  hypothetical protein  48.15 
 
 		 62 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1786  hypothetical protein  45.28 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4515  protein of unknown function DUF397  46 
 
 		 65 aa  45.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4463  hypothetical protein  41.51 
 
 		 63 aa  45.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3930  protein of unknown function DUF397  46.3 
 
 		 57 aa  45.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3155  protein of unknown function DUF397  38.89 
 
 		 65 aa  45.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.093301  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3357  hypothetical protein  42.59 
 
 		 64 aa  45.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0411145  normal  0.0781791 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2128  hypothetical protein  44.23 
 
 		 62 aa  44.7  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4087  protein of unknown function DUF397  42.59 
 
 		 60 aa  44.7  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4781  protein of unknown function DUF397  34.48 
 
 		 64 aa  44.7  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0973  hypothetical protein  46 
 
 		 64 aa  44.7  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0643  hypothetical protein  45.45 
 
 		 61 aa  44.7  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5993  protein of unknown function DUF397  46.43 
 
 		 64 aa  44.3  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.342099  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2601  hypothetical protein  48.15 
 
 		 62 aa  44.3  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0203178  normal  0.0405865 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6649  hypothetical protein  46 
 
 		 79 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.476212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6435  protein of unknown function DUF397  50 
 
 		 57 aa  43.9  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4137  protein of unknown function DUF397  41.07 
 
 		 58 aa  43.9  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0513  hypothetical protein  45.45 
 
 		 62 aa  43.9  0.0009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.47229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2208  hypothetical protein  44.44 
 
 		 61 aa  43.5  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.280221  normal  0.523605 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3776  protein of unknown function DUF397  36.36 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0708  hypothetical protein  47.92 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4159  protein of unknown function DUF397  40 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5452  protein of unknown function DUF397  39.29 
 
 		 59 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.455168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2127  protein of unknown function DUF397  43.4 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000239677  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1304  protein of unknown function DUF397  53.33 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0379944  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12020  protein of unknown function (DUF397)  37.5 
 
 		 65 aa  43.5  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2579  protein of unknown function DUF397  42.86 
 
 		 57 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0222791 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3780  protein of unknown function DUF397  37.74 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1432  hypothetical protein  39.29 
 
 		 62 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353493  hitchhiker  0.000418088 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4695  protein of unknown function DUF397  36.54 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3236  hypothetical protein  43.4 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1543  protein of unknown function DUF397  46.81 
 
 		 55 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0262  hypothetical protein  37.5 
 
 		 62 aa  41.6  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3929  protein of unknown function DUF397  41.51 
 
 		 57 aa  41.6  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1653  protein of unknown function DUF397  39.29 
 
 		 59 aa  41.2  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0244936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8369  hypothetical protein  43.4 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2543  hypothetical protein  43.4 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0485  protein of unknown function DUF397  34.55 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3777  protein of unknown function DUF397  40.38 
 
 		 66 aa  41.2  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0103  hypothetical protein  43.4 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0486  protein of unknown function DUF397  33.33 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1897  hypothetical protein  45.28 
 
 		 64 aa  41.2  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.422  normal  0.225792 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4088  protein of unknown function DUF397  37.04 
 
 		 57 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12060  protein of unknown function (DUF397)  40.38 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1652  protein of unknown function DUF397  41.07 
 
 		 59 aa  41.2  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0828203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2541  protein of unknown function DUF397  37.74 
 
 		 63 aa  40.8  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000122631  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2448  hypothetical protein  43.86 
 
 		 62 aa  40.8  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.14038  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2429  protein of unknown function DUF397  42.86 
 
 		 61 aa  40.8  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20560  protein of unknown function (DUF397)  40.38 
 
 		 66 aa  40.8  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0099  hypothetical protein  41.51 
 
 		 63 aa  40.4  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0419317  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5086  hypothetical protein  41.82 
 
 		 77 aa  40.8  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000003971 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1627  protein of unknown function DUF397  45.1 
 
 		 59 aa  40.8  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1269  hypothetical protein  42.31 
 
 		 66 aa  40.4  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0993  hypothetical protein  43.4 
 
 		 67 aa  40.4  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5037  protein of unknown function DUF397  39.71 
 
 		 73 aa  40.4  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>