180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1781 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1781  hypothetical protein  100 
 
 		 69 aa  142  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0037  hypothetical protein  74.19 
 
 		 69 aa  95.5  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0228  hypothetical protein  69.7 
 
 		 80 aa  89  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6649  hypothetical protein  66.67 
 
 		 79 aa  85.9  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.476212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8369  hypothetical protein  61.76 
 
 		 67 aa  82.8  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0235  hypothetical protein  68.85 
 
 		 77 aa  82.8  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2703  hypothetical protein  63.24 
 
 		 67 aa  79.7  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7976  hypothetical protein  56.34 
 
 		 80 aa  75.5  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0545278  normal  0.164909 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1230  hypothetical protein  55.93 
 
 		 77 aa  73.9  0.0000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.375294 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37900  protein of unknown function (DUF397)  63.16 
 
 		 82 aa  73.9  0.0000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7763  hypothetical protein  63.16 
 
 		 68 aa  73.6  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0397  hypothetical protein  65.52 
 
 		 69 aa  69.7  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1329  hypothetical protein  66.67 
 
 		 68 aa  69.7  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4153  protein of unknown function DUF397  53.73 
 
 		 78 aa  70.1  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0993  hypothetical protein  56.92 
 
 		 67 aa  68.9  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2090  hypothetical protein  52.94 
 
 		 79 aa  68.9  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.161003  normal  0.0235666 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2231  hypothetical protein  58.33 
 
 		 79 aa  68.2  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0143015  normal  0.145093 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6482  hypothetical protein  51.35 
 
 		 76 aa  67.8  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.435568 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2513  hypothetical protein  56.14 
 
 		 78 aa  67  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1969  protein of unknown function DUF397  55 
 
 		 76 aa  65.9  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00185784  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2071  hypothetical protein  57.38 
 
 		 67 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.392038  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0265  protein of unknown function DUF397  59.32 
 
 		 68 aa  65.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138869  normal  0.97902 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0266  protein of unknown function DUF397  52.46 
 
 		 69 aa  65.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.687438  normal  0.998664 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1504  protein of unknown function DUF397  56.14 
 
 		 103 aa  65.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0599  hypothetical protein  55.22 
 
 		 69 aa  65.1  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0103  hypothetical protein  62.96 
 
 		 63 aa  64.7  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3657  hypothetical protein  56.14 
 
 		 62 aa  64.3  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1767  hypothetical protein  52.63 
 
 		 127 aa  64.3  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1295  hypothetical protein  47.76 
 
 		 78 aa  64.3  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.471559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5736  hypothetical protein  55 
 
 		 80 aa  64.3  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.534328 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3445  hypothetical protein  46.27 
 
 		 78 aa  63.9  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1897  hypothetical protein  62.75 
 
 		 64 aa  63.9  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.422  normal  0.225792 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3357  hypothetical protein  60.38 
 
 		 64 aa  63.5  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0411145  normal  0.0781791 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0708  hypothetical protein  61.82 
 
 		 64 aa  63.2  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5628  hypothetical protein  47.76 
 
 		 78 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.524184 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1379  hypothetical protein  62.75 
 
 		 63 aa  62.8  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.383201  hitchhiker  0.00799748 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1505  protein of unknown function DUF397  57.89 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.272297  hitchhiker  0.00205006 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3941  protein of unknown function DUF397  50.88 
 
 		 64 aa  62.8  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272319  normal  0.0398541 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3763  protein of unknown function DUF397  50 
 
 		 83 aa  63.2  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0521  protein of unknown function DUF397  46.27 
 
 		 77 aa  62.4  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2543  hypothetical protein  60.38 
 
 		 67 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14270  protein of unknown function (DUF397)  57.38 
 
 		 66 aa  62.8  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.784152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1019  hypothetical protein  48.75 
 
 		 81 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1416  hypothetical protein  62.75 
 
 		 63 aa  61.6  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0509701 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1588  hypothetical protein  51.61 
 
 		 71 aa  62  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1548  hypothetical protein  51.61 
 
 		 71 aa  62  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0220305  normal  0.0244583 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3236  hypothetical protein  56.9 
 
 		 63 aa  62  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1597  hypothetical protein  41.43 
 
 		 70 aa  61.6  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8470  protein of unknown function DUF397  54.39 
 
 		 92 aa  61.6  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2305  putative regulator  50.88 
 
 		 77 aa  61.6  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0567  protein of unknown function DUF397  59.65 
 
 		 95 aa  61.2  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4569  hypothetical protein  51.43 
 
 		 77 aa  60.8  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.246526 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0099  hypothetical protein  59.26 
 
 		 63 aa  60.8  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0419317  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1432  hypothetical protein  56.14 
 
 		 62 aa  60.8  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353493  hitchhiker  0.000418088 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5086  hypothetical protein  50.82 
 
 		 77 aa  61.2  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000003971 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1269  hypothetical protein  54.69 
 
 		 66 aa  60.8  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0876  protein of unknown function DUF397  44.78 
 
 		 80 aa  60.8  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24730  protein of unknown function (DUF397)  53.73 
 
 		 69 aa  60.1  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0972  hypothetical protein  52.63 
 
 		 61 aa  58.9  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0973  hypothetical protein  54.24 
 
 		 64 aa  59.3  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4568  hypothetical protein  48.48 
 
 		 77 aa  58.9  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.246526 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4124  hypothetical protein  52.63 
 
 		 75 aa  59.3  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7553  hypothetical protein  52.17 
 
 		 99 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2448  hypothetical protein  58.93 
 
 		 62 aa  58.2  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.14038  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3743  hypothetical protein  54.39 
 
 		 75 aa  58.2  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0905  hypothetical protein  56.14 
 
 		 76 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0955654 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1159  hypothetical protein  60.78 
 
 		 66 aa  58.2  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0339608  unclonable  0.0000000343885 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1657  hypothetical protein  47.46 
 
 		 68 aa  57.8  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6122  protein of unknown function DUF397  52.83 
 
 		 61 aa  57.4  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.464343  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0643  hypothetical protein  55 
 
 		 61 aa  57.4  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2969  hypothetical protein  50.88 
 
 		 68 aa  57.4  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000849623 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1304  protein of unknown function DUF397  61.22 
 
 		 68 aa  57  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0379944  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2128  hypothetical protein  54.72 
 
 		 62 aa  57  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0037  hypothetical protein  52.46 
 
 		 73 aa  56.2  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.727174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3009  hypothetical protein  55.36 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1444  protein of unknown function DUF397  54.84 
 
 		 72 aa  56.6  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.184265  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0927  hypothetical protein  56.86 
 
 		 63 aa  56.6  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0042  hypothetical protein  52.46 
 
 		 73 aa  56.2  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1786  hypothetical protein  56.86 
 
 		 63 aa  55.5  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1413  protein of unknown function DUF397  51.67 
 
 		 66 aa  55.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194771  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7828  hypothetical protein  53.45 
 
 		 69 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0631  hypothetical protein  54.9 
 
 		 72 aa  55.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.243928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0513  hypothetical protein  57.41 
 
 		 62 aa  55.5  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.47229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1517  hypothetical protein  50.94 
 
 		 68 aa  55.5  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0185029 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4463  hypothetical protein  48.28 
 
 		 63 aa  55.1  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1445  protein of unknown function DUF397  51.85 
 
 		 64 aa  54.7  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.12043  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2601  hypothetical protein  56.6 
 
 		 62 aa  54.7  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0203178  normal  0.0405865 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3856  hypothetical protein  64.44 
 
 		 72 aa  54.3  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3501  protein of unknown function DUF397  60.38 
 
 		 79 aa  54.3  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1802  hypothetical protein  48.28 
 
 		 63 aa  54.3  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36640  protein of unknown function (DUF397)  46.55 
 
 		 83 aa  54.3  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.0015395  normal  0.323981 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3503  protein of unknown function DUF397  46.67 
 
 		 65 aa  53.9  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0535915  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0716  protein of unknown function DUF397  49.15 
 
 		 65 aa  53.9  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1728  hypothetical protein  55.56 
 
 		 78 aa  53.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0749322  hitchhiker  0.00877773 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1230  protein of unknown function DUF397  43.55 
 
 		 64 aa  52.8  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0779142  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3476  hypothetical protein  62.22 
 
 		 72 aa  52.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1295  protein of unknown function DUF397  57.14 
 
 		 82 aa  51.6  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4504  hypothetical protein  50 
 
 		 62 aa  52  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.955874 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0924  hypothetical protein  43.33 
 
 		 63 aa  52  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.277312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6435  protein of unknown function DUF397  56.52 
 
 		 57 aa  52  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>