131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1657 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1657  hypothetical protein  100 
 
 
68 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0262  hypothetical protein  58.18 
 
 
62 aa  74.3  0.0000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1802  hypothetical protein  61.4 
 
 
63 aa  71.6  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1876  protein of unknown function DUF397  56.6 
 
 
56 aa  68.6  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1652  protein of unknown function DUF397  50.94 
 
 
59 aa  65.9  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0828203  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4682  protein of unknown function DUF397  52.73 
 
 
63 aa  64.3  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2767  protein of unknown function DUF397  53.85 
 
 
60 aa  63.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0824129  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1653  protein of unknown function DUF397  48.08 
 
 
59 aa  63.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0244936  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1543  protein of unknown function DUF397  57.14 
 
 
55 aa  61.2  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185149  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0091  hypothetical protein  49.15 
 
 
63 aa  59.7  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.407205  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2540  protein of unknown function DUF397  44.44 
 
 
60 aa  60.1  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000021023  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3155  protein of unknown function DUF397  43.64 
 
 
65 aa  59.7  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.093301  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5445  protein of unknown function DUF397  58.49 
 
 
81 aa  58.9  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.644753  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3929  protein of unknown function DUF397  52.83 
 
 
57 aa  58.9  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0972  hypothetical protein  53.85 
 
 
61 aa  58.5  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1090  protein of unknown function DUF397  52.94 
 
 
57 aa  58.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.552456 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2768  protein of unknown function DUF397  53.85 
 
 
56 aa  58.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.141211  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2541  protein of unknown function DUF397  48.08 
 
 
63 aa  58.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000122631  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0973  hypothetical protein  47.17 
 
 
64 aa  58.2  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4378  hypothetical protein  49.09 
 
 
62 aa  57.8  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1781  hypothetical protein  47.46 
 
 
69 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2539  protein of unknown function DUF397  40.74 
 
 
60 aa  57.8  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000183418  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2689  protein of unknown function DUF397  43.1 
 
 
63 aa  57.4  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00137319  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0037  hypothetical protein  47.46 
 
 
69 aa  57  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1230  protein of unknown function DUF397  43.86 
 
 
64 aa  57  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0779142  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0099  hypothetical protein  45 
 
 
63 aa  57  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0419317  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7828  hypothetical protein  45.9 
 
 
69 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2538  protein of unknown function DUF397  41.82 
 
 
62 aa  56.6  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000230929  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2580  protein of unknown function DUF397  50.98 
 
 
59 aa  55.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0232734 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7763  hypothetical protein  45.9 
 
 
68 aa  55.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0215  hypothetical protein  48.15 
 
 
60 aa  55.1  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4869  hypothetical protein  46.3 
 
 
60 aa  55.5  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.277477  normal  0.940812 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5452  protein of unknown function DUF397  45.45 
 
 
59 aa  55.1  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.455168  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1329  hypothetical protein  45.9 
 
 
68 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0393  hypothetical protein  50.85 
 
 
63 aa  54.3  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4137  protein of unknown function DUF397  45.45 
 
 
58 aa  54.3  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1875  protein of unknown function DUF397  51.92 
 
 
52 aa  54.3  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0631  hypothetical protein  41.94 
 
 
72 aa  53.9  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.243928  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0708  hypothetical protein  43.64 
 
 
64 aa  53.9  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0103  hypothetical protein  43.33 
 
 
63 aa  53.9  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6649  hypothetical protein  40.98 
 
 
79 aa  53.9  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.476212  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7976  hypothetical protein  43.48 
 
 
80 aa  53.5  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0545278  normal  0.164909 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2308  protein of unknown function DUF397  62.22 
 
 
60 aa  53.5  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1295  protein of unknown function DUF397  48.15 
 
 
82 aa  53.5  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1943  protein of unknown function DUF397  46.3 
 
 
55 aa  53.5  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3357  hypothetical protein  44.07 
 
 
64 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0411145  normal  0.0781791 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0228  hypothetical protein  42.59 
 
 
80 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3501  protein of unknown function DUF397  41.18 
 
 
79 aa  52.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0235  hypothetical protein  45.16 
 
 
77 aa  52.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2579  protein of unknown function DUF397  50 
 
 
57 aa  52  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0222791 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4695  protein of unknown function DUF397  37.7 
 
 
127 aa  52.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6122  protein of unknown function DUF397  42.37 
 
 
61 aa  52  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.464343  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1432  hypothetical protein  43.64 
 
 
62 aa  51.2  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353493  hitchhiker  0.000418088 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3930  protein of unknown function DUF397  43.64 
 
 
57 aa  51.2  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3657  hypothetical protein  40.68 
 
 
62 aa  50.8  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5039  protein of unknown function DUF397  56.25 
 
 
61 aa  50.4  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.643266 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3236  hypothetical protein  41.67 
 
 
63 aa  50.4  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4568  hypothetical protein  37.31 
 
 
77 aa  50.4  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.246526 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0716  protein of unknown function DUF397  40 
 
 
65 aa  50.1  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2703  hypothetical protein  39.34 
 
 
67 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4515  protein of unknown function DUF397  43.14 
 
 
65 aa  50.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1379  hypothetical protein  43.1 
 
 
63 aa  50.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.383201  hitchhiker  0.00799748 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0486  protein of unknown function DUF397  40.32 
 
 
63 aa  49.7  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0037  hypothetical protein  40 
 
 
73 aa  49.3  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.727174  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0042  hypothetical protein  40 
 
 
73 aa  49.3  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4124  hypothetical protein  40 
 
 
75 aa  49.3  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701856  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2543  hypothetical protein  42.86 
 
 
67 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258706  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1745  hypothetical protein  41.82 
 
 
64 aa  48.9  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.64493  normal  0.800474 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8369  hypothetical protein  43.75 
 
 
67 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4609  protein of unknown function DUF397  38.98 
 
 
66 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3743  hypothetical protein  40 
 
 
75 aa  48.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0266  protein of unknown function DUF397  42.62 
 
 
69 aa  47.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.687438  normal  0.998664 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3503  protein of unknown function DUF397  39.66 
 
 
65 aa  47.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0535915  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4087  protein of unknown function DUF397  39.29 
 
 
60 aa  47.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24730  protein of unknown function (DUF397)  40.98 
 
 
69 aa  47.8  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0993  hypothetical protein  40.32 
 
 
67 aa  47.4  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1416  hypothetical protein  41.38 
 
 
63 aa  47.4  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0509701 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1786  hypothetical protein  41.38 
 
 
63 aa  47.4  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5086  hypothetical protein  34.85 
 
 
77 aa  47.4  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000003971 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1834  protein of unknown function DUF397  43.4 
 
 
59 aa  47.4  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1897  hypothetical protein  42.37 
 
 
64 aa  47  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.422  normal  0.225792 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1413  protein of unknown function DUF397  33.93 
 
 
66 aa  47  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194771  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2448  hypothetical protein  40.98 
 
 
62 aa  47  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.14038  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0927  hypothetical protein  39.66 
 
 
63 aa  46.2  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1728  hypothetical protein  37.93 
 
 
78 aa  46.2  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0749322  hitchhiker  0.00877773 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2128  hypothetical protein  38.6 
 
 
62 aa  46.6  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5679  protein of unknown function DUF397  37.04 
 
 
63 aa  46.2  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3776  protein of unknown function DUF397  35.59 
 
 
66 aa  46.2  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3778  protein of unknown function DUF397  35.59 
 
 
66 aa  47  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2071  hypothetical protein  38.33 
 
 
67 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.392038  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4463  hypothetical protein  40 
 
 
63 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4489  protein of unknown function DUF397  48.15 
 
 
59 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36640  protein of unknown function (DUF397)  40.74 
 
 
83 aa  46.2  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.0015395  normal  0.323981 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3763  protein of unknown function DUF397  28.57 
 
 
83 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3777  protein of unknown function DUF397  37.04 
 
 
66 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3780  protein of unknown function DUF397  32.79 
 
 
66 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6482  hypothetical protein  36.99 
 
 
76 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.435568 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1269  hypothetical protein  37.74 
 
 
66 aa  45.1  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4159  protein of unknown function DUF397  37.93 
 
 
67 aa  45.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3009  hypothetical protein  39.34 
 
 
113 aa  44.7  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>