64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4088 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4088  hypothetical protein  100 
 
 
57 aa  117  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0485  protein of unknown function DUF397  53.85 
 
 
63 aa  58.2  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2541  protein of unknown function DUF397  58.82 
 
 
63 aa  57  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000122631  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3155  protein of unknown function DUF397  53.85 
 
 
65 aa  55.1  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.093301  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0486  protein of unknown function DUF397  50 
 
 
63 aa  54.3  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2540  protein of unknown function DUF397  54.55 
 
 
60 aa  53.9  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000021023  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1230  protein of unknown function DUF397  51.92 
 
 
64 aa  53.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0779142  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2689  protein of unknown function DUF397  53.7 
 
 
63 aa  52.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00137319  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0631  hypothetical protein  49.09 
 
 
72 aa  52  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.243928  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2539  protein of unknown function DUF397  50.91 
 
 
60 aa  51.2  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000183418  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3357  hypothetical protein  50.91 
 
 
64 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0411145  normal  0.0781791 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0103  hypothetical protein  50 
 
 
63 aa  50.4  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2538  protein of unknown function DUF397  49.09 
 
 
62 aa  49.7  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000230929  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4087  protein of unknown function DUF397  50.98 
 
 
60 aa  49.7  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0099  hypothetical protein  48.21 
 
 
63 aa  48.9  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0419317  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1416  hypothetical protein  46.43 
 
 
63 aa  47.8  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0509701 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0487  protein of unknown function DUF397  45.1 
 
 
63 aa  47.4  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7763  hypothetical protein  53.85 
 
 
68 aa  47.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3777  protein of unknown function DUF397  50.98 
 
 
66 aa  47  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3236  hypothetical protein  48.21 
 
 
63 aa  47  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3779  protein of unknown function DUF397  43.14 
 
 
66 aa  47  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5232  hypothetical protein  48.98 
 
 
79 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.664195  normal  0.424507 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1652  protein of unknown function DUF397  48.28 
 
 
59 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0828203  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3780  protein of unknown function DUF397  46.15 
 
 
66 aa  46.2  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0228  hypothetical protein  56.25 
 
 
80 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5452  protein of unknown function DUF397  44.44 
 
 
59 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.455168  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3776  protein of unknown function DUF397  43.14 
 
 
66 aa  45.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4159  protein of unknown function DUF397  49.06 
 
 
67 aa  45.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1379  hypothetical protein  44.64 
 
 
63 aa  45.4  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.383201  hitchhiker  0.00799748 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24730  protein of unknown function (DUF397)  53.06 
 
 
69 aa  45.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36640  protein of unknown function (DUF397)  41.51 
 
 
83 aa  44.7  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.0015395  normal  0.323981 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4695  protein of unknown function DUF397  45.28 
 
 
127 aa  44.7  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0673  protein of unknown function DUF397  48.08 
 
 
62 aa  44.3  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1653  protein of unknown function DUF397  48.08 
 
 
59 aa  44.7  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0244936  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1897  hypothetical protein  45.45 
 
 
64 aa  44.7  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.422  normal  0.225792 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4783  protein of unknown function DUF397  43.64 
 
 
64 aa  44.3  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1786  hypothetical protein  45.28 
 
 
63 aa  44.3  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3778  protein of unknown function DUF397  47.06 
 
 
66 aa  43.9  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4784  protein of unknown function DUF397  43.64 
 
 
61 aa  43.9  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4515  protein of unknown function DUF397  45.1 
 
 
65 aa  43.9  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4781  protein of unknown function DUF397  43.64 
 
 
64 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3929  protein of unknown function DUF397  45.1 
 
 
57 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1657  hypothetical protein  42.31 
 
 
68 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0417  protein of unknown function DUF397  48.21 
 
 
63 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5993  protein of unknown function DUF397  44.44 
 
 
64 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.342099  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4463  hypothetical protein  41.07 
 
 
63 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0927  hypothetical protein  41.07 
 
 
63 aa  43.5  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1432  hypothetical protein  46 
 
 
62 aa  43.5  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353493  hitchhiker  0.000418088 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1781  hypothetical protein  50 
 
 
69 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1161  protein of unknown function DUF397  45.28 
 
 
62 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.653899  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0441  protein of unknown function DUF397  48 
 
 
63 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0265  protein of unknown function DUF397  45.45 
 
 
68 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138869  normal  0.97902 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3657  hypothetical protein  42.31 
 
 
62 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0972  hypothetical protein  46.3 
 
 
61 aa  41.6  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2767  protein of unknown function DUF397  47.92 
 
 
60 aa  41.6  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0824129  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2128  hypothetical protein  39.29 
 
 
62 aa  41.2  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3503  protein of unknown function DUF397  48.15 
 
 
65 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0535915  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0108  protein of unknown function DUF397  50 
 
 
61 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4247  helix-turn-helix domain-containing protein  46.15 
 
 
410 aa  40.8  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.710263  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3649  protein of unknown function DUF397  41.82 
 
 
75 aa  40.8  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.375701  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0037  hypothetical protein  46 
 
 
69 aa  40  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4869  hypothetical protein  43.14 
 
 
60 aa  40  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.277477  normal  0.940812 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1413  protein of unknown function DUF397  42.31 
 
 
66 aa  40  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194771  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1943  protein of unknown function DUF397  46.15 
 
 
63 aa  40  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00825556  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>