94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5452 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014211  Ndas_5452  protein of unknown function DUF397  100 
 
 
59 aa  125  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.455168  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2580  protein of unknown function DUF397  64.15 
 
 
59 aa  76.3  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0232734 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3929  protein of unknown function DUF397  60.38 
 
 
57 aa  75.1  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4137  protein of unknown function DUF397  52.63 
 
 
58 aa  65.9  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3930  protein of unknown function DUF397  52.73 
 
 
57 aa  66.2  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1543  protein of unknown function DUF397  60 
 
 
55 aa  64.7  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185149  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2579  protein of unknown function DUF397  51.79 
 
 
57 aa  61.6  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0222791 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1802  hypothetical protein  49.09 
 
 
63 aa  57.4  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0262  hypothetical protein  48.21 
 
 
62 aa  56.6  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1230  protein of unknown function DUF397  50.91 
 
 
64 aa  56.6  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0779142  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4783  protein of unknown function DUF397  49.12 
 
 
64 aa  55.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1657  hypothetical protein  45.45 
 
 
68 aa  55.1  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4682  protein of unknown function DUF397  47.46 
 
 
63 aa  54.7  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5445  protein of unknown function DUF397  49.02 
 
 
81 aa  54.3  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.644753  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2539  protein of unknown function DUF397  49.06 
 
 
60 aa  53.9  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000183418  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2540  protein of unknown function DUF397  49.06 
 
 
60 aa  53.5  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000021023  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3501  protein of unknown function DUF397  43.64 
 
 
79 aa  52.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2768  protein of unknown function DUF397  48.08 
 
 
56 aa  52.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.141211  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20610  protein of unknown function (DUF397)  36.67 
 
 
64 aa  52.8  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.069741  normal  0.682793 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24730  protein of unknown function (DUF397)  46.3 
 
 
69 aa  51.6  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2689  protein of unknown function DUF397  49.06 
 
 
63 aa  52  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00137319  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0708  hypothetical protein  46.94 
 
 
64 aa  52  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4784  protein of unknown function DUF397  42.11 
 
 
61 aa  52  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1652  protein of unknown function DUF397  49.06 
 
 
59 aa  52  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0828203  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2541  protein of unknown function DUF397  43.1 
 
 
63 aa  50.8  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000122631  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4159  protein of unknown function DUF397  45.45 
 
 
67 aa  50.8  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2703  hypothetical protein  41.82 
 
 
67 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1653  protein of unknown function DUF397  40.35 
 
 
59 aa  50.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0244936  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4695  protein of unknown function DUF397  42.59 
 
 
127 aa  50.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2308  protein of unknown function DUF397  50 
 
 
60 aa  50.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1943  protein of unknown function DUF397  46.15 
 
 
55 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7553  hypothetical protein  45.45 
 
 
99 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1295  protein of unknown function DUF397  42.11 
 
 
82 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5232  hypothetical protein  43.4 
 
 
79 aa  48.9  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.664195  normal  0.424507 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1876  protein of unknown function DUF397  47.17 
 
 
56 aa  48.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1875  protein of unknown function DUF397  43.14 
 
 
52 aa  47.8  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0486  protein of unknown function DUF397  45.28 
 
 
63 aa  47.8  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4489  protein of unknown function DUF397  43.33 
 
 
59 aa  47.8  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0487  protein of unknown function DUF397  46.15 
 
 
63 aa  47.4  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2538  protein of unknown function DUF397  45.28 
 
 
62 aa  47.4  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000230929  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0972  hypothetical protein  41.18 
 
 
61 aa  47.4  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3155  protein of unknown function DUF397  40.35 
 
 
65 aa  47  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.093301  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8369  hypothetical protein  44.44 
 
 
67 aa  47  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0973  hypothetical protein  41.18 
 
 
64 aa  47  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4781  protein of unknown function DUF397  41.82 
 
 
64 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20560  protein of unknown function (DUF397)  32.26 
 
 
66 aa  46.6  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715891  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12060  protein of unknown function (DUF397)  37.5 
 
 
65 aa  46.2  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12020  protein of unknown function (DUF397)  37.74 
 
 
65 aa  47  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7763  hypothetical protein  43.64 
 
 
68 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3357  hypothetical protein  46.43 
 
 
64 aa  45.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0411145  normal  0.0781791 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0091  hypothetical protein  39.62 
 
 
63 aa  45.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.407205  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0228  hypothetical protein  42.37 
 
 
80 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3780  protein of unknown function DUF397  41.07 
 
 
66 aa  46.2  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4088  hypothetical protein  44.44 
 
 
57 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5993  protein of unknown function DUF397  42.59 
 
 
64 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.342099  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0485  protein of unknown function DUF397  43.1 
 
 
63 aa  45.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3776  protein of unknown function DUF397  41.07 
 
 
66 aa  45.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1413  protein of unknown function DUF397  44.44 
 
 
66 aa  45.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194771  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0716  protein of unknown function DUF397  43.4 
 
 
65 aa  45.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0673  protein of unknown function DUF397  40.74 
 
 
62 aa  45.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4088  protein of unknown function DUF397  44.44 
 
 
57 aa  44.7  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1090  protein of unknown function DUF397  47.92 
 
 
57 aa  44.7  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.552456 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3778  protein of unknown function DUF397  42.86 
 
 
66 aa  44.7  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0643  hypothetical protein  45.65 
 
 
61 aa  44.3  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6122  protein of unknown function DUF397  35.85 
 
 
61 aa  43.9  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.464343  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1480  protein of unknown function DUF397  39.29 
 
 
59 aa  43.9  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2767  protein of unknown function DUF397  42.59 
 
 
60 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0824129  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1517  hypothetical protein  46.94 
 
 
68 aa  43.5  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0185029 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6435  protein of unknown function DUF397  41.67 
 
 
57 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0631  hypothetical protein  45.45 
 
 
72 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.243928  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6706  protein of unknown function DUF397  39.29 
 
 
59 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3941  protein of unknown function DUF397  40.74 
 
 
64 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272319  normal  0.0398541 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4579  protein of unknown function DUF397  38.89 
 
 
70 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2208  hypothetical protein  36.36 
 
 
61 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.280221  normal  0.523605 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4609  protein of unknown function DUF397  36.67 
 
 
66 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2969  hypothetical protein  40.38 
 
 
68 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000849623 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1432  hypothetical protein  46.81 
 
 
62 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353493  hitchhiker  0.000418088 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1445  protein of unknown function DUF397  40.74 
 
 
64 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.12043  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7003  protein of unknown function DUF397  41.18 
 
 
84 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36640  protein of unknown function (DUF397)  36.67 
 
 
83 aa  42  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.0015395  normal  0.323981 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1304  protein of unknown function DUF397  39.22 
 
 
68 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0379944  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5679  protein of unknown function DUF397  40.74 
 
 
63 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1379  hypothetical protein  39.29 
 
 
63 aa  41.6  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.383201  hitchhiker  0.00799748 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3657  hypothetical protein  43.14 
 
 
62 aa  41.2  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3777  protein of unknown function DUF397  39.29 
 
 
66 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3779  protein of unknown function DUF397  38.89 
 
 
66 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5396  protein of unknown function DUF397  42.86 
 
 
66 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.051071  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1229  protein of unknown function DUF397  43.64 
 
 
62 aa  40.8  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0775452  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1161  protein of unknown function DUF397  37.5 
 
 
62 aa  40.8  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.653899  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0099  hypothetical protein  37.5 
 
 
63 aa  40.8  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0419317  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4272  protein of unknown function DUF397  38.18 
 
 
75 aa  40.4  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4454  protein of unknown function DUF397  37.04 
 
 
69 aa  40  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0037  hypothetical protein  38.89 
 
 
73 aa  40  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.727174  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1132  hypothetical protein  38.89 
 
 
65 aa  40  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>