50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2208 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2208  hypothetical protein  100 
 
 		 61 aa  124  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.280221  normal  0.523605 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24730  protein of unknown function (DUF397)  42.86 
 
 		 69 aa  49.3  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1269  hypothetical protein  49.06 
 
 		 66 aa  48.9  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37900  protein of unknown function (DUF397)  50 
 
 		 82 aa  48.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1781  hypothetical protein  51.85 
 
 		 69 aa  47  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1432  hypothetical protein  43.33 
 
 		 62 aa  46.2  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353493  hitchhiker  0.000418088 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1159  hypothetical protein  46.15 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0339608  unclonable  0.0000000343885 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2703  hypothetical protein  39.29 
 
 		 67 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1379  hypothetical protein  47.27 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.383201  hitchhiker  0.00799748 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1416  hypothetical protein  47.27 
 
 		 63 aa  45.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0509701 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0643  hypothetical protein  41.38 
 
 		 61 aa  45.1  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0235  hypothetical protein  48.08 
 
 		 77 aa  44.7  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6374  protein of unknown function DUF397  40 
 
 		 61 aa  44.3  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0266  protein of unknown function DUF397  41.51 
 
 		 69 aa  44.3  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.687438  normal  0.998664 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8369  hypothetical protein  48.08 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2969  hypothetical protein  43.86 
 
 		 68 aa  43.9  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000849623 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4609  protein of unknown function DUF397  40.35 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0716  protein of unknown function DUF397  35.71 
 
 		 65 aa  43.9  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6706  protein of unknown function DUF397  44.44 
 
 		 59 aa  43.5  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0099  hypothetical protein  47.27 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0419317  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6649  hypothetical protein  50 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.476212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4784  protein of unknown function DUF397  41.67 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4235  hypothetical protein  42.11 
 
 		 62 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3930  protein of unknown function DUF397  37.04 
 
 		 57 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6122  protein of unknown function DUF397  34.62 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.464343  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0228  hypothetical protein  46.15 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6435  protein of unknown function DUF397  47.73 
 
 		 57 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2071  hypothetical protein  48.08 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.392038  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2089  hypothetical protein  57.89 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5452  protein of unknown function DUF397  36.36 
 
 		 59 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.455168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3236  hypothetical protein  46.3 
 
 		 63 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0993  hypothetical protein  41.51 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0599  hypothetical protein  44.44 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1329  hypothetical protein  42.55 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3743  hypothetical protein  47.27 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4124  hypothetical protein  43.4 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1745  hypothetical protein  40 
 
 		 64 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.64493  normal  0.800474 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4607  protein of unknown function DUF397  47.17 
 
 		 71 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833005  normal  0.354831 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2543  hypothetical protein  54.17 
 
 		 67 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3657  hypothetical protein  42.37 
 
 		 62 aa  41.6  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3357  hypothetical protein  41.38 
 
 		 64 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0411145  normal  0.0781791 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0103  hypothetical protein  43.64 
 
 		 63 aa  40.8  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4244  protein of unknown function DUF397  42.22 
 
 		 117 aa  40.8  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.258284 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1517  hypothetical protein  40 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0185029 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2601  hypothetical protein  43.4 
 
 		 62 aa  40.8  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0203178  normal  0.0405865 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3941  protein of unknown function DUF397  48.08 
 
 		 64 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272319  normal  0.0398541 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2448  hypothetical protein  52.27 
 
 		 62 aa  40.4  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.14038  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0927  hypothetical protein  40 
 
 		 63 aa  40.4  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7828  hypothetical protein  36.84 
 
 		 69 aa  40.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1504  protein of unknown function DUF397  44.23 
 
 		 103 aa  40  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>