32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4607 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4607  protein of unknown function DUF397  100 
 
 		 71 aa  142  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833005  normal  0.354831 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6435  protein of unknown function DUF397  49.02 
 
 		 57 aa  48.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7763  hypothetical protein  51.02 
 
 		 68 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3357  hypothetical protein  40 
 
 		 64 aa  45.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0411145  normal  0.0781791 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0266  protein of unknown function DUF397  39.22 
 
 		 69 aa  45.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.687438  normal  0.998664 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0265  protein of unknown function DUF397  42.59 
 
 		 68 aa  45.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138869  normal  0.97902 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0716  protein of unknown function DUF397  43.14 
 
 		 65 aa  45.1  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1379  hypothetical protein  41.82 
 
 		 63 aa  45.1  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.383201  hitchhiker  0.00799748 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0972  hypothetical protein  45.1 
 
 		 61 aa  44.3  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8369  hypothetical protein  48.08 
 
 		 67 aa  43.9  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1416  hypothetical protein  41.07 
 
 		 63 aa  43.9  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0509701 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0973  hypothetical protein  45.83 
 
 		 64 aa  43.5  0.0009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0228  hypothetical protein  44.9 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0037  hypothetical protein  52.94 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3236  hypothetical protein  40 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14270  protein of unknown function (DUF397)  39.22 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.784152  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4515  protein of unknown function DUF397  48.98 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0099  hypothetical protein  41.82 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0419317  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0718  protein of unknown function DUF397  41.18 
 
 		 73 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2448  hypothetical protein  45.45 
 
 		 62 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.14038  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2208  hypothetical protein  47.17 
 
 		 61 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.280221  normal  0.523605 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1090  protein of unknown function DUF397  45.83 
 
 		 57 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.552456 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0103  hypothetical protein  41.82 
 
 		 63 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0643  hypothetical protein  37.25 
 
 		 61 aa  41.2  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0513  hypothetical protein  40.74 
 
 		 62 aa  41.2  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.47229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0262  hypothetical protein  41.51 
 
 		 62 aa  41.2  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24730  protein of unknown function (DUF397)  43.4 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0927  hypothetical protein  41.82 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3009  hypothetical protein  38.18 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0708  hypothetical protein  41.67 
 
 		 64 aa  40.4  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2969  hypothetical protein  35.42 
 
 		 68 aa  40  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000849623 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1432  hypothetical protein  40.38 
 
 		 62 aa  40  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353493  hitchhiker  0.000418088 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>