150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1432 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1432  hypothetical protein  100 
 
 
62 aa  127  6e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353493  hitchhiker  0.000418088 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3657  hypothetical protein  78.69 
 
 
62 aa  102  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1379  hypothetical protein  85.71 
 
 
63 aa  102  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.383201  hitchhiker  0.00799748 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3236  hypothetical protein  85.71 
 
 
63 aa  102  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2128  hypothetical protein  75.41 
 
 
62 aa  99  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0099  hypothetical protein  82.14 
 
 
63 aa  98.2  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0419317  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1416  hypothetical protein  82.14 
 
 
63 aa  97.8  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0509701 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0927  hypothetical protein  80.36 
 
 
63 aa  97.4  5e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0643  hypothetical protein  80 
 
 
61 aa  97.1  8e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0103  hypothetical protein  80.36 
 
 
63 aa  96.3  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3009  hypothetical protein  83.93 
 
 
113 aa  95.5  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1786  hypothetical protein  78.57 
 
 
63 aa  94.4  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0513  hypothetical protein  74.19 
 
 
62 aa  91.3  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.47229  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1897  hypothetical protein  75 
 
 
64 aa  91.3  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.422  normal  0.225792 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2601  hypothetical protein  73.33 
 
 
62 aa  89  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0203178  normal  0.0405865 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7763  hypothetical protein  70.18 
 
 
68 aa  88.6  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4378  hypothetical protein  67.21 
 
 
62 aa  88.2  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4463  hypothetical protein  71.43 
 
 
63 aa  87.8  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3357  hypothetical protein  69.64 
 
 
64 aa  85.9  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0411145  normal  0.0781791 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2448  hypothetical protein  71.67 
 
 
62 aa  85.5  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.14038  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4869  hypothetical protein  64.41 
 
 
60 aa  84.3  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.277477  normal  0.940812 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4504  hypothetical protein  63.33 
 
 
62 aa  79.7  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.955874 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4235  hypothetical protein  66.07 
 
 
62 aa  77  0.00000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1517  hypothetical protein  62.5 
 
 
68 aa  73.9  0.0000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0185029 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2969  hypothetical protein  61.67 
 
 
68 aa  72.4  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000849623 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0037  hypothetical protein  60 
 
 
73 aa  68.2  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.727174  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0042  hypothetical protein  60 
 
 
73 aa  68.2  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1159  hypothetical protein  57.14 
 
 
66 aa  62.4  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0339608  unclonable  0.0000000343885 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0235  hypothetical protein  57.14 
 
 
77 aa  61.2  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1781  hypothetical protein  56.14 
 
 
69 aa  60.8  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7976  hypothetical protein  46.27 
 
 
80 aa  60.8  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0545278  normal  0.164909 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2543  hypothetical protein  55.93 
 
 
67 aa  60.8  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258706  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6649  hypothetical protein  63.27 
 
 
79 aa  60.5  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.476212  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1329  hypothetical protein  57.89 
 
 
68 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2071  hypothetical protein  52.63 
 
 
67 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.392038  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0228  hypothetical protein  60 
 
 
80 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2703  hypothetical protein  52.54 
 
 
67 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0599  hypothetical protein  56.6 
 
 
69 aa  57.4  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1269  hypothetical protein  53.57 
 
 
66 aa  57  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0485  protein of unknown function DUF397  47.27 
 
 
63 aa  56.6  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4255  hypothetical protein  53.23 
 
 
69 aa  55.5  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.912797  normal  0.127607 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6482  hypothetical protein  48.57 
 
 
76 aa  55.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.435568 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4685  hypothetical protein  53.23 
 
 
69 aa  55.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.144765  normal  0.226614 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0716  protein of unknown function DUF397  50.88 
 
 
65 aa  56.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0037  hypothetical protein  57.14 
 
 
69 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4124  hypothetical protein  49.15 
 
 
75 aa  55.1  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701856  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0708  hypothetical protein  55.56 
 
 
64 aa  54.7  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1728  hypothetical protein  57.41 
 
 
78 aa  54.7  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0749322  hitchhiker  0.00877773 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0266  protein of unknown function DUF397  47.37 
 
 
69 aa  54.7  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.687438  normal  0.998664 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1745  hypothetical protein  53.7 
 
 
64 aa  54.3  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.64493  normal  0.800474 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4695  protein of unknown function DUF397  49.09 
 
 
127 aa  54.3  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0993  hypothetical protein  49.23 
 
 
67 aa  54.3  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0487  protein of unknown function DUF397  44.44 
 
 
63 aa  53.5  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3743  hypothetical protein  50.85 
 
 
75 aa  53.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1834  protein of unknown function DUF397  48.15 
 
 
59 aa  53.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0718  protein of unknown function DUF397  48.21 
 
 
73 aa  53.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7553  hypothetical protein  41.18 
 
 
99 aa  52  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8369  hypothetical protein  56 
 
 
67 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37900  protein of unknown function (DUF397)  46.55 
 
 
82 aa  52.8  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1445  protein of unknown function DUF397  43.33 
 
 
64 aa  52.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.12043  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0265  protein of unknown function DUF397  50 
 
 
68 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138869  normal  0.97902 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1413  protein of unknown function DUF397  50 
 
 
66 aa  52  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194771  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0397  hypothetical protein  53.57 
 
 
69 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3778  protein of unknown function DUF397  48.15 
 
 
66 aa  51.2  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0486  protein of unknown function DUF397  46 
 
 
63 aa  51.6  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1230  protein of unknown function DUF397  48 
 
 
64 aa  51.2  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0779142  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1019  hypothetical protein  44.93 
 
 
81 aa  51.6  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0262  hypothetical protein  49.02 
 
 
62 aa  51.2  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1657  hypothetical protein  43.64 
 
 
68 aa  51.2  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0973  hypothetical protein  50.94 
 
 
64 aa  50.8  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1230  hypothetical protein  47.27 
 
 
77 aa  50.8  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.375294 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6435  protein of unknown function DUF397  57.78 
 
 
57 aa  50.8  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3776  protein of unknown function DUF397  52.17 
 
 
66 aa  50.4  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1132  hypothetical protein  55.1 
 
 
65 aa  49.7  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7828  hypothetical protein  51.79 
 
 
69 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4569  hypothetical protein  46.55 
 
 
77 aa  50.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.246526 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4579  protein of unknown function DUF397  45.61 
 
 
70 aa  49.7  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24730  protein of unknown function (DUF397)  49.15 
 
 
69 aa  50.1  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36640  protein of unknown function (DUF397)  53.06 
 
 
83 aa  50.1  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.0015395  normal  0.323981 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4781  protein of unknown function DUF397  39.66 
 
 
64 aa  49.7  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0972  hypothetical protein  44.44 
 
 
61 aa  49.3  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3777  protein of unknown function DUF397  50 
 
 
66 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7003  protein of unknown function DUF397  48.21 
 
 
84 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8470  protein of unknown function DUF397  47.27 
 
 
92 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0441  protein of unknown function DUF397  43.64 
 
 
63 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1304  protein of unknown function DUF397  47.27 
 
 
68 aa  49.7  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0379944  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1444  protein of unknown function DUF397  47.27 
 
 
72 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.184265  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4454  protein of unknown function DUF397  45 
 
 
69 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1627  protein of unknown function DUF397  51.02 
 
 
59 aa  48.9  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6122  protein of unknown function DUF397  46.3 
 
 
61 aa  48.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.464343  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0413  protein of unknown function DUF397  43.86 
 
 
68 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0175926  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1802  hypothetical protein  42.86 
 
 
63 aa  48.1  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3780  protein of unknown function DUF397  45 
 
 
66 aa  47.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2513  hypothetical protein  45.45 
 
 
78 aa  47.8  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4075  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4609  protein of unknown function DUF397  44.26 
 
 
66 aa  47.4  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2127  protein of unknown function DUF397  39.74 
 
 
110 aa  47.4  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000239677  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0924  hypothetical protein  39.66 
 
 
63 aa  47.4  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.277312  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5086  hypothetical protein  47.06 
 
 
77 aa  46.6  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000003971 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4784  protein of unknown function DUF397  38.98 
 
 
61 aa  46.2  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0876  protein of unknown function DUF397  41.82 
 
 
80 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>