140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0262 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0262  hypothetical protein  100 
 
 		 62 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1657  hypothetical protein  58.18 
 
 		 68 aa  74.3  0.0000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1802  hypothetical protein  53.33 
 
 		 63 aa  67.8  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4682  protein of unknown function DUF397  52.83 
 
 		 63 aa  62.8  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1230  protein of unknown function DUF397  42.62 
 
 		 64 aa  62.4  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0779142  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7763  hypothetical protein  54.55 
 
 		 68 aa  60.8  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0037  hypothetical protein  52.63 
 
 		 69 aa  60.5  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5039  protein of unknown function DUF397  63.27 
 
 		 61 aa  60.5  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.643266 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2540  protein of unknown function DUF397  47.27 
 
 		 60 aa  60.5  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000021023  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1413  protein of unknown function DUF397  42.62 
 
 		 66 aa  60.1  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194771  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0487  protein of unknown function DUF397  44.07 
 
 		 63 aa  58.2  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3778  protein of unknown function DUF397  44.83 
 
 		 66 aa  58.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1653  protein of unknown function DUF397  50 
 
 		 59 aa  58.2  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0244936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2539  protein of unknown function DUF397  44.44 
 
 		 60 aa  57  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000183418  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0215  hypothetical protein  50.91 
 
 		 60 aa  57  0.00000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5452  protein of unknown function DUF397  48.21 
 
 		 59 aa  56.6  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.455168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2689  protein of unknown function DUF397  43.4 
 
 		 63 aa  56.6  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00137319  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1875  protein of unknown function DUF397  53.06 
 
 		 52 aa  55.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4504  hypothetical protein  48.15 
 
 		 62 aa  55.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.955874 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1876  protein of unknown function DUF397  50.94 
 
 		 56 aa  55.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1379  hypothetical protein  48.21 
 
 		 63 aa  55.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.383201  hitchhiker  0.00799748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3357  hypothetical protein  47.37 
 
 		 64 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0411145  normal  0.0781791 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8369  hypothetical protein  49.12 
 
 		 67 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2767  protein of unknown function DUF397  47.37 
 
 		 60 aa  55.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0824129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2703  hypothetical protein  49.15 
 
 		 67 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3780  protein of unknown function DUF397  42.11 
 
 		 66 aa  55.1  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1161  protein of unknown function DUF397  47.54 
 
 		 62 aa  54.7  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.653899  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4869  hypothetical protein  48 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.277477  normal  0.940812 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1543  protein of unknown function DUF397  52 
 
 		 55 aa  54.3  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1162  protein of unknown function DUF397  44.07 
 
 		 62 aa  54.3  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.490498  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4783  protein of unknown function DUF397  42.86 
 
 		 64 aa  53.9  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3777  protein of unknown function DUF397  44.64 
 
 		 66 aa  53.9  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0393  hypothetical protein  55.56 
 
 		 63 aa  53.5  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0973  hypothetical protein  44.83 
 
 		 64 aa  53.1  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1416  hypothetical protein  46.43 
 
 		 63 aa  53.5  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0509701 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2308  protein of unknown function DUF397  52.94 
 
 		 60 aa  53.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1652  protein of unknown function DUF397  50 
 
 		 59 aa  53.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0828203  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4137  protein of unknown function DUF397  47.27 
 
 		 58 aa  53.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3155  protein of unknown function DUF397  42.31 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.093301  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0228  hypothetical protein  42.37 
 
 		 80 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0037  hypothetical protein  42.86 
 
 		 73 aa  52.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.727174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0906  hypothetical protein  44.64 
 
 		 73 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0042  hypothetical protein  44.44 
 
 		 73 aa  52.4  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3929  protein of unknown function DUF397  48.15 
 
 		 57 aa  52.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2580  protein of unknown function DUF397  49.12 
 
 		 59 aa  52.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0232734 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7828  hypothetical protein  50 
 
 		 69 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5679  protein of unknown function DUF397  42.37 
 
 		 63 aa  52.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4784  protein of unknown function DUF397  40.35 
 
 		 61 aa  52.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2768  protein of unknown function DUF397  50 
 
 		 56 aa  52  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.141211  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4489  protein of unknown function DUF397  48.21 
 
 		 59 aa  52  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2541  protein of unknown function DUF397  42.31 
 
 		 63 aa  52  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000122631  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4159  protein of unknown function DUF397  42.37 
 
 		 67 aa  51.6  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2071  hypothetical protein  47.54 
 
 		 67 aa  51.6  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.392038  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0485  protein of unknown function DUF397  39.62 
 
 		 63 aa  51.6  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3776  protein of unknown function DUF397  40 
 
 		 66 aa  51.2  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0972  hypothetical protein  38.71 
 
 		 61 aa  51.2  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1432  hypothetical protein  49.02 
 
 		 62 aa  51.2  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353493  hitchhiker  0.000418088 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0927  hypothetical protein  48.15 
 
 		 63 aa  50.8  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2538  protein of unknown function DUF397  40.74 
 
 		 62 aa  50.8  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000230929  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2579  protein of unknown function DUF397  46.3 
 
 		 57 aa  50.8  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0222791 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1295  protein of unknown function DUF397  44.64 
 
 		 82 aa  50.4  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2128  hypothetical protein  45.28 
 
 		 62 aa  50.1  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0708  hypothetical protein  42.11 
 
 		 64 aa  49.7  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1781  hypothetical protein  45.61 
 
 		 69 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1269  hypothetical protein  51.02 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4378  hypothetical protein  46 
 
 		 62 aa  49.7  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4463  hypothetical protein  42.37 
 
 		 63 aa  49.7  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5445  protein of unknown function DUF397  51.85 
 
 		 81 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.644753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12020  protein of unknown function (DUF397)  42.86 
 
 		 65 aa  48.9  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24730  protein of unknown function (DUF397)  41.38 
 
 		 69 aa  48.9  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4781  protein of unknown function DUF397  41.82 
 
 		 64 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0091  hypothetical protein  49.02 
 
 		 63 aa  48.5  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.407205  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0103  hypothetical protein  43.64 
 
 		 63 aa  48.5  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6649  hypothetical protein  46.43 
 
 		 79 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.476212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1834  protein of unknown function DUF397  42.59 
 
 		 59 aa  48.9  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0486  protein of unknown function DUF397  36.84 
 
 		 63 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4088  protein of unknown function DUF397  37.04 
 
 		 57 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0235  hypothetical protein  45 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0099  hypothetical protein  48.08 
 
 		 63 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0419317  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1786  hypothetical protein  41.82 
 
 		 63 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3236  hypothetical protein  46 
 
 		 63 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1943  protein of unknown function DUF397  49.06 
 
 		 55 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0673  protein of unknown function DUF397  42 
 
 		 62 aa  48.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0631  hypothetical protein  44.44 
 
 		 72 aa  47.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.243928  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3930  protein of unknown function DUF397  44.64 
 
 		 57 aa  47.8  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1444  protein of unknown function DUF397  40.98 
 
 		 72 aa  47.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.184265  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6435  protein of unknown function DUF397  44.44 
 
 		 57 aa  47.4  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2127  protein of unknown function DUF397  40.74 
 
 		 110 aa  47.4  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000239677  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0513  hypothetical protein  50 
 
 		 62 aa  46.6  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.47229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3657  hypothetical protein  44.44 
 
 		 62 aa  46.6  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3649  protein of unknown function DUF397  44.9 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.375701  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36640  protein of unknown function (DUF397)  42.86 
 
 		 83 aa  46.6  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.0015395  normal  0.323981 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0718  protein of unknown function DUF397  42.86 
 
 		 73 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0643  hypothetical protein  48 
 
 		 61 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1897  hypothetical protein  45.28 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.422  normal  0.225792 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1090  protein of unknown function DUF397  50 
 
 		 57 aa  46.2  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.552456 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4124  hypothetical protein  40.68 
 
 		 75 aa  46.2  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3779  protein of unknown function DUF397  37.04 
 
 		 66 aa  45.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4087  protein of unknown function DUF397  34.48 
 
 		 60 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1019  hypothetical protein  36.23 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>