97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4504 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_4504  hypothetical protein  100 
 
 
62 aa  126  9.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.955874 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3657  hypothetical protein  65 
 
 
62 aa  83.6  9e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1379  hypothetical protein  64.91 
 
 
63 aa  82.4  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.383201  hitchhiker  0.00799748 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2128  hypothetical protein  71.7 
 
 
62 aa  81.6  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0927  hypothetical protein  64.91 
 
 
63 aa  80.9  0.000000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1432  hypothetical protein  63.33 
 
 
62 aa  79.7  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353493  hitchhiker  0.000418088 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0643  hypothetical protein  72.22 
 
 
61 aa  79.3  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1416  hypothetical protein  61.4 
 
 
63 aa  77.8  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0509701 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1786  hypothetical protein  64.91 
 
 
63 aa  78.2  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3236  hypothetical protein  70 
 
 
63 aa  77  0.00000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1897  hypothetical protein  68.63 
 
 
64 aa  76.6  0.00000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.422  normal  0.225792 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0103  hypothetical protein  64.91 
 
 
63 aa  75.5  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4463  hypothetical protein  59.65 
 
 
63 aa  75.1  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0099  hypothetical protein  63.16 
 
 
63 aa  75.1  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0419317  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2448  hypothetical protein  62.5 
 
 
62 aa  74.3  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.14038  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0513  hypothetical protein  68.52 
 
 
62 aa  73.9  0.0000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.47229  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7763  hypothetical protein  62.26 
 
 
68 aa  72  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3009  hypothetical protein  68 
 
 
113 aa  71.6  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4869  hypothetical protein  57.14 
 
 
60 aa  70.5  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.277477  normal  0.940812 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4378  hypothetical protein  56.67 
 
 
62 aa  69.3  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2601  hypothetical protein  66.04 
 
 
62 aa  69.3  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0203178  normal  0.0405865 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3357  hypothetical protein  64 
 
 
64 aa  66.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0411145  normal  0.0781791 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4255  hypothetical protein  64.29 
 
 
69 aa  62.4  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.912797  normal  0.127607 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1517  hypothetical protein  58.33 
 
 
68 aa  62  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0185029 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4685  hypothetical protein  64.29 
 
 
69 aa  62  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.144765  normal  0.226614 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2969  hypothetical protein  60.38 
 
 
68 aa  61.6  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000849623 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4235  hypothetical protein  59.26 
 
 
62 aa  60.5  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0042  hypothetical protein  58.49 
 
 
73 aa  58.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0037  hypothetical protein  58.49 
 
 
73 aa  58.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.727174  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4569  hypothetical protein  58.18 
 
 
77 aa  58.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.246526 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1269  hypothetical protein  60.71 
 
 
66 aa  58.2  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0262  hypothetical protein  48.15 
 
 
62 aa  55.8  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4124  hypothetical protein  58.49 
 
 
75 aa  55.5  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701856  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0228  hypothetical protein  50.85 
 
 
80 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4568  hypothetical protein  52.38 
 
 
77 aa  55.1  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.246526 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1159  hypothetical protein  57.69 
 
 
66 aa  55.1  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0339608  unclonable  0.0000000343885 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5086  hypothetical protein  50 
 
 
77 aa  54.3  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000003971 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0037  hypothetical protein  51.85 
 
 
69 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3743  hypothetical protein  56.6 
 
 
75 aa  52  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0599  hypothetical protein  54.72 
 
 
69 aa  52.8  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0235  hypothetical protein  54.72 
 
 
77 aa  52.4  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1834  protein of unknown function DUF397  49.06 
 
 
59 aa  52  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1445  protein of unknown function DUF397  41.67 
 
 
64 aa  52  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.12043  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2543  hypothetical protein  54.9 
 
 
67 aa  51.6  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258706  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1781  hypothetical protein  50 
 
 
69 aa  52  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8369  hypothetical protein  50.94 
 
 
67 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5039  protein of unknown function DUF397  44.83 
 
 
61 aa  50.8  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.643266 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1728  hypothetical protein  53.45 
 
 
78 aa  50.8  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0749322  hitchhiker  0.00877773 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6649  hypothetical protein  54 
 
 
79 aa  50.4  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.476212  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0718  protein of unknown function DUF397  50 
 
 
73 aa  50.4  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4695  protein of unknown function DUF397  54.17 
 
 
127 aa  49.7  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2703  hypothetical protein  50 
 
 
67 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1745  hypothetical protein  48.28 
 
 
64 aa  48.5  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.64493  normal  0.800474 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0441  protein of unknown function DUF397  44.64 
 
 
63 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1444  protein of unknown function DUF397  47.27 
 
 
72 aa  48.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.184265  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1802  hypothetical protein  38.33 
 
 
63 aa  47.4  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0906  hypothetical protein  50 
 
 
73 aa  47.4  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1627  protein of unknown function DUF397  43.86 
 
 
59 aa  46.2  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5679  protein of unknown function DUF397  43.4 
 
 
63 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0265  protein of unknown function DUF397  46.3 
 
 
68 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138869  normal  0.97902 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37900  protein of unknown function (DUF397)  47.17 
 
 
82 aa  45.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2071  hypothetical protein  41.67 
 
 
67 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.392038  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0993  hypothetical protein  46.3 
 
 
67 aa  45.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6482  hypothetical protein  44.62 
 
 
76 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.435568 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1329  hypothetical protein  51.02 
 
 
68 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7976  hypothetical protein  38.1 
 
 
80 aa  44.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0545278  normal  0.164909 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1230  protein of unknown function DUF397  42.31 
 
 
64 aa  44.7  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0779142  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0924  hypothetical protein  41.51 
 
 
63 aa  44.3  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.277312  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2540  protein of unknown function DUF397  58.54 
 
 
60 aa  44.3  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000021023  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0485  protein of unknown function DUF397  44 
 
 
63 aa  43.9  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0716  protein of unknown function DUF397  43.4 
 
 
65 aa  43.9  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0708  hypothetical protein  46.43 
 
 
64 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0397  hypothetical protein  48 
 
 
69 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1019  hypothetical protein  41.54 
 
 
81 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1657  hypothetical protein  40 
 
 
68 aa  43.5  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0973  hypothetical protein  47.17 
 
 
64 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4609  protein of unknown function DUF397  43.64 
 
 
66 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2541  protein of unknown function DUF397  54.76 
 
 
63 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000122631  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1132  hypothetical protein  50.94 
 
 
65 aa  43.5  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1301  hypothetical protein  60.78 
 
 
60 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0886559 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1230  hypothetical protein  41.51 
 
 
77 aa  42.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.375294 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1304  protein of unknown function DUF397  46.94 
 
 
68 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0379944  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6435  protein of unknown function DUF397  46.94 
 
 
57 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0425  hypothetical protein  53.19 
 
 
67 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1597  hypothetical protein  37.88 
 
 
70 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7553  hypothetical protein  38.46 
 
 
99 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1413  protein of unknown function DUF397  41.18 
 
 
66 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194771  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6122  protein of unknown function DUF397  41.51 
 
 
61 aa  41.2  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.464343  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2689  protein of unknown function DUF397  42 
 
 
63 aa  40.8  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00137319  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0413  protein of unknown function DUF397  37.25 
 
 
68 aa  40.8  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0175926  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0567  protein of unknown function DUF397  45.28 
 
 
95 aa  40.8  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36640  protein of unknown function (DUF397)  43.64 
 
 
83 aa  40.8  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.0015395  normal  0.323981 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0876  protein of unknown function DUF397  40.74 
 
 
80 aa  40.8  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4579  protein of unknown function DUF397  42.59 
 
 
70 aa  40.8  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3155  protein of unknown function DUF397  37.1 
 
 
65 aa  40.8  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.093301  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3941  protein of unknown function DUF397  43.4 
 
 
64 aa  40.4  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272319  normal  0.0398541 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0108  protein of unknown function DUF397  46.15 
 
 
61 aa  40.4  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>