112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1444 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1444  protein of unknown function DUF397  100 
 
 
72 aa  148  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.184265  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1445  protein of unknown function DUF397  59.02 
 
 
64 aa  75.5  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.12043  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0235  hypothetical protein  58.49 
 
 
77 aa  65.1  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3357  hypothetical protein  57.14 
 
 
64 aa  63.9  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0411145  normal  0.0781791 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2969  hypothetical protein  53.7 
 
 
68 aa  61.2  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000849623 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1517  hypothetical protein  51.85 
 
 
68 aa  60.1  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0185029 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8369  hypothetical protein  53.57 
 
 
67 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1943  protein of unknown function DUF397  54.55 
 
 
63 aa  58.9  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00825556  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7763  hypothetical protein  55.36 
 
 
68 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0397  hypothetical protein  53.85 
 
 
69 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1781  hypothetical protein  54.84 
 
 
69 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2601  hypothetical protein  54.72 
 
 
62 aa  56.6  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0203178  normal  0.0405865 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1159  hypothetical protein  55.77 
 
 
66 aa  54.7  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0339608  unclonable  0.0000000343885 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3236  hypothetical protein  56.86 
 
 
63 aa  54.3  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0417  protein of unknown function DUF397  41.94 
 
 
63 aa  54.3  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0993  hypothetical protein  48.33 
 
 
67 aa  52.8  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4235  hypothetical protein  44.64 
 
 
62 aa  53.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0103  hypothetical protein  50.98 
 
 
63 aa  52.4  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1897  hypothetical protein  52.94 
 
 
64 aa  52.4  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.422  normal  0.225792 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2448  hypothetical protein  50.94 
 
 
62 aa  52.4  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.14038  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1329  hypothetical protein  53.85 
 
 
68 aa  51.6  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2703  hypothetical protein  45.9 
 
 
67 aa  51.2  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0599  hypothetical protein  42.37 
 
 
69 aa  51.6  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6435  protein of unknown function DUF397  50.91 
 
 
57 aa  51.6  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0513  hypothetical protein  49.09 
 
 
62 aa  50.8  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.47229  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1269  hypothetical protein  54.9 
 
 
66 aa  50.8  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0099  hypothetical protein  52.94 
 
 
63 aa  50.8  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0419317  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4159  protein of unknown function DUF397  50 
 
 
67 aa  50.8  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0643  hypothetical protein  48.15 
 
 
61 aa  50.4  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4752  hypothetical protein  55.56 
 
 
57 aa  50.4  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.049754  normal  0.080788 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0718  protein of unknown function DUF397  45.61 
 
 
73 aa  50.1  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1416  hypothetical protein  50.98 
 
 
63 aa  49.7  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0509701 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4463  hypothetical protein  47.17 
 
 
63 aa  50.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0037  hypothetical protein  48.28 
 
 
69 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4271  protein of unknown function DUF397  40.74 
 
 
73 aa  49.7  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0631  hypothetical protein  51.79 
 
 
72 aa  50.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.243928  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3657  hypothetical protein  49.02 
 
 
62 aa  49.3  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1379  hypothetical protein  50.98 
 
 
63 aa  49.7  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.383201  hitchhiker  0.00799748 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1432  hypothetical protein  47.27 
 
 
62 aa  49.3  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353493  hitchhiker  0.000418088 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4685  hypothetical protein  48.28 
 
 
69 aa  48.9  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.144765  normal  0.226614 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6122  protein of unknown function DUF397  50.94 
 
 
61 aa  48.9  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.464343  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0486  protein of unknown function DUF397  50.91 
 
 
63 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0716  protein of unknown function DUF397  46.43 
 
 
65 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1230  protein of unknown function DUF397  48.28 
 
 
64 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0779142  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4272  protein of unknown function DUF397  46.67 
 
 
75 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1597  hypothetical protein  41.07 
 
 
70 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2543  hypothetical protein  42.65 
 
 
67 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258706  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4255  hypothetical protein  48.28 
 
 
69 aa  48.5  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.912797  normal  0.127607 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0927  hypothetical protein  49.02 
 
 
63 aa  48.9  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0485  protein of unknown function DUF397  50.91 
 
 
63 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4504  hypothetical protein  47.27 
 
 
62 aa  48.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.955874 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0262  hypothetical protein  40.98 
 
 
62 aa  47.8  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0228  hypothetical protein  46.03 
 
 
80 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1786  hypothetical protein  47.17 
 
 
63 aa  47.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2128  hypothetical protein  48.08 
 
 
62 aa  47.8  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0265  protein of unknown function DUF397  39.29 
 
 
68 aa  47.4  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138869  normal  0.97902 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1132  hypothetical protein  40.68 
 
 
65 aa  47  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4153  protein of unknown function DUF397  45.45 
 
 
78 aa  47  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0972  hypothetical protein  42.11 
 
 
61 aa  46.6  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0973  hypothetical protein  41.54 
 
 
64 aa  46.6  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4378  hypothetical protein  49.02 
 
 
62 aa  46.6  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4609  protein of unknown function DUF397  46.77 
 
 
66 aa  46.2  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1596  hypothetical protein  47.83 
 
 
66 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0708  hypothetical protein  46.03 
 
 
64 aa  46.2  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1802  hypothetical protein  36.84 
 
 
63 aa  45.4  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3009  hypothetical protein  48 
 
 
113 aa  46.2  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5761  hypothetical protein  39.34 
 
 
71 aa  46.2  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.736194  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1230  hypothetical protein  39.29 
 
 
77 aa  46.2  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.375294 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0266  protein of unknown function DUF397  41.07 
 
 
69 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.687438  normal  0.998664 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0487  protein of unknown function DUF397  43.33 
 
 
63 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1745  hypothetical protein  44.64 
 
 
64 aa  45.1  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.64493  normal  0.800474 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1627  protein of unknown function DUF397  48.39 
 
 
59 aa  45.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37900  protein of unknown function (DUF397)  47.17 
 
 
82 aa  45.4  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7976  hypothetical protein  46.27 
 
 
80 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0545278  normal  0.164909 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4247  helix-turn-helix domain-containing protein  45.45 
 
 
410 aa  44.7  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.710263  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24730  protein of unknown function (DUF397)  47.37 
 
 
69 aa  45.1  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2127  protein of unknown function DUF397  40.54 
 
 
110 aa  45.1  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000239677  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5039  protein of unknown function DUF397  46.55 
 
 
61 aa  44.3  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.643266 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1304  protein of unknown function DUF397  48.15 
 
 
68 aa  44.7  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0379944  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3503  protein of unknown function DUF397  50.85 
 
 
65 aa  44.7  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0535915  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5628  hypothetical protein  40 
 
 
78 aa  44.3  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.524184 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0441  protein of unknown function DUF397  48.48 
 
 
63 aa  44.3  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1942  protein of unknown function DUF397  40.68 
 
 
64 aa  44.3  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00943958  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1728  hypothetical protein  44.64 
 
 
78 aa  43.9  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0749322  hitchhiker  0.00877773 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1657  hypothetical protein  43.86 
 
 
68 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1767  hypothetical protein  40.35 
 
 
127 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2090  hypothetical protein  43.86 
 
 
79 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.161003  normal  0.0235666 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4489  protein of unknown function DUF397  39.34 
 
 
59 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1834  protein of unknown function DUF397  44.64 
 
 
59 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0876  protein of unknown function DUF397  38.46 
 
 
80 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1229  protein of unknown function DUF397  48.28 
 
 
62 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0775452  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6482  hypothetical protein  42.65 
 
 
76 aa  42.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.435568 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2305  putative regulator  41.51 
 
 
77 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2266  hypothetical protein  48.21 
 
 
159 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0142951  hitchhiker  0.00561226 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1295  hypothetical protein  46.81 
 
 
78 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.471559  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2231  hypothetical protein  42.11 
 
 
79 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0143015  normal  0.145093 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36640  protein of unknown function (DUF397)  39.66 
 
 
83 aa  42.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.0015395  normal  0.323981 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0673  protein of unknown function DUF397  50.91 
 
 
62 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1969  protein of unknown function DUF397  37.1 
 
 
76 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00185784  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2689  protein of unknown function DUF397  48.08 
 
 
63 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00137319  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>