143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1897 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1897  hypothetical protein  100 
 
 		 64 aa  133  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.422  normal  0.225792 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1786  hypothetical protein  83.87 
 
 		 63 aa  110  6e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0927  hypothetical protein  85.48 
 
 		 63 aa  110  7.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1379  hypothetical protein  83.61 
 
 		 63 aa  107  6e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.383201  hitchhiker  0.00799748 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3236  hypothetical protein  77.05 
 
 		 63 aa  103  9e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1416  hypothetical protein  80.33 
 
 		 63 aa  102  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0509701 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2128  hypothetical protein  82.26 
 
 		 62 aa  102  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0099  hypothetical protein  81.36 
 
 		 63 aa  102  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0419317  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0103  hypothetical protein  79.66 
 
 		 63 aa  99.4  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4463  hypothetical protein  75.41 
 
 		 63 aa  99  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3657  hypothetical protein  77.19 
 
 		 62 aa  97.1  8e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3009  hypothetical protein  74.19 
 
 		 113 aa  95.1  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1432  hypothetical protein  75 
 
 		 62 aa  91.3  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353493  hitchhiker  0.000418088 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0643  hypothetical protein  74.58 
 
 		 61 aa  90.9  6e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2601  hypothetical protein  73.44 
 
 		 62 aa  90.1  9e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0203178  normal  0.0405865 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7763  hypothetical protein  72.73 
 
 		 68 aa  86.3  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0513  hypothetical protein  78.57 
 
 		 62 aa  86.7  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.47229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2448  hypothetical protein  68.75 
 
 		 62 aa  84.3  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.14038  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3357  hypothetical protein  60.34 
 
 		 64 aa  78.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0411145  normal  0.0781791 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4504  hypothetical protein  68.63 
 
 		 62 aa  76.6  0.00000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.955874 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4235  hypothetical protein  62.07 
 
 		 62 aa  74.7  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4869  hypothetical protein  57.38 
 
 		 60 aa  72.8  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.277477  normal  0.940812 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1517  hypothetical protein  60 
 
 		 68 aa  69.7  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0185029 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4378  hypothetical protein  58.18 
 
 		 62 aa  68.9  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2969  hypothetical protein  61.82 
 
 		 68 aa  68.9  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000849623 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0235  hypothetical protein  59.02 
 
 		 77 aa  68.2  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1159  hypothetical protein  55.74 
 
 		 66 aa  64.3  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0339608  unclonable  0.0000000343885 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1781  hypothetical protein  62.75 
 
 		 69 aa  63.9  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2703  hypothetical protein  57.14 
 
 		 67 aa  62.8  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0037  hypothetical protein  56.14 
 
 		 73 aa  61.2  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.727174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0042  hypothetical protein  56.14 
 
 		 73 aa  61.2  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1329  hypothetical protein  65.45 
 
 		 68 aa  61.2  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7976  hypothetical protein  50.77 
 
 		 80 aa  60.5  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0545278  normal  0.164909 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4685  hypothetical protein  55 
 
 		 69 aa  60.5  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.144765  normal  0.226614 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4255  hypothetical protein  55 
 
 		 69 aa  60.5  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.912797  normal  0.127607 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0228  hypothetical protein  61.54 
 
 		 80 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0993  hypothetical protein  52.46 
 
 		 67 aa  58.9  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1269  hypothetical protein  52.46 
 
 		 66 aa  58.9  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6649  hypothetical protein  53.45 
 
 		 79 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.476212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2543  hypothetical protein  59.26 
 
 		 67 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0718  protein of unknown function DUF397  48.33 
 
 		 73 aa  57.4  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0397  hypothetical protein  60.71 
 
 		 69 aa  57  0.00000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4124  hypothetical protein  50 
 
 		 75 aa  56.6  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6482  hypothetical protein  48 
 
 		 76 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.435568 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4695  protein of unknown function DUF397  49.15 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1834  protein of unknown function DUF397  49.12 
 
 		 59 aa  55.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2071  hypothetical protein  51.72 
 
 		 67 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.392038  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1304  protein of unknown function DUF397  49.15 
 
 		 68 aa  53.9  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0379944  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3743  hypothetical protein  50 
 
 		 75 aa  53.5  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1728  hypothetical protein  51.67 
 
 		 78 aa  53.5  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0749322  hitchhiker  0.00877773 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0441  protein of unknown function DUF397  56.52 
 
 		 63 aa  53.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0485  protein of unknown function DUF397  43.86 
 
 		 63 aa  53.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2689  protein of unknown function DUF397  46.67 
 
 		 63 aa  53.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00137319  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1445  protein of unknown function DUF397  48.08 
 
 		 64 aa  53.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.12043  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0037  hypothetical protein  54.9 
 
 		 69 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0599  hypothetical protein  50 
 
 		 69 aa  52.8  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37900  protein of unknown function (DUF397)  50.91 
 
 		 82 aa  52.4  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1444  protein of unknown function DUF397  52.94 
 
 		 72 aa  52.4  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.184265  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0266  protein of unknown function DUF397  51.79 
 
 		 69 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.687438  normal  0.998664 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4454  protein of unknown function DUF397  47.46 
 
 		 69 aa  52  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1230  hypothetical protein  49.09 
 
 		 77 aa  51.6  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.375294 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1745  hypothetical protein  48.28 
 
 		 64 aa  51.6  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.64493  normal  0.800474 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0716  protein of unknown function DUF397  46.55 
 
 		 65 aa  51.6  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1597  hypothetical protein  44.07 
 
 		 70 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5086  hypothetical protein  50 
 
 		 77 aa  50.4  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000003971 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7003  protein of unknown function DUF397  48.15 
 
 		 84 aa  50.4  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0265  protein of unknown function DUF397  54 
 
 		 68 aa  50.4  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138869  normal  0.97902 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4159  protein of unknown function DUF397  48.21 
 
 		 67 aa  49.7  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3649  protein of unknown function DUF397  49.09 
 
 		 75 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.375701  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6122  protein of unknown function DUF397  45.61 
 
 		 61 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.464343  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36640  protein of unknown function (DUF397)  50 
 
 		 83 aa  50.1  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.0015395  normal  0.323981 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0486  protein of unknown function DUF397  38.98 
 
 		 63 aa  49.7  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0487  protein of unknown function DUF397  41.82 
 
 		 63 aa  49.7  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3778  protein of unknown function DUF397  46.77 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1132  hypothetical protein  54.24 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4569  hypothetical protein  46.67 
 
 		 77 aa  49.3  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.246526 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3780  protein of unknown function DUF397  45.16 
 
 		 66 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6435  protein of unknown function DUF397  58.7 
 
 		 57 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8369  hypothetical protein  50 
 
 		 67 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2513  hypothetical protein  47.27 
 
 		 78 aa  48.9  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4075  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4153  protein of unknown function DUF397  50 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7828  hypothetical protein  50.85 
 
 		 69 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0631  hypothetical protein  48.98 
 
 		 72 aa  47.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.243928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1627  protein of unknown function DUF397  51.02 
 
 		 59 aa  47.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0876  protein of unknown function DUF397  43.64 
 
 		 80 aa  47.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3779  protein of unknown function DUF397  39.06 
 
 		 66 aa  47.4  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4579  protein of unknown function DUF397  44.64 
 
 		 70 aa  47.4  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2539  protein of unknown function DUF397  48.21 
 
 		 60 aa  47.4  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000183418  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1657  hypothetical protein  42.37 
 
 		 68 aa  47  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4568  hypothetical protein  48.28 
 
 		 77 aa  47  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.246526 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1230  protein of unknown function DUF397  43.4 
 
 		 64 aa  47  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0779142  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1019  hypothetical protein  42.86 
 
 		 81 aa  47  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7553  hypothetical protein  36.96 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3856  hypothetical protein  42.86 
 
 		 72 aa  47  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8470  protein of unknown function DUF397  50.88 
 
 		 92 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2127  protein of unknown function DUF397  38.16 
 
 		 110 aa  47  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000239677  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3476  hypothetical protein  42.86 
 
 		 72 aa  46.2  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3776  protein of unknown function DUF397  40 
 
 		 66 aa  46.2  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1229  protein of unknown function DUF397  52.83 
 
 		 62 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0775452  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1943  protein of unknown function DUF397  46.3 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00825556  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>