140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1445 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1445  protein of unknown function DUF397  100 
 
 
64 aa  135  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.12043  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1444  protein of unknown function DUF397  59.02 
 
 
72 aa  75.5  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.184265  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1943  protein of unknown function DUF397  51.61 
 
 
63 aa  75.1  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00825556  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0417  protein of unknown function DUF397  54.1 
 
 
63 aa  70.5  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0599  hypothetical protein  49.12 
 
 
69 aa  68.2  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2703  hypothetical protein  50.88 
 
 
67 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8369  hypothetical protein  49.06 
 
 
67 aa  61.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1802  hypothetical protein  43.4 
 
 
63 aa  59.7  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0235  hypothetical protein  49.06 
 
 
77 aa  59.7  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4235  hypothetical protein  40 
 
 
62 aa  59.7  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2969  hypothetical protein  43.33 
 
 
68 aa  59.3  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000849623 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3357  hypothetical protein  44.44 
 
 
64 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0411145  normal  0.0781791 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0643  hypothetical protein  50 
 
 
61 aa  58.2  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7763  hypothetical protein  44.26 
 
 
68 aa  57.8  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6122  protein of unknown function DUF397  50 
 
 
61 aa  57.4  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.464343  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1942  protein of unknown function DUF397  42.62 
 
 
64 aa  57  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00943958  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37900  protein of unknown function (DUF397)  52.08 
 
 
82 aa  56.6  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0103  hypothetical protein  48.08 
 
 
63 aa  56.2  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1517  hypothetical protein  47.92 
 
 
68 aa  56.2  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0185029 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2543  hypothetical protein  45.61 
 
 
67 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258706  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0228  hypothetical protein  51.85 
 
 
80 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1132  hypothetical protein  42.11 
 
 
65 aa  55.5  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4272  protein of unknown function DUF397  43.33 
 
 
75 aa  54.7  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0037  hypothetical protein  55.1 
 
 
69 aa  55.1  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2128  hypothetical protein  43.86 
 
 
62 aa  54.7  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2601  hypothetical protein  46.15 
 
 
62 aa  54.7  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0203178  normal  0.0405865 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5679  protein of unknown function DUF397  42.62 
 
 
63 aa  54.7  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24730  protein of unknown function (DUF397)  43.86 
 
 
69 aa  54.7  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1781  hypothetical protein  51.85 
 
 
69 aa  54.7  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0927  hypothetical protein  46.15 
 
 
63 aa  54.3  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1379  hypothetical protein  48.08 
 
 
63 aa  53.9  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.383201  hitchhiker  0.00799748 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3657  hypothetical protein  48.98 
 
 
62 aa  53.9  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4463  hypothetical protein  42.37 
 
 
63 aa  53.5  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1897  hypothetical protein  48.08 
 
 
64 aa  53.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.422  normal  0.225792 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0716  protein of unknown function DUF397  50 
 
 
65 aa  53.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0973  hypothetical protein  50.94 
 
 
64 aa  52.4  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1416  hypothetical protein  46.15 
 
 
63 aa  52.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0509701 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6649  hypothetical protein  52 
 
 
79 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.476212  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1432  hypothetical protein  43.33 
 
 
62 aa  52.8  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353493  hitchhiker  0.000418088 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0513  hypothetical protein  42.62 
 
 
62 aa  52  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.47229  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4504  hypothetical protein  41.67 
 
 
62 aa  52  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.955874 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1786  hypothetical protein  40.68 
 
 
63 aa  52  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7003  protein of unknown function DUF397  45.61 
 
 
84 aa  52  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7553  hypothetical protein  40 
 
 
99 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0708  hypothetical protein  49.06 
 
 
64 aa  51.2  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2448  hypothetical protein  44.23 
 
 
62 aa  51.6  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.14038  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4695  protein of unknown function DUF397  49.06 
 
 
127 aa  51.6  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0265  protein of unknown function DUF397  43.4 
 
 
68 aa  51.6  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138869  normal  0.97902 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1413  protein of unknown function DUF397  46.3 
 
 
66 aa  51.6  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194771  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3009  hypothetical protein  43.64 
 
 
113 aa  50.8  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0099  hypothetical protein  44.68 
 
 
63 aa  50.8  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0419317  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0718  protein of unknown function DUF397  43.4 
 
 
73 aa  50.8  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0397  hypothetical protein  48.98 
 
 
69 aa  50.4  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1304  protein of unknown function DUF397  45.83 
 
 
68 aa  50.4  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0379944  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1329  hypothetical protein  50 
 
 
68 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6435  protein of unknown function DUF397  46.3 
 
 
57 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3236  hypothetical protein  44.23 
 
 
63 aa  48.9  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4569  hypothetical protein  44.64 
 
 
77 aa  48.5  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.246526 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2513  hypothetical protein  39.62 
 
 
78 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4075  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8470  protein of unknown function DUF397  37.74 
 
 
92 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1597  hypothetical protein  33.96 
 
 
70 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2305  putative regulator  39.62 
 
 
77 aa  47.8  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2071  hypothetical protein  40.98 
 
 
67 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.392038  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1745  hypothetical protein  50 
 
 
64 aa  47.8  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.64493  normal  0.800474 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4579  protein of unknown function DUF397  43.86 
 
 
70 aa  47.4  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3941  protein of unknown function DUF397  31.58 
 
 
64 aa  47.8  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272319  normal  0.0398541 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0972  hypothetical protein  39.29 
 
 
61 aa  47.4  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1159  hypothetical protein  46.81 
 
 
66 aa  47.4  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0339608  unclonable  0.0000000343885 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5037  protein of unknown function DUF397  40.28 
 
 
73 aa  47.4  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0262  hypothetical protein  37.93 
 
 
62 aa  45.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4568  hypothetical protein  40.38 
 
 
77 aa  46.2  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.246526 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1230  hypothetical protein  33.96 
 
 
77 aa  45.4  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.375294 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5396  protein of unknown function DUF397  48.08 
 
 
66 aa  45.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.051071  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1230  protein of unknown function DUF397  44.44 
 
 
64 aa  46.2  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0779142  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7828  hypothetical protein  39.62 
 
 
69 aa  45.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2579  protein of unknown function DUF397  40.74 
 
 
57 aa  45.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0222791 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1728  hypothetical protein  41.18 
 
 
78 aa  45.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0749322  hitchhiker  0.00877773 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4124  hypothetical protein  50 
 
 
75 aa  45.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701856  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4153  protein of unknown function DUF397  39.62 
 
 
78 aa  45.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3649  protein of unknown function DUF397  44.44 
 
 
75 aa  45.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.375701  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7976  hypothetical protein  39.71 
 
 
80 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0545278  normal  0.164909 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4271  protein of unknown function DUF397  37.93 
 
 
73 aa  45.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6482  hypothetical protein  35.38 
 
 
76 aa  45.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.435568 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0441  protein of unknown function DUF397  42.86 
 
 
63 aa  45.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1969  protein of unknown function DUF397  43.75 
 
 
76 aa  45.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00185784  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0037  hypothetical protein  36.21 
 
 
73 aa  44.7  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.727174  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5628  hypothetical protein  37.74 
 
 
78 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.524184 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0042  hypothetical protein  33.87 
 
 
73 aa  44.7  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4489  protein of unknown function DUF397  38.33 
 
 
59 aa  45.1  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1834  protein of unknown function DUF397  43.86 
 
 
59 aa  44.7  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2266  hypothetical protein  47.27 
 
 
159 aa  44.3  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0142951  hitchhiker  0.00561226 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2689  protein of unknown function DUF397  50.94 
 
 
63 aa  44.7  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00137319  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0906  hypothetical protein  36.84 
 
 
73 aa  44.7  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5086  hypothetical protein  36.54 
 
 
77 aa  44.7  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000003971 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1269  hypothetical protein  42.55 
 
 
66 aa  44.3  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4255  hypothetical protein  39.29 
 
 
69 aa  44.3  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.912797  normal  0.127607 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1471  hypothetical protein  44.78 
 
 
76 aa  44.3  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.394456  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2540  protein of unknown function DUF397  49.06 
 
 
60 aa  44.3  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000021023  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1480  protein of unknown function DUF397  49.02 
 
 
59 aa  43.9  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1504  protein of unknown function DUF397  33.96 
 
 
103 aa  43.9  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>