94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3856 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3856  hypothetical protein  100 
 
 		 72 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3476  hypothetical protein  97.22 
 
 		 72 aa  143  8.000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6018  protein of unknown function DUF397  55.41 
 
 		 89 aa  72  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.260789  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0787  hypothetical protein  48.61 
 
 		 106 aa  71.6  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.679584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1329  hypothetical protein  57.38 
 
 		 68 aa  68.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2703  hypothetical protein  50 
 
 		 67 aa  64.7  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0905  hypothetical protein  52.31 
 
 		 76 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0955654 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6649  hypothetical protein  54.39 
 
 		 79 aa  61.2  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.476212  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0235  hypothetical protein  48.44 
 
 		 77 aa  60.1  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0266  protein of unknown function DUF397  50.77 
 
 		 69 aa  60.1  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.687438  normal  0.998664 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6482  hypothetical protein  44 
 
 		 76 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.435568 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0228  hypothetical protein  47.46 
 
 		 80 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0397  hypothetical protein  50.79 
 
 		 69 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1767  hypothetical protein  50.77 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0567  protein of unknown function DUF397  54.39 
 
 		 95 aa  57.4  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1019  hypothetical protein  42.86 
 
 		 81 aa  57  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1295  hypothetical protein  43.55 
 
 		 78 aa  57  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.471559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3784  hypothetical protein  70.59 
 
 		 85 aa  56.6  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08900  protein of unknown function (DUF397)  42.67 
 
 		 92 aa  56.6  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2071  hypothetical protein  42.19 
 
 		 67 aa  56.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.392038  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37900  protein of unknown function (DUF397)  48.39 
 
 		 82 aa  55.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0521  protein of unknown function DUF397  46.77 
 
 		 77 aa  55.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3445  hypothetical protein  41.94 
 
 		 78 aa  55.5  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7763  hypothetical protein  41.54 
 
 		 68 aa  55.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4124  hypothetical protein  36.07 
 
 		 75 aa  55.1  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701856  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1505  protein of unknown function DUF397  49.23 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.272297  hitchhiker  0.00205006 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1781  hypothetical protein  64.44 
 
 		 69 aa  54.3  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3743  hypothetical protein  37.7 
 
 		 75 aa  54.3  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7828  hypothetical protein  41.94 
 
 		 69 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4153  protein of unknown function DUF397  45.76 
 
 		 78 aa  52.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0037  hypothetical protein  50 
 
 		 69 aa  52  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0599  hypothetical protein  45.07 
 
 		 69 aa  52  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1230  hypothetical protein  39.68 
 
 		 77 aa  51.2  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.375294 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2305  putative regulator  45.61 
 
 		 77 aa  51.2  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2513  hypothetical protein  42.86 
 
 		 78 aa  50.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4695  protein of unknown function DUF397  35.71 
 
 		 127 aa  49.7  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8470  protein of unknown function DUF397  39.39 
 
 		 92 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0037  hypothetical protein  38.1 
 
 		 73 aa  50.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.727174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36640  protein of unknown function (DUF397)  48.89 
 
 		 83 aa  49.7  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.0015395  normal  0.323981 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1504  protein of unknown function DUF397  42.37 
 
 		 103 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0042  hypothetical protein  38.1 
 
 		 73 aa  50.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24730  protein of unknown function (DUF397)  51.11 
 
 		 69 aa  49.3  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12020  protein of unknown function (DUF397)  37.5 
 
 		 65 aa  48.9  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1969  protein of unknown function DUF397  45 
 
 		 76 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00185784  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5628  hypothetical protein  41.38 
 
 		 78 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.524184 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1159  hypothetical protein  40 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0339608  unclonable  0.0000000343885 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0716  protein of unknown function DUF397  34.38 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2231  hypothetical protein  46.55 
 
 		 79 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0143015  normal  0.145093 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2090  hypothetical protein  46.55 
 
 		 79 aa  48.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.161003  normal  0.0235666 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2128  protein of unknown function DUF397  45.65 
 
 		 64 aa  47.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.996693  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14270  protein of unknown function (DUF397)  54.17 
 
 		 66 aa  47.8  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.784152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8369  hypothetical protein  38.71 
 
 		 67 aa  47.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5736  hypothetical protein  46.55 
 
 		 80 aa  47.4  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.534328 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3009  hypothetical protein  42.86 
 
 		 113 aa  47.4  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2266  hypothetical protein  64.71 
 
 		 159 aa  47  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0142951  hitchhiker  0.00561226 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0718  protein of unknown function DUF397  39.68 
 
 		 73 aa  47  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12060  protein of unknown function (DUF397)  37.93 
 
 		 65 aa  47  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1897  hypothetical protein  42.86 
 
 		 64 aa  47  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.422  normal  0.225792 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7976  hypothetical protein  36.84 
 
 		 80 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0545278  normal  0.164909 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3763  protein of unknown function DUF397  43.24 
 
 		 83 aa  46.2  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0876  protein of unknown function DUF397  34.92 
 
 		 80 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1984  protein of unknown function DUF397  43.4 
 
 		 69 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00383957  normal  0.845583 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0425  hypothetical protein  39.06 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0265  protein of unknown function DUF397  43.1 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138869  normal  0.97902 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1786  hypothetical protein  43.86 
 
 		 63 aa  45.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1597  hypothetical protein  36.84 
 
 		 70 aa  45.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20560  protein of unknown function (DUF397)  36.84 
 
 		 66 aa  44.3  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3941  protein of unknown function DUF397  37.29 
 
 		 64 aa  44.7  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272319  normal  0.0398541 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0103  hypothetical protein  40.35 
 
 		 63 aa  43.9  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3657  hypothetical protein  37.7 
 
 		 62 aa  43.5  0.0009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3236  hypothetical protein  41.07 
 
 		 63 aa  43.5  0.0009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20610  protein of unknown function (DUF397)  34.69 
 
 		 64 aa  43.5  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.069741  normal  0.682793 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4463  hypothetical protein  38.6 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1269  hypothetical protein  39.34 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7553  hypothetical protein  32.1 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1379  hypothetical protein  42.11 
 
 		 63 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.383201  hitchhiker  0.00799748 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4579  protein of unknown function DUF397  32.14 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1596  hypothetical protein  41.67 
 
 		 66 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2448  hypothetical protein  38.89 
 
 		 62 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.14038  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0993  hypothetical protein  32.2 
 
 		 67 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3649  protein of unknown function DUF397  51.35 
 
 		 75 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.375701  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0927  hypothetical protein  40.35 
 
 		 63 aa  42  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1416  hypothetical protein  42.11 
 
 		 63 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0509701 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0099  hypothetical protein  36.84 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0419317  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1517  hypothetical protein  31.75 
 
 		 68 aa  41.6  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0185029 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2128  hypothetical protein  37.29 
 
 		 62 aa  41.6  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1304  protein of unknown function DUF397  36.07 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0379944  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6122  protein of unknown function DUF397  34.69 
 
 		 61 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.464343  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2601  hypothetical protein  45.61 
 
 		 62 aa  41.2  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0203178  normal  0.0405865 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6312  protein of unknown function DUF397  40 
 
 		 74 aa  40.8  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61619  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4235  hypothetical protein  35.48 
 
 		 62 aa  40.8  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1432  hypothetical protein  36.67 
 
 		 62 aa  40.4  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353493  hitchhiker  0.000418088 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1588  hypothetical protein  42.86 
 
 		 71 aa  40  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1548  hypothetical protein  42.86 
 
 		 71 aa  40  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0220305  normal  0.0244583 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>