76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1505 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1505  protein of unknown function DUF397  100 
 
 
139 aa  280  3.0000000000000004e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.272297  hitchhiker  0.00205006 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1767  hypothetical protein  76.85 
 
 
127 aa  173  6e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1781  hypothetical protein  57.89 
 
 
69 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0037  hypothetical protein  53.45 
 
 
69 aa  62  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8369  hypothetical protein  49.21 
 
 
67 aa  60.5  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0397  hypothetical protein  52.31 
 
 
69 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7763  hypothetical protein  46.97 
 
 
68 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6018  protein of unknown function DUF397  45.71 
 
 
89 aa  58.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.260789  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0228  hypothetical protein  48.44 
 
 
80 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0235  hypothetical protein  47.69 
 
 
77 aa  57  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2703  hypothetical protein  50 
 
 
67 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0787  hypothetical protein  43.08 
 
 
106 aa  55.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.679584  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3856  hypothetical protein  49.23 
 
 
72 aa  55.1  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4153  protein of unknown function DUF397  48.33 
 
 
78 aa  55.1  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3476  hypothetical protein  49.23 
 
 
72 aa  54.7  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1329  hypothetical protein  50 
 
 
68 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37900  protein of unknown function (DUF397)  46.77 
 
 
82 aa  53.5  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6649  hypothetical protein  50 
 
 
79 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.476212  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7828  hypothetical protein  47.76 
 
 
69 aa  52  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7976  hypothetical protein  37.66 
 
 
80 aa  51.6  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0545278  normal  0.164909 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3763  protein of unknown function DUF397  37.93 
 
 
83 aa  50.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1504  protein of unknown function DUF397  43.33 
 
 
103 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24730  protein of unknown function (DUF397)  43.08 
 
 
69 aa  48.5  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1548  hypothetical protein  44.26 
 
 
71 aa  48.5  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0220305  normal  0.0244583 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1588  hypothetical protein  44.26 
 
 
71 aa  48.5  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0521  protein of unknown function DUF397  38.71 
 
 
77 aa  48.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1230  hypothetical protein  37.5 
 
 
77 aa  48.1  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.375294 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12060  protein of unknown function (DUF397)  40.98 
 
 
65 aa  47.4  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2513  hypothetical protein  40.62 
 
 
78 aa  47.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4075  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2305  putative regulator  39.34 
 
 
77 aa  47  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20610  protein of unknown function (DUF397)  38.98 
 
 
64 aa  45.4  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.069741  normal  0.682793 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14270  protein of unknown function (DUF397)  42.62 
 
 
66 aa  46.2  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.784152  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2071  hypothetical protein  41.94 
 
 
67 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.392038  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6312  protein of unknown function DUF397  41.27 
 
 
74 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61619  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08900  protein of unknown function (DUF397)  39.73 
 
 
92 aa  46.2  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3941  protein of unknown function DUF397  39.29 
 
 
64 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272319  normal  0.0398541 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3236  hypothetical protein  45.45 
 
 
63 aa  45.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0037  hypothetical protein  40.62 
 
 
73 aa  45.1  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.727174  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1969  protein of unknown function DUF397  44.07 
 
 
76 aa  45.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00185784  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2090  hypothetical protein  45.76 
 
 
79 aa  44.7  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.161003  normal  0.0235666 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0042  hypothetical protein  40.62 
 
 
73 aa  45.1  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1295  hypothetical protein  39.66 
 
 
78 aa  44.7  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.471559  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3445  hypothetical protein  39.66 
 
 
78 aa  43.5  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3784  hypothetical protein  52.38 
 
 
85 aa  43.5  0.0009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1132  hypothetical protein  42.86 
 
 
65 aa  43.5  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36640  protein of unknown function (DUF397)  36.49 
 
 
83 aa  43.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.0015395  normal  0.323981 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1897  hypothetical protein  43.64 
 
 
64 aa  43.5  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.422  normal  0.225792 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12020  protein of unknown function (DUF397)  38.71 
 
 
65 aa  43.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8470  protein of unknown function DUF397  35.94 
 
 
92 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20560  protein of unknown function (DUF397)  40.32 
 
 
66 aa  43.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715891  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1984  protein of unknown function DUF397  46.03 
 
 
69 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00383957  normal  0.845583 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1432  hypothetical protein  44.07 
 
 
62 aa  43.5  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353493  hitchhiker  0.000418088 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0905  hypothetical protein  42.42 
 
 
76 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0955654 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0266  protein of unknown function DUF397  39.06 
 
 
69 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.687438  normal  0.998664 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1416  hypothetical protein  43.64 
 
 
63 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0509701 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5628  hypothetical protein  37.29 
 
 
78 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.524184 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3357  hypothetical protein  41.82 
 
 
64 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0411145  normal  0.0781791 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1596  hypothetical protein  40.32 
 
 
66 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4695  protein of unknown function DUF397  37.29 
 
 
127 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3657  hypothetical protein  40.68 
 
 
62 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1379  hypothetical protein  43.64 
 
 
63 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.383201  hitchhiker  0.00799748 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0924  hypothetical protein  40 
 
 
63 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.277312  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0103  hypothetical protein  45.45 
 
 
63 aa  41.6  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0099  hypothetical protein  43.64 
 
 
63 aa  42  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0419317  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1786  hypothetical protein  41.82 
 
 
63 aa  42  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2231  hypothetical protein  42.37 
 
 
79 aa  42  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0143015  normal  0.145093 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7553  hypothetical protein  37.14 
 
 
99 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0567  protein of unknown function DUF397  44.07 
 
 
95 aa  41.6  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2127  protein of unknown function DUF397  34.25 
 
 
110 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000239677  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0876  protein of unknown function DUF397  36.67 
 
 
80 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0927  hypothetical protein  40 
 
 
63 aa  41.2  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6482  hypothetical protein  36.49 
 
 
76 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.435568 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1019  hypothetical protein  35.53 
 
 
81 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1230  protein of unknown function DUF397  37.93 
 
 
64 aa  40.4  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0779142  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2601  hypothetical protein  43.64 
 
 
62 aa  40.4  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0203178  normal  0.0405865 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3009  hypothetical protein  38.24 
 
 
113 aa  40.4  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>