67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0924 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0924  hypothetical protein  100 
 
 
63 aa  132  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.277312  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2071  hypothetical protein  48.21 
 
 
67 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.392038  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0037  hypothetical protein  43.1 
 
 
69 aa  53.9  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8369  hypothetical protein  46.55 
 
 
67 aa  53.5  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6482  hypothetical protein  39.73 
 
 
76 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.435568 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1781  hypothetical protein  43.33 
 
 
69 aa  52  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1019  hypothetical protein  41.43 
 
 
81 aa  51.6  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1517  hypothetical protein  47.54 
 
 
68 aa  50.8  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0185029 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2969  hypothetical protein  45.9 
 
 
68 aa  50.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000849623 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7763  hypothetical protein  40 
 
 
68 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0716  protein of unknown function DUF397  43.55 
 
 
65 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3357  hypothetical protein  42.37 
 
 
64 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0411145  normal  0.0781791 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0235  hypothetical protein  42.62 
 
 
77 aa  48.5  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0266  protein of unknown function DUF397  48.84 
 
 
69 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.687438  normal  0.998664 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3445  hypothetical protein  50 
 
 
78 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7976  hypothetical protein  38.03 
 
 
80 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0545278  normal  0.164909 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0413  protein of unknown function DUF397  39.29 
 
 
68 aa  47.4  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0175926  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0228  hypothetical protein  40 
 
 
80 aa  47.4  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1432  hypothetical protein  39.66 
 
 
62 aa  47.4  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353493  hitchhiker  0.000418088 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0643  hypothetical protein  47.54 
 
 
61 aa  46.6  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1834  protein of unknown function DUF397  39.66 
 
 
59 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7553  hypothetical protein  40.3 
 
 
99 aa  45.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0599  hypothetical protein  42.86 
 
 
69 aa  46.2  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1969  protein of unknown function DUF397  45.61 
 
 
76 aa  45.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00185784  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4695  protein of unknown function DUF397  35.48 
 
 
127 aa  45.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1627  protein of unknown function DUF397  43.86 
 
 
59 aa  44.7  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2703  hypothetical protein  44.44 
 
 
67 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6435  protein of unknown function DUF397  55.56 
 
 
57 aa  44.7  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0718  protein of unknown function DUF397  40.62 
 
 
73 aa  44.7  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3657  hypothetical protein  41.51 
 
 
62 aa  44.7  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1786  hypothetical protein  41.51 
 
 
63 aa  44.7  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4504  hypothetical protein  41.51 
 
 
62 aa  44.3  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.955874 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2128  hypothetical protein  47.92 
 
 
62 aa  44.3  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7003  protein of unknown function DUF397  43.14 
 
 
84 aa  44.3  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1295  hypothetical protein  46 
 
 
78 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.471559  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0927  hypothetical protein  39.62 
 
 
63 aa  43.9  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6649  hypothetical protein  41.38 
 
 
79 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.476212  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36640  protein of unknown function (DUF397)  39.29 
 
 
83 aa  43.9  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.0015395  normal  0.323981 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1379  hypothetical protein  38.98 
 
 
63 aa  43.9  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.383201  hitchhiker  0.00799748 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4463  hypothetical protein  39.62 
 
 
63 aa  43.5  0.0009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24730  protein of unknown function (DUF397)  40.32 
 
 
69 aa  43.5  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1445  protein of unknown function DUF397  38.89 
 
 
64 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.12043  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1597  hypothetical protein  39.34 
 
 
70 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1505  protein of unknown function DUF397  40 
 
 
139 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.272297  hitchhiker  0.00205006 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1802  hypothetical protein  37.29 
 
 
63 aa  42.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0108  protein of unknown function DUF397  38.6 
 
 
61 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1416  hypothetical protein  37.29 
 
 
63 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0509701 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0099  hypothetical protein  41.51 
 
 
63 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0419317  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4569  hypothetical protein  39.66 
 
 
77 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.246526 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2305  putative regulator  40 
 
 
77 aa  41.6  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1413  protein of unknown function DUF397  37.93 
 
 
66 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194771  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1897  hypothetical protein  42.86 
 
 
64 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.422  normal  0.225792 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1548  hypothetical protein  31.75 
 
 
71 aa  41.6  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0220305  normal  0.0244583 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1588  hypothetical protein  31.75 
 
 
71 aa  41.6  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2543  hypothetical protein  39.66 
 
 
67 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258706  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1767  hypothetical protein  36.67 
 
 
127 aa  41.2  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1230  hypothetical protein  36.07 
 
 
77 aa  41.2  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.375294 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0513  hypothetical protein  46 
 
 
62 aa  41.2  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.47229  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3009  hypothetical protein  41.51 
 
 
113 aa  40.8  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1230  protein of unknown function DUF397  37.29 
 
 
64 aa  40.8  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0779142  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0265  protein of unknown function DUF397  37.93 
 
 
68 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138869  normal  0.97902 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1984  protein of unknown function DUF397  44.07 
 
 
69 aa  40.8  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00383957  normal  0.845583 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3236  hypothetical protein  39.62 
 
 
63 aa  40.4  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7828  hypothetical protein  47.73 
 
 
69 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1329  hypothetical protein  48.84 
 
 
68 aa  40.4  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4869  hypothetical protein  39.62 
 
 
60 aa  40  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.277477  normal  0.940812 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0103  hypothetical protein  39.62 
 
 
63 aa  40  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>