114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3445 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3445  hypothetical protein  100 
 
 		 78 aa  164  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1295  hypothetical protein  92.21 
 
 		 78 aa  152  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.471559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0876  protein of unknown function DUF397  70.13 
 
 		 80 aa  117  6e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2305  putative regulator  75.34 
 
 		 77 aa  116  7.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1230  hypothetical protein  66.67 
 
 		 77 aa  107  7.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.375294 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0521  protein of unknown function DUF397  67.12 
 
 		 77 aa  106  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2513  hypothetical protein  61.04 
 
 		 78 aa  103  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1969  protein of unknown function DUF397  70.31 
 
 		 76 aa  103  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00185784  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4153  protein of unknown function DUF397  61.54 
 
 		 78 aa  101  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2090  hypothetical protein  58.23 
 
 		 79 aa  101  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.161003  normal  0.0235666 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2231  hypothetical protein  59.49 
 
 		 79 aa  100  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0143015  normal  0.145093 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0567  protein of unknown function DUF397  60.53 
 
 		 95 aa  100  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5736  hypothetical protein  64.56 
 
 		 80 aa  100  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.534328 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5628  hypothetical protein  54.55 
 
 		 78 aa  95.9  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.524184 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1504  protein of unknown function DUF397  63.01 
 
 		 103 aa  92.8  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37900  protein of unknown function (DUF397)  56.16 
 
 		 82 aa  92.4  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0235  hypothetical protein  49.25 
 
 		 77 aa  69.3  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0397  hypothetical protein  47.76 
 
 		 69 aa  65.5  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8369  hypothetical protein  51.72 
 
 		 67 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0037  hypothetical protein  50 
 
 		 69 aa  64.7  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0266  protein of unknown function DUF397  44.44 
 
 		 69 aa  64.3  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.687438  normal  0.998664 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6482  hypothetical protein  42.47 
 
 		 76 aa  63.9  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.435568 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1781  hypothetical protein  46.27 
 
 		 69 aa  63.9  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1019  hypothetical protein  41.25 
 
 		 81 aa  61.6  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0228  hypothetical protein  50.85 
 
 		 80 aa  60.8  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2703  hypothetical protein  44.93 
 
 		 67 aa  61.2  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0265  protein of unknown function DUF397  42.62 
 
 		 68 aa  60.1  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138869  normal  0.97902 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7763  hypothetical protein  50 
 
 		 68 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1597  hypothetical protein  42.19 
 
 		 70 aa  57  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3476  hypothetical protein  43.55 
 
 		 72 aa  56.6  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3856  hypothetical protein  41.94 
 
 		 72 aa  55.5  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4124  hypothetical protein  45.31 
 
 		 75 aa  56.2  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14270  protein of unknown function (DUF397)  46.03 
 
 		 66 aa  56.2  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.784152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3763  protein of unknown function DUF397  38.96 
 
 		 83 aa  55.1  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20610  protein of unknown function (DUF397)  47.37 
 
 		 64 aa  53.9  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.069741  normal  0.682793 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1329  hypothetical protein  42.42 
 
 		 68 aa  53.9  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8470  protein of unknown function DUF397  40.32 
 
 		 92 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6649  hypothetical protein  45 
 
 		 79 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.476212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6312  protein of unknown function DUF397  40 
 
 		 74 aa  52.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61619  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2071  hypothetical protein  48.48 
 
 		 67 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.392038  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1517  hypothetical protein  52.38 
 
 		 68 aa  51.6  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0185029 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2969  hypothetical protein  46 
 
 		 68 aa  52  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000849623 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20560  protein of unknown function (DUF397)  43.86 
 
 		 66 aa  52  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3743  hypothetical protein  42.19 
 
 		 75 aa  51.2  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0993  hypothetical protein  40.62 
 
 		 67 aa  50.8  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0905  hypothetical protein  35.82 
 
 		 76 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0955654 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3941  protein of unknown function DUF397  38.71 
 
 		 64 aa  50.8  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272319  normal  0.0398541 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4454  protein of unknown function DUF397  46.67 
 
 		 69 aa  50.1  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4695  protein of unknown function DUF397  43.33 
 
 		 127 aa  50.1  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0599  hypothetical protein  40.35 
 
 		 69 aa  49.7  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6435  protein of unknown function DUF397  52.38 
 
 		 57 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1984  protein of unknown function DUF397  45 
 
 		 69 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00383957  normal  0.845583 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0973  hypothetical protein  40.35 
 
 		 64 aa  48.9  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1588  hypothetical protein  38.24 
 
 		 71 aa  49.3  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1548  hypothetical protein  39.39 
 
 		 71 aa  48.9  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0220305  normal  0.0244583 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2601  hypothetical protein  50 
 
 		 62 aa  49.3  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0203178  normal  0.0405865 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12020  protein of unknown function (DUF397)  43.08 
 
 		 65 aa  49.7  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3503  protein of unknown function DUF397  42.37 
 
 		 65 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0535915  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2543  hypothetical protein  49.06 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2128  protein of unknown function DUF397  37.1 
 
 		 64 aa  48.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.996693  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1304  protein of unknown function DUF397  45.28 
 
 		 68 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0379944  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2448  hypothetical protein  46.3 
 
 		 62 aa  48.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.14038  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0924  hypothetical protein  50 
 
 		 63 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.277312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0037  hypothetical protein  41.27 
 
 		 73 aa  47.8  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.727174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0042  hypothetical protein  41.27 
 
 		 73 aa  47.4  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1159  hypothetical protein  44.23 
 
 		 66 aa  47.8  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0339608  unclonable  0.0000000343885 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7976  hypothetical protein  38.36 
 
 		 80 aa  47.8  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0545278  normal  0.164909 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6018  protein of unknown function DUF397  60 
 
 		 89 aa  47.8  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.260789  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0631  hypothetical protein  43.64 
 
 		 72 aa  47.4  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.243928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7828  hypothetical protein  39.71 
 
 		 69 aa  47.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24730  protein of unknown function (DUF397)  40.32 
 
 		 69 aa  47.4  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0718  protein of unknown function DUF397  39.39 
 
 		 73 aa  47.4  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3357  hypothetical protein  50.88 
 
 		 64 aa  47.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0411145  normal  0.0781791 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12060  protein of unknown function (DUF397)  45.61 
 
 		 65 aa  47  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3784  hypothetical protein  47.37 
 
 		 85 aa  47  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0513  hypothetical protein  46.67 
 
 		 62 aa  47  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.47229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0643  hypothetical protein  47.17 
 
 		 61 aa  46.6  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0927  hypothetical protein  54 
 
 		 63 aa  46.6  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1379  hypothetical protein  52 
 
 		 63 aa  46.2  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.383201  hitchhiker  0.00799748 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1230  protein of unknown function DUF397  38.71 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0779142  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1767  hypothetical protein  40 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1786  hypothetical protein  49.09 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2128  hypothetical protein  49.09 
 
 		 62 aa  46.2  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1627  protein of unknown function DUF397  48.15 
 
 		 59 aa  46.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4685  hypothetical protein  42.42 
 
 		 69 aa  45.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.144765  normal  0.226614 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1745  hypothetical protein  37.5 
 
 		 64 aa  44.7  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.64493  normal  0.800474 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1728  hypothetical protein  39.34 
 
 		 78 aa  44.3  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0749322  hitchhiker  0.00877773 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1416  hypothetical protein  50 
 
 		 63 aa  44.3  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0509701 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3009  hypothetical protein  47.27 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0441  protein of unknown function DUF397  43.4 
 
 		 63 aa  44.3  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0708  hypothetical protein  39.29 
 
 		 64 aa  43.9  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1897  hypothetical protein  44.64 
 
 		 64 aa  43.9  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.422  normal  0.225792 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1505  protein of unknown function DUF397  39.66 
 
 		 139 aa  43.5  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.272297  hitchhiker  0.00205006 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5396  protein of unknown function DUF397  42.31 
 
 		 66 aa  43.9  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.051071  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0787  hypothetical protein  35.09 
 
 		 106 aa  43.9  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.679584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0099  hypothetical protein  45.45 
 
 		 63 aa  43.5  0.0009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0419317  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3657  hypothetical protein  39.66 
 
 		 62 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0716  protein of unknown function DUF397  36.51 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4087  protein of unknown function DUF397  38.6 
 
 		 60 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4463  hypothetical protein  45.45 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.169259 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>