82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1548 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1548  hypothetical protein  100 
 
 		 71 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0220305  normal  0.0244583 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1588  hypothetical protein  98.59 
 
 		 71 aa  145  3e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3763  protein of unknown function DUF397  69.12 
 
 		 83 aa  99.8  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5086  hypothetical protein  56.67 
 
 		 77 aa  73.6  0.0000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000003971 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4568  hypothetical protein  53.23 
 
 		 77 aa  70.1  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.246526 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14270  protein of unknown function (DUF397)  52.38 
 
 		 66 aa  68.6  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.784152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4569  hypothetical protein  49.23 
 
 		 77 aa  67  0.00000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.246526 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2090  hypothetical protein  47.76 
 
 		 79 aa  63.5  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.161003  normal  0.0235666 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2231  hypothetical protein  45.71 
 
 		 79 aa  63.2  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0143015  normal  0.145093 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1781  hypothetical protein  51.61 
 
 		 69 aa  62  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0235  hypothetical protein  46.97 
 
 		 77 aa  61.2  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7763  hypothetical protein  44.62 
 
 		 68 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0037  hypothetical protein  51.61 
 
 		 69 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1230  hypothetical protein  49.25 
 
 		 77 aa  58.5  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.375294 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0228  hypothetical protein  49.21 
 
 		 80 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1969  protein of unknown function DUF397  43.08 
 
 		 76 aa  56.6  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00185784  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2305  putative regulator  44.62 
 
 		 77 aa  56.6  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37900  protein of unknown function (DUF397)  44.78 
 
 		 82 aa  55.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8470  protein of unknown function DUF397  51.52 
 
 		 92 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2513  hypothetical protein  49.18 
 
 		 78 aa  55.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6482  hypothetical protein  43.24 
 
 		 76 aa  54.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.435568 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2128  protein of unknown function DUF397  43.08 
 
 		 64 aa  54.7  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.996693  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5736  hypothetical protein  41.94 
 
 		 80 aa  55.1  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.534328 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0521  protein of unknown function DUF397  42.42 
 
 		 77 aa  54.3  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0567  protein of unknown function DUF397  46.97 
 
 		 95 aa  53.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7976  hypothetical protein  40.54 
 
 		 80 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0545278  normal  0.164909 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8369  hypothetical protein  47.54 
 
 		 67 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4153  protein of unknown function DUF397  43.08 
 
 		 78 aa  52.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12020  protein of unknown function (DUF397)  52.83 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20610  protein of unknown function (DUF397)  45.45 
 
 		 64 aa  51.6  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.069741  normal  0.682793 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1504  protein of unknown function DUF397  45.9 
 
 		 103 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36640  protein of unknown function (DUF397)  40.98 
 
 		 83 aa  50.8  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.0015395  normal  0.323981 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12060  protein of unknown function (DUF397)  53.7 
 
 		 65 aa  50.4  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0876  protein of unknown function DUF397  43.33 
 
 		 80 aa  50.8  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1230  protein of unknown function DUF397  36.51 
 
 		 64 aa  49.7  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0779142  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6649  hypothetical protein  43.55 
 
 		 79 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.476212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2703  hypothetical protein  41.54 
 
 		 67 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0265  protein of unknown function DUF397  45.16 
 
 		 68 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138869  normal  0.97902 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0787  hypothetical protein  42.62 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.679584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3445  hypothetical protein  39.39 
 
 		 78 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4609  protein of unknown function DUF397  42.03 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1295  hypothetical protein  39.39 
 
 		 78 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.471559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7828  hypothetical protein  41.67 
 
 		 69 aa  48.9  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1505  protein of unknown function DUF397  44.26 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.272297  hitchhiker  0.00205006 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6312  protein of unknown function DUF397  44.9 
 
 		 74 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61619  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0266  protein of unknown function DUF397  40.32 
 
 		 69 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.687438  normal  0.998664 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2543  hypothetical protein  43.75 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1767  hypothetical protein  39.68 
 
 		 127 aa  47.8  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5628  hypothetical protein  43.55 
 
 		 78 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.524184 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3357  hypothetical protein  38.18 
 
 		 64 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0411145  normal  0.0781791 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1329  hypothetical protein  43.75 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1019  hypothetical protein  38.36 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4695  protein of unknown function DUF397  33.33 
 
 		 127 aa  45.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1432  hypothetical protein  45.45 
 
 		 62 aa  45.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353493  hitchhiker  0.000418088 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20560  protein of unknown function (DUF397)  52.08 
 
 		 66 aa  45.4  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2071  hypothetical protein  34.85 
 
 		 67 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.392038  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2127  protein of unknown function DUF397  33.73 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000239677  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0599  hypothetical protein  40 
 
 		 69 aa  44.3  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3657  hypothetical protein  44.64 
 
 		 62 aa  43.9  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3784  hypothetical protein  47.37 
 
 		 85 aa  43.9  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6018  protein of unknown function DUF397  46.15 
 
 		 89 aa  43.9  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.260789  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4685  hypothetical protein  42.65 
 
 		 69 aa  43.9  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.144765  normal  0.226614 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0099  hypothetical protein  43.14 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0419317  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0397  hypothetical protein  44.62 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1897  hypothetical protein  42.86 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.422  normal  0.225792 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3236  hypothetical protein  39.29 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0103  hypothetical protein  41.18 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0631  hypothetical protein  38.6 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.243928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1984  protein of unknown function DUF397  39.39 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00383957  normal  0.845583 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3941  protein of unknown function DUF397  39.34 
 
 		 64 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272319  normal  0.0398541 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4463  hypothetical protein  35.48 
 
 		 63 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1379  hypothetical protein  43.14 
 
 		 63 aa  42  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.383201  hitchhiker  0.00799748 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1416  hypothetical protein  46.15 
 
 		 63 aa  41.2  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0509701 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0924  hypothetical protein  31.75 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.277312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4869  hypothetical protein  43.14 
 
 		 60 aa  41.2  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.277477  normal  0.940812 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24730  protein of unknown function (DUF397)  36.36 
 
 		 69 aa  41.6  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0716  protein of unknown function DUF397  31.82 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3009  hypothetical protein  44.23 
 
 		 113 aa  40.4  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2128  hypothetical protein  41.07 
 
 		 62 aa  40.4  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3476  hypothetical protein  42.86 
 
 		 72 aa  40.4  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3856  hypothetical protein  42.86 
 
 		 72 aa  40  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0927  hypothetical protein  46.15 
 
 		 63 aa  40  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>