114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7553 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7553  hypothetical protein  100 
 
 		 99 aa  203  7e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1019  hypothetical protein  46.24 
 
 		 81 aa  77  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6482  hypothetical protein  45.74 
 
 		 76 aa  76.3  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.435568 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4695  protein of unknown function DUF397  42.71 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2703  hypothetical protein  45.59 
 
 		 67 aa  60.5  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0228  hypothetical protein  45.12 
 
 		 80 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1295  protein of unknown function DUF397  45.16 
 
 		 82 aa  59.3  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1781  hypothetical protein  52.17 
 
 		 69 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0599  hypothetical protein  45.71 
 
 		 69 aa  58.9  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7976  hypothetical protein  44.94 
 
 		 80 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0545278  normal  0.164909 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1329  hypothetical protein  42.86 
 
 		 68 aa  58.9  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6649  hypothetical protein  41.67 
 
 		 79 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.476212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8369  hypothetical protein  46.38 
 
 		 67 aa  57.8  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0716  protein of unknown function DUF397  46.97 
 
 		 65 aa  58.2  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4569  hypothetical protein  46.48 
 
 		 77 aa  57.4  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.246526 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4568  hypothetical protein  45.07 
 
 		 77 aa  56.2  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.246526 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0643  hypothetical protein  50.82 
 
 		 61 aa  55.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5232  hypothetical protein  44.83 
 
 		 79 aa  55.5  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.664195  normal  0.424507 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2071  hypothetical protein  50.75 
 
 		 67 aa  54.3  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.392038  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5086  hypothetical protein  42.25 
 
 		 77 aa  53.9  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000003971 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0235  hypothetical protein  35.87 
 
 		 77 aa  53.9  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7763  hypothetical protein  40.86 
 
 		 68 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3236  hypothetical protein  40.22 
 
 		 63 aa  53.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7003  protein of unknown function DUF397  44.19 
 
 		 84 aa  53.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1416  hypothetical protein  40.91 
 
 		 63 aa  52.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0509701 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0037  hypothetical protein  47.83 
 
 		 69 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1379  hypothetical protein  40.91 
 
 		 63 aa  52.8  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.383201  hitchhiker  0.00799748 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1432  hypothetical protein  41.18 
 
 		 62 aa  52  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353493  hitchhiker  0.000418088 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3357  hypothetical protein  39.78 
 
 		 64 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0411145  normal  0.0781791 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2448  hypothetical protein  45.45 
 
 		 62 aa  51.6  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.14038  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3657  hypothetical protein  37.08 
 
 		 62 aa  51.6  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1445  protein of unknown function DUF397  40 
 
 		 64 aa  52  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.12043  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37900  protein of unknown function (DUF397)  36.9 
 
 		 82 aa  51.2  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3501  protein of unknown function DUF397  40.91 
 
 		 79 aa  51.2  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0397  hypothetical protein  41.67 
 
 		 69 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0037  hypothetical protein  46.48 
 
 		 73 aa  50.8  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.727174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0103  hypothetical protein  39.77 
 
 		 63 aa  50.8  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3009  hypothetical protein  46.27 
 
 		 113 aa  50.8  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24730  protein of unknown function (DUF397)  42.65 
 
 		 69 aa  50.8  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0718  protein of unknown function DUF397  35.16 
 
 		 73 aa  50.8  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1517  hypothetical protein  36.47 
 
 		 68 aa  50.4  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0185029 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0099  hypothetical protein  48.44 
 
 		 63 aa  50.4  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0419317  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3941  protein of unknown function DUF397  40 
 
 		 64 aa  50.4  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272319  normal  0.0398541 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4235  hypothetical protein  42.42 
 
 		 62 aa  50.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0927  hypothetical protein  36.67 
 
 		 63 aa  49.7  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6122  protein of unknown function DUF397  39.06 
 
 		 61 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.464343  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1984  protein of unknown function DUF397  40 
 
 		 69 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00383957  normal  0.845583 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36640  protein of unknown function (DUF397)  42.67 
 
 		 83 aa  49.7  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.0015395  normal  0.323981 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4153  protein of unknown function DUF397  42.25 
 
 		 78 aa  48.9  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0042  hypothetical protein  45.07 
 
 		 73 aa  49.3  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5452  protein of unknown function DUF397  45.45 
 
 		 59 aa  48.9  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.455168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1230  protein of unknown function DUF397  43.28 
 
 		 64 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0779142  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1413  protein of unknown function DUF397  37.5 
 
 		 66 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194771  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4579  protein of unknown function DUF397  40.28 
 
 		 70 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2543  hypothetical protein  43.94 
 
 		 67 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3743  hypothetical protein  37.11 
 
 		 75 aa  48.5  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4124  hypothetical protein  35.87 
 
 		 75 aa  48.5  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0972  hypothetical protein  38.89 
 
 		 61 aa  48.1  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2601  hypothetical protein  45.9 
 
 		 62 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0203178  normal  0.0405865 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0708  hypothetical protein  45.59 
 
 		 64 aa  47.8  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1802  hypothetical protein  33.33 
 
 		 63 aa  47.8  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14270  protein of unknown function (DUF397)  41.18 
 
 		 66 aa  47.8  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.784152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2969  hypothetical protein  37.5 
 
 		 68 aa  47.4  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000849623 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5993  protein of unknown function DUF397  40.58 
 
 		 64 aa  47.4  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.342099  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0266  protein of unknown function DUF397  38.57 
 
 		 69 aa  47.8  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.687438  normal  0.998664 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1304  protein of unknown function DUF397  36.78 
 
 		 68 aa  47.4  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0379944  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1132  hypothetical protein  37.66 
 
 		 65 aa  47.4  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2128  hypothetical protein  37.65 
 
 		 62 aa  47.4  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1786  hypothetical protein  35.56 
 
 		 63 aa  47  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7828  hypothetical protein  39.71 
 
 		 69 aa  47  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1897  hypothetical protein  36.96 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.422  normal  0.225792 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4463  hypothetical protein  42.42 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0906  hypothetical protein  38.1 
 
 		 73 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0924  hypothetical protein  40.3 
 
 		 63 aa  45.4  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.277312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1834  protein of unknown function DUF397  40.91 
 
 		 59 aa  45.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1504  protein of unknown function DUF397  37.97 
 
 		 103 aa  45.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4869  hypothetical protein  45.9 
 
 		 60 aa  45.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.277477  normal  0.940812 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1657  hypothetical protein  41.79 
 
 		 68 aa  44.7  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0973  hypothetical protein  40.28 
 
 		 64 aa  44.7  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0993  hypothetical protein  46.27 
 
 		 67 aa  44.3  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5396  protein of unknown function DUF397  45 
 
 		 66 aa  44.3  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.051071  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2305  putative regulator  37.97 
 
 		 77 aa  43.5  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3856  hypothetical protein  32.1 
 
 		 72 aa  43.5  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20610  protein of unknown function (DUF397)  32.86 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.069741  normal  0.682793 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4255  hypothetical protein  37.68 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.912797  normal  0.127607 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4685  hypothetical protein  39.13 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.144765  normal  0.226614 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6435  protein of unknown function DUF397  41.94 
 
 		 57 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3763  protein of unknown function DUF397  34.78 
 
 		 83 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3476  hypothetical protein  33.33 
 
 		 72 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4504  hypothetical protein  38.46 
 
 		 62 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.955874 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1728  hypothetical protein  41.27 
 
 		 78 aa  42  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0749322  hitchhiker  0.00877773 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0567  protein of unknown function DUF397  31.82 
 
 		 95 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1505  protein of unknown function DUF397  37.14 
 
 		 139 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.272297  hitchhiker  0.00205006 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3503  protein of unknown function DUF397  43.28 
 
 		 65 aa  41.6  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0535915  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1597  hypothetical protein  36.76 
 
 		 70 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5628  hypothetical protein  37.31 
 
 		 78 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.524184 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3445  hypothetical protein  33.33 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4378  hypothetical protein  43.08 
 
 		 62 aa  41.6  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1159  hypothetical protein  44.07 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0339608  unclonable  0.0000000343885 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1480  protein of unknown function DUF397  38.1 
 
 		 59 aa  41.6  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>