192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_24730 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_24730  protein of unknown function (DUF397)  100 
 
 		 69 aa  140  4e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0228  hypothetical protein  68.42 
 
 		 80 aa  75.5  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2703  hypothetical protein  53.03 
 
 		 67 aa  75.1  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6649  hypothetical protein  56.25 
 
 		 79 aa  67.8  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.476212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6122  protein of unknown function DUF397  51.72 
 
 		 61 aa  66.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.464343  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0708  hypothetical protein  53.97 
 
 		 64 aa  65.9  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1161  protein of unknown function DUF397  55.93 
 
 		 62 aa  65.9  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.653899  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7828  hypothetical protein  46.77 
 
 		 69 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0037  hypothetical protein  56.67 
 
 		 69 aa  64.3  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1802  hypothetical protein  49.15 
 
 		 63 aa  63.9  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8369  hypothetical protein  50 
 
 		 67 aa  62.8  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1162  protein of unknown function DUF397  53.33 
 
 		 62 aa  63.2  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.490498  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1295  protein of unknown function DUF397  55.56 
 
 		 82 aa  63.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0973  hypothetical protein  50.91 
 
 		 64 aa  62  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8470  protein of unknown function DUF397  44.62 
 
 		 92 aa  60.8  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20560  protein of unknown function (DUF397)  43.86 
 
 		 66 aa  60.8  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4695  protein of unknown function DUF397  49.23 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1781  hypothetical protein  53.73 
 
 		 69 aa  60.1  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1413  protein of unknown function DUF397  47.46 
 
 		 66 aa  60.1  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194771  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14270  protein of unknown function (DUF397)  46.97 
 
 		 66 aa  60.1  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.784152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0972  hypothetical protein  45.45 
 
 		 61 aa  59.7  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0716  protein of unknown function DUF397  46.03 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0235  hypothetical protein  47.69 
 
 		 77 aa  58.9  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1329  hypothetical protein  46.03 
 
 		 68 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37900  protein of unknown function (DUF397)  47.76 
 
 		 82 aa  58.9  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7976  hypothetical protein  45.33 
 
 		 80 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0545278  normal  0.164909 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4783  protein of unknown function DUF397  58.49 
 
 		 64 aa  58.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6706  protein of unknown function DUF397  52.83 
 
 		 59 aa  58.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0643  hypothetical protein  50.85 
 
 		 61 aa  58.2  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2071  hypothetical protein  47.62 
 
 		 67 aa  57.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.392038  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4579  protein of unknown function DUF397  47.54 
 
 		 70 aa  57.4  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0599  hypothetical protein  49.18 
 
 		 69 aa  57.4  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4609  protein of unknown function DUF397  45.16 
 
 		 66 aa  57.4  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0441  protein of unknown function DUF397  47.46 
 
 		 63 aa  57.4  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1304  protein of unknown function DUF397  51.79 
 
 		 68 aa  57  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0379944  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2538  protein of unknown function DUF397  54.9 
 
 		 62 aa  56.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000230929  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1230  hypothetical protein  44.44 
 
 		 77 aa  56.6  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.375294 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4272  protein of unknown function DUF397  50.91 
 
 		 75 aa  56.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4124  hypothetical protein  48.39 
 
 		 75 aa  56.6  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4781  protein of unknown function DUF397  52.83 
 
 		 64 aa  56.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3779  protein of unknown function DUF397  46.03 
 
 		 66 aa  56.6  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4454  protein of unknown function DUF397  48.48 
 
 		 69 aa  56.6  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4784  protein of unknown function DUF397  55.56 
 
 		 61 aa  55.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1019  hypothetical protein  40 
 
 		 81 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0567  protein of unknown function DUF397  43.94 
 
 		 95 aa  55.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1943  protein of unknown function DUF397  46.3 
 
 		 55 aa  55.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6482  hypothetical protein  41.89 
 
 		 76 aa  55.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.435568 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6435  protein of unknown function DUF397  51.02 
 
 		 57 aa  55.5  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0718  protein of unknown function DUF397  40 
 
 		 73 aa  55.1  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1445  protein of unknown function DUF397  43.86 
 
 		 64 aa  54.7  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.12043  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3155  protein of unknown function DUF397  52.94 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.093301  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4159  protein of unknown function DUF397  47.37 
 
 		 67 aa  54.7  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4153  protein of unknown function DUF397  43.28 
 
 		 78 aa  53.9  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0905  hypothetical protein  43.28 
 
 		 76 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0955654 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3357  hypothetical protein  50.79 
 
 		 64 aa  53.9  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0411145  normal  0.0781791 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3780  protein of unknown function DUF397  44.62 
 
 		 66 aa  53.9  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3778  protein of unknown function DUF397  43.08 
 
 		 66 aa  53.9  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12020  protein of unknown function (DUF397)  42.11 
 
 		 65 aa  53.9  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20610  protein of unknown function (DUF397)  36.84 
 
 		 64 aa  53.9  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.069741  normal  0.682793 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0673  protein of unknown function DUF397  50 
 
 		 62 aa  53.5  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2513  hypothetical protein  45.31 
 
 		 78 aa  53.5  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2540  protein of unknown function DUF397  50 
 
 		 60 aa  53.5  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000021023  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3501  protein of unknown function DUF397  50 
 
 		 79 aa  53.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5628  hypothetical protein  39.06 
 
 		 78 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.524184 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3776  protein of unknown function DUF397  44.44 
 
 		 66 aa  53.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0265  protein of unknown function DUF397  45 
 
 		 68 aa  53.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138869  normal  0.97902 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1504  protein of unknown function DUF397  45.61 
 
 		 103 aa  53.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0397  hypothetical protein  46.03 
 
 		 69 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0993  hypothetical protein  44.07 
 
 		 67 aa  52.4  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3743  hypothetical protein  48.39 
 
 		 75 aa  52  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2689  protein of unknown function DUF397  47.17 
 
 		 63 aa  52.4  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00137319  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12060  protein of unknown function (DUF397)  42.11 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5452  protein of unknown function DUF397  46.3 
 
 		 59 aa  51.6  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.455168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2969  hypothetical protein  44.07 
 
 		 68 aa  52  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000849623 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36640  protein of unknown function (DUF397)  47.46 
 
 		 83 aa  51.6  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.0015395  normal  0.323981 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3777  protein of unknown function DUF397  48.28 
 
 		 66 aa  51.2  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0906  hypothetical protein  40.91 
 
 		 73 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6312  protein of unknown function DUF397  46.48 
 
 		 74 aa  50.8  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61619  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1767  hypothetical protein  41.54 
 
 		 127 aa  50.8  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7553  hypothetical protein  42.65 
 
 		 99 aa  50.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1480  protein of unknown function DUF397  46.94 
 
 		 59 aa  50.8  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0266  protein of unknown function DUF397  41.27 
 
 		 69 aa  50.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.687438  normal  0.998664 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2580  protein of unknown function DUF397  44.23 
 
 		 59 aa  50.4  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0232734 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1517  hypothetical protein  40.68 
 
 		 68 aa  50.4  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0185029 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4137  protein of unknown function DUF397  46.3 
 
 		 58 aa  50.4  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7763  hypothetical protein  46.88 
 
 		 68 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3649  protein of unknown function DUF397  48.98 
 
 		 75 aa  50.4  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.375701  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5396  protein of unknown function DUF397  51.92 
 
 		 66 aa  50.4  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.051071  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7003  protein of unknown function DUF397  47.92 
 
 		 84 aa  50.4  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0521  protein of unknown function DUF397  40.3 
 
 		 77 aa  50.4  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1230  protein of unknown function DUF397  42.37 
 
 		 64 aa  50.1  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0779142  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2539  protein of unknown function DUF397  48.08 
 
 		 60 aa  50.1  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000183418  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1984  protein of unknown function DUF397  40.98 
 
 		 69 aa  50.4  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00383957  normal  0.845583 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3657  hypothetical protein  49.15 
 
 		 62 aa  49.7  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1432  hypothetical protein  49.15 
 
 		 62 aa  50.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353493  hitchhiker  0.000418088 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3941  protein of unknown function DUF397  45.61 
 
 		 64 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272319  normal  0.0398541 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0262  hypothetical protein  41.38 
 
 		 62 aa  48.9  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0487  protein of unknown function DUF397  39.29 
 
 		 63 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2208  hypothetical protein  42.86 
 
 		 61 aa  49.3  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.280221  normal  0.523605 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4087  protein of unknown function DUF397  50 
 
 		 60 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>