103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3649 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3649  protein of unknown function DUF397  100 
 
 		 75 aa  155  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.375701  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2703  hypothetical protein  55.93 
 
 		 67 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3357  hypothetical protein  47.76 
 
 		 64 aa  57  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0411145  normal  0.0781791 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4159  protein of unknown function DUF397  50 
 
 		 67 aa  55.1  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0103  hypothetical protein  49.28 
 
 		 63 aa  54.7  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6706  protein of unknown function DUF397  48.08 
 
 		 59 aa  52.8  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1132  hypothetical protein  59.62 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7763  hypothetical protein  49.15 
 
 		 68 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0228  hypothetical protein  50 
 
 		 80 aa  51.6  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1329  hypothetical protein  50.98 
 
 		 68 aa  52  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0485  protein of unknown function DUF397  52.83 
 
 		 63 aa  51.6  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0037  hypothetical protein  51.02 
 
 		 73 aa  51.2  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.727174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0042  hypothetical protein  51.02 
 
 		 73 aa  51.6  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7828  hypothetical protein  50 
 
 		 69 aa  50.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1517  hypothetical protein  56.25 
 
 		 68 aa  50.8  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0185029 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5396  protein of unknown function DUF397  50 
 
 		 66 aa  50.4  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.051071  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4463  hypothetical protein  42.42 
 
 		 63 aa  50.4  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7003  protein of unknown function DUF397  45.61 
 
 		 84 aa  50.4  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8470  protein of unknown function DUF397  45.76 
 
 		 92 aa  50.4  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24730  protein of unknown function (DUF397)  48.98 
 
 		 69 aa  50.4  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1786  hypothetical protein  45.45 
 
 		 63 aa  50.1  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0718  protein of unknown function DUF397  44.59 
 
 		 73 aa  50.4  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4695  protein of unknown function DUF397  43.4 
 
 		 127 aa  50.4  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1416  hypothetical protein  47.37 
 
 		 63 aa  50.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0509701 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1897  hypothetical protein  49.09 
 
 		 64 aa  50.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.422  normal  0.225792 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0099  hypothetical protein  46.38 
 
 		 63 aa  50.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0419317  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0927  hypothetical protein  45.45 
 
 		 63 aa  50.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1379  hypothetical protein  47.37 
 
 		 63 aa  50.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.383201  hitchhiker  0.00799748 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36640  protein of unknown function (DUF397)  51.06 
 
 		 83 aa  49.7  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.0015395  normal  0.323981 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0486  protein of unknown function DUF397  49.06 
 
 		 63 aa  49.7  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0235  hypothetical protein  46.15 
 
 		 77 aa  49.7  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0513  hypothetical protein  52.83 
 
 		 62 aa  49.3  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.47229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1745  hypothetical protein  50.88 
 
 		 64 aa  48.9  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.64493  normal  0.800474 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1159  hypothetical protein  50 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0339608  unclonable  0.0000000343885 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3236  hypothetical protein  46.97 
 
 		 63 aa  48.9  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1834  protein of unknown function DUF397  47.17 
 
 		 59 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2071  hypothetical protein  45.45 
 
 		 67 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.392038  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0599  hypothetical protein  54.9 
 
 		 69 aa  48.5  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2969  hypothetical protein  56.25 
 
 		 68 aa  48.9  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000849623 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0441  protein of unknown function DUF397  57.89 
 
 		 63 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0108  protein of unknown function DUF397  48 
 
 		 61 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0487  protein of unknown function DUF397  51.02 
 
 		 63 aa  48.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8369  hypothetical protein  50.88 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1230  protein of unknown function DUF397  46 
 
 		 64 aa  47.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0779142  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1413  protein of unknown function DUF397  43.14 
 
 		 66 aa  47.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194771  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0973  hypothetical protein  53.19 
 
 		 64 aa  47.8  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2128  hypothetical protein  45.9 
 
 		 62 aa  47.4  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4454  protein of unknown function DUF397  46.43 
 
 		 69 aa  47  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1781  hypothetical protein  50.98 
 
 		 69 aa  47  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0673  protein of unknown function DUF397  50 
 
 		 62 aa  47  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0262  hypothetical protein  44.9 
 
 		 62 aa  46.6  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0708  hypothetical protein  52.08 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0972  hypothetical protein  49.02 
 
 		 61 aa  46.6  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2266  hypothetical protein  50.82 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0142951  hitchhiker  0.00561226 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0643  hypothetical protein  54 
 
 		 61 aa  46.6  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1728  hypothetical protein  50.88 
 
 		 78 aa  47  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0749322  hitchhiker  0.00877773 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4088  protein of unknown function DUF397  42 
 
 		 57 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0993  hypothetical protein  48.98 
 
 		 67 aa  45.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6649  hypothetical protein  42.86 
 
 		 79 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.476212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5679  protein of unknown function DUF397  37.5 
 
 		 63 aa  46.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0037  hypothetical protein  43.75 
 
 		 69 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0567  protein of unknown function DUF397  37.5 
 
 		 95 aa  45.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6018  protein of unknown function DUF397  36.21 
 
 		 89 aa  45.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.260789  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1445  protein of unknown function DUF397  44.44 
 
 		 64 aa  45.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.12043  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3657  hypothetical protein  44.26 
 
 		 62 aa  45.1  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1943  protein of unknown function DUF397  48.94 
 
 		 55 aa  44.7  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5037  protein of unknown function DUF397  40.85 
 
 		 73 aa  44.7  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1269  hypothetical protein  44.07 
 
 		 66 aa  44.7  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2090  hypothetical protein  46.15 
 
 		 79 aa  44.3  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.161003  normal  0.0235666 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2231  hypothetical protein  46.15 
 
 		 79 aa  44.7  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0143015  normal  0.145093 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4087  protein of unknown function DUF397  44.68 
 
 		 60 aa  44.3  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4235  hypothetical protein  50 
 
 		 62 aa  43.9  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0397  hypothetical protein  50.94 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1161  protein of unknown function DUF397  41.18 
 
 		 62 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.653899  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5736  hypothetical protein  40 
 
 		 80 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.534328 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1767  hypothetical protein  43.14 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3476  hypothetical protein  51.35 
 
 		 72 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1432  hypothetical protein  42.62 
 
 		 62 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353493  hitchhiker  0.000418088 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2601  hypothetical protein  52.08 
 
 		 62 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0203178  normal  0.0405865 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4869  hypothetical protein  46.94 
 
 		 60 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.277477  normal  0.940812 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2127  protein of unknown function DUF397  35.82 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000239677  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4272  protein of unknown function DUF397  39.68 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4784  protein of unknown function DUF397  43.14 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2448  hypothetical protein  52.08 
 
 		 62 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.14038  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3856  hypothetical protein  51.35 
 
 		 72 aa  42  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0413  protein of unknown function DUF397  41.82 
 
 		 68 aa  41.6  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0175926  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0716  protein of unknown function DUF397  43.14 
 
 		 65 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1943  protein of unknown function DUF397  43.1 
 
 		 63 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00825556  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3009  hypothetical protein  44.62 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6122  protein of unknown function DUF397  46.15 
 
 		 61 aa  41.2  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.464343  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37900  protein of unknown function (DUF397)  35.38 
 
 		 82 aa  41.2  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4781  protein of unknown function DUF397  38.6 
 
 		 64 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1969  protein of unknown function DUF397  43.14 
 
 		 76 aa  40.8  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00185784  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2689  protein of unknown function DUF397  39.58 
 
 		 63 aa  40.8  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00137319  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4088  hypothetical protein  41.82 
 
 		 57 aa  40.8  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2128  protein of unknown function DUF397  47.37 
 
 		 64 aa  40.4  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.996693  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4682  protein of unknown function DUF397  38.6 
 
 		 63 aa  40.8  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1627  protein of unknown function DUF397  48.94 
 
 		 59 aa  40.4  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4579  protein of unknown function DUF397  38.89 
 
 		 70 aa  40.4  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5628  hypothetical protein  40 
 
 		 78 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.524184 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>