44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2128 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2128  protein of unknown function DUF397  100 
 
 		 64 aa  132  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.996693  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1588  hypothetical protein  43.08 
 
 		 71 aa  54.7  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1548  hypothetical protein  43.08 
 
 		 71 aa  54.7  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0220305  normal  0.0244583 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1295  hypothetical protein  41.94 
 
 		 78 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.471559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7828  hypothetical protein  39.34 
 
 		 69 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12060  protein of unknown function (DUF397)  46 
 
 		 65 aa  50.8  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12020  protein of unknown function (DUF397)  43.86 
 
 		 65 aa  50.8  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2703  hypothetical protein  40.98 
 
 		 67 aa  50.4  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20610  protein of unknown function (DUF397)  34.38 
 
 		 64 aa  49.7  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.069741  normal  0.682793 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3763  protein of unknown function DUF397  45.1 
 
 		 83 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0567  protein of unknown function DUF397  42.86 
 
 		 95 aa  49.7  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3445  hypothetical protein  37.1 
 
 		 78 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3476  hypothetical protein  45.65 
 
 		 72 aa  48.5  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2305  putative regulator  36.84 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3856  hypothetical protein  45.65 
 
 		 72 aa  47.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0521  protein of unknown function DUF397  37.1 
 
 		 77 aa  47.8  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6482  hypothetical protein  34.67 
 
 		 76 aa  47.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.435568 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1969  protein of unknown function DUF397  38.6 
 
 		 76 aa  47.4  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00185784  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2090  hypothetical protein  41.38 
 
 		 79 aa  47.4  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.161003  normal  0.0235666 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1596  hypothetical protein  46.3 
 
 		 66 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2231  hypothetical protein  39.66 
 
 		 79 aa  45.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0143015  normal  0.145093 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4695  protein of unknown function DUF397  36.21 
 
 		 127 aa  45.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0266  protein of unknown function DUF397  34.48 
 
 		 69 aa  45.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.687438  normal  0.998664 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1230  protein of unknown function DUF397  36.21 
 
 		 64 aa  45.1  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0779142  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8470  protein of unknown function DUF397  45.1 
 
 		 92 aa  44.3  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36640  protein of unknown function (DUF397)  42.86 
 
 		 83 aa  44.3  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.0015395  normal  0.323981 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1329  hypothetical protein  36.67 
 
 		 68 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20560  protein of unknown function (DUF397)  43.48 
 
 		 66 aa  44.3  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2513  hypothetical protein  34.48 
 
 		 78 aa  43.9  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6649  hypothetical protein  37.31 
 
 		 79 aa  43.5  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.476212  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1230  hypothetical protein  37.1 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.375294 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24730  protein of unknown function (DUF397)  31.03 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0228  hypothetical protein  40.43 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0876  protein of unknown function DUF397  30.65 
 
 		 80 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0037  hypothetical protein  43.75 
 
 		 69 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1781  hypothetical protein  37.31 
 
 		 69 aa  42  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14270  protein of unknown function (DUF397)  32.84 
 
 		 66 aa  42  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.784152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7763  hypothetical protein  41.51 
 
 		 68 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0235  hypothetical protein  34.92 
 
 		 77 aa  41.6  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1767  hypothetical protein  41.46 
 
 		 127 aa  40.8  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3649  protein of unknown function DUF397  47.37 
 
 		 75 aa  40.4  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.375701  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0993  hypothetical protein  32.76 
 
 		 67 aa  40.8  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0716  protein of unknown function DUF397  26.32 
 
 		 65 aa  40.4  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37900  protein of unknown function (DUF397)  38.3 
 
 		 82 aa  40.4  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.241771 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>